ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง ITS1 และ ITS2 คือ ITS1 เป็น DNA ตัวแบ่งที่อยู่ระหว่างยีน 18S และ 5.8S rRNA ในยูคาริโอต ในขณะที่ ITS2 เป็น DNA ตัวเว้นวรรคที่อยู่ระหว่างยีน rRNA 5.8S และ 28S ในยูคาริโอต
Internal transcribed spacer (ITS) คือ DNA ตัวเว้นวรรคที่มักจะอยู่ระหว่าง subunit ribosomal RNA ขนาดเล็กและ subunit ribosomal RNA ขนาดใหญ่ในโครโมโซมหรือในบริเวณที่คัดลอกมาที่สอดคล้องกันใน polycistronic rRNA precursor transcript molecule ในแบคทีเรียและอาร์เคีย มีเพียง ITS เดียวระหว่างยีน 16S และ 23S rRNA แต่ในยูคาริโอต มี ITS spacer DNA สองแห่ง: ITS1 (ระหว่าง 18S และ 5)ยีน 8S rRNA) และ ITS2 (ระหว่าง 5.8S และ 28S rRNA) ดังนั้น ITS1 และ ITS2 จึงเป็น DNA spacer สองตัวที่พบในระหว่างยีน rRNA ในยูคาริโอต
ITS1 คืออะไร
ITS1 เป็น DNA ตัวเว้นวรรคที่อยู่ระหว่างยีน 18S และ 5.8S rRNA ในยูคาริโอต ITS หมายถึงชิ้นส่วนของ DNA spacer ที่ไม่ทำงานซึ่งอยู่ระหว่างยีน rRNA ITS1 มีความยาวผันแปรมากกว่า ITS2 ความแปรผันของความยาวของ ITS1 อยู่ที่ประมาณ (200-300bp) เครื่องหมาย ITS เช่น ITS1 ได้พิสูจน์ประสิทธิภาพในการอธิบายความสัมพันธ์สายวิวัฒนาการระหว่างแท็กซ่าต่างๆ นอกจากนี้ ITS1 spacer DNA ยังถูกอนุรักษ์น้อยกว่า ITS2 spacer DNA โครงสร้าง ITS1 ได้รับการอนุรักษ์ในหน่วยอนุกรมวิธานที่เล็กกว่ามากเท่านั้น คลัสเตอร์ไรโบโซมของยูคาริโอตแต่ละคลัสเตอร์ยังมีบริเวณที่เรียกว่าตัวเว้นวรรคการถอดเสียงภายนอก (5 'และ 3' ETS)
รูปที่ 01: ภูมิภาค ITS1
DNA spacer ของ ITS1 นั้นอยู่ใกล้กับตัวเว้นวรรคที่ถอดเสียง 5'ภายนอก (5' ETS) มาก นอกจากนี้ หากใครต้องการขยายขอบเขต ITS1 สำหรับการศึกษาความสัมพันธ์สายวิวัฒนาการ พวกเขาต้องใช้ไพรเมอร์คู่เฉพาะ (ไพรเมอร์ย้อนกลับและไปข้างหน้า) เพื่อจุดประสงค์นี้ ในการขยายขอบเขต ITS1 โดยปกติชุดไพรเมอร์สองชุดจะใช้ในโปรโตคอล PCR ของห้องปฏิบัติการ พวกมันคือ ITS1 ไปข้างหน้าและ ITS2 ย้อนกลับหรือ ITS1 ไปข้างหน้าและ ITS4 ย้อนกลับ
ITS2 คืออะไร
ITS2 เป็น DNA ตัวเว้นวรรคที่อยู่ระหว่างยีน rRNA 5.8S และ 28S ในยูคาริโอต ภูมิภาค ITS2 มีความยาวแปรผันที่สั้นกว่าภูมิภาค ITS1 รูปแบบความยาวของ ITS2 อยู่ที่ประมาณ (180-240bp) อย่างไรก็ตาม ภูมิภาค ITS2 มีการอนุรักษ์มากกว่าภูมิภาค ITS1 ในหลายหน่วยอนุกรมวิธาน ระบุว่าลำดับ ITS2 ทั้งหมดมีแกนกลางร่วมกันของโครงสร้างรอง ยิ่งไปกว่านั้น 40% ของภูมิภาค ITS2 นั้นได้รับการอนุรักษ์ไว้ในบรรดาพืชพันธุ์อื่น ในขณะที่สามารถจัดตำแหน่ง 50% ของภูมิภาค ITS2 ในครอบครัวและในระดับที่สูงกว่าได้
รูปที่ 02: ภูมิภาค ITS2
โดยไม่คำนึงถึงขอบเขตของการอนุรักษ์ การใช้ภูมิภาค ITS2 ก็เป็นที่นิยมเช่นกัน เช่น ภูมิภาค ITS1 ในการศึกษาความสัมพันธ์ทางสายวิวัฒนาการ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในบาร์โค้ด DNA ของเชื้อรา ในการขยายขอบเขต ITS2 โดยทั่วไปจะใช้ชุดไพรเมอร์เฉพาะในโปรโตคอล PCR ของห้องปฏิบัติการ นั่นคือ ITS1 ไปข้างหน้าและ ITS4 ย้อนกลับ แต่เมื่อโปรโตคอล PCR ใช้ชุดไพรเมอร์นี้ มันจะขยายขอบเขต ITS1 ร่วมกับภูมิภาค ITS2 ด้วย นอกจากนี้ DNA spacer ของ ITS2 ยังอยู่ใกล้กับตัวเว้นวรรค 3’external transcribed spacer (3’ ETS)
ความเหมือนระหว่าง ITS1 กับ ITS2
- ITS1 และ ITS2 เป็น DNA ตัวเว้นวรรคสองตัวที่อยู่ระหว่างยีน rRNA
- มีอยู่ในยูคาริโอตเท่านั้น
- ขยายทั้งคู่ได้โดยใช้ไพรเมอร์คู่เฉพาะ
- พวกเขาทั้งคู่ถูกตัดออกในการสุกของ rRNA เป็นผลพลอยได้ที่ไม่ได้ทำงาน
- ทั้งสองมีความสำคัญมากสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์สายวิวัฒนาการ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในบาร์โค้ด DNA ของเชื้อรา
ความแตกต่างระหว่าง ITS1 และ ITS2
ITS1 เป็น DNA ตัวแบ่งระหว่างยีน 18S และ 5.8S rRNA ในยูคาริโอต ในขณะที่ ITS2 เป็น DNA ตัวแบ่งที่อยู่ระหว่างยีน rRNA 5.8S และ 28S ในยูคาริโอต นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง ITS1 และ ITS2 นอกจากนี้ ITS1 ยังมีความแปรผันของความยาวมากกว่าเมื่อเทียบกับ ITS2 ในทางกลับกัน ITS2 มีความยาวผันแปรที่สั้นกว่าเมื่อเทียบกับ ITS1 นี่เป็นข้อแตกต่างระหว่าง ITS1 และ ITS2
อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงความแตกต่างระหว่าง ITS1 และ ITS2 ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – ITS1 vs ITS2
Internal transcribed region (ITS) คือ DNA ตัวเว้นวรรคที่ไม่ทำงานซึ่งอยู่ระหว่างยีน rRNA ในแบคทีเรียและอาร์เคีย มีเพียงภูมิภาค ITS เดียวเท่านั้นแต่ในยูคาริโอต มี ITS สองภูมิภาค: ITS1 และ ITS2 ITS1 เป็น DNA ตัวแบ่งที่อยู่ระหว่างยีน 18S และ 5.8S rRNA ในยูคาริโอต ในขณะที่ ITS2 เป็น DNA ตัวเว้นวรรคที่อยู่ระหว่างยีน rRNA 5.8S และ 28S ในยูคาริโอต ดังนั้น นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่าง ITS1 และ ITS2
