ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างความคล้ายคลึงและเอกลักษณ์ในการจัดแนวลำดับคือความคล้ายคลึงกันคือความคล้ายคลึงกัน (ความคล้ายคลึงกัน) ระหว่างสองลำดับในการเปรียบเทียบ ในขณะที่เอกลักษณ์คือจำนวนอักขระที่ตรงกันระหว่างสองลำดับที่ต่างกัน
ชีวสารสนเทศศาสตร์เป็นสาขาวิชาสหวิทยาการที่เกี่ยวข้องกับอณูชีววิทยาและพันธุศาสตร์เป็นหลัก วิทยาการคอมพิวเตอร์ คณิตศาสตร์ และสถิติ การจัดลำดับเป็นคำสำคัญในชีวสารสนเทศ เป็นขั้นตอนที่ลำดับของ DNA, RNA หรือโปรตีนถูกจัดเรียงเพื่อระบุบริเวณที่มีความคล้ายคลึงกันซึ่งเป็นผลมาจากความสัมพันธ์เชิงหน้าที่โครงสร้างหรือวิวัฒนาการระหว่างลำดับในตอนท้ายของการจัดตำแหน่ง พวกเขาจะถูกนำเสนอเป็นแถวภายในเมทริกซ์ ในการจัดเรียงอักขระที่เหมือนกันในคอลัมน์ที่ต่อเนื่องกัน มีการแทรกช่องว่างระหว่างส่วนที่เหลือ
ความเหมือนคืออะไร
ความคล้ายคลึงในการจัดแนวลำดับคือความคล้ายคลึงระหว่างสองลำดับเมื่อเปรียบเทียบ ข้อเท็จจริงนี้ขึ้นอยู่กับเอกลักษณ์ของลำดับ ความคล้ายคลึงกันแสดงให้เห็นขอบเขตที่เรซิดิวอยู่ในแนวเดียวกัน ดังนั้น ลำดับที่คล้ายคลึงกันจึงมีคุณสมบัติที่คล้ายคลึงกัน ในชีวสารสนเทศ ความคล้ายคลึงเป็นเครื่องมือในการประเมินความคล้ายคลึงระหว่างโปรตีนสองชนิด
รูปที่ 01: ความคล้ายคลึงกันในการจัดแนวลำดับ
มีสองขั้นตอนหลักในการจัดลำดับกระบวนการ ขั้นตอนแรกคือการจัดตำแหน่งแบบคู่ ซึ่งช่วยในการค้นหาการจัดตำแหน่งที่เหมาะสมที่สุดระหว่างสองลำดับ (รวมถึงช่องว่าง) โดยใช้อัลกอริทึม เช่น BLAST, FastA และ LALIGNอัลกอริธึมการจับคู่จะค้นหาจำนวนการดำเนินการแก้ไขขั้นต่ำ in-dels และการแทนที่เพื่อจัดแนวลำดับหนึ่งไปยังลำดับอื่น หลังจากการจัดตำแหน่งแบบคู่แล้ว จำเป็นต้องได้รับพารามิเตอร์เชิงปริมาณสองตัวจากการเปรียบเทียบแบบคู่แต่ละค่า มันคือตัวตนและความคล้ายคลึงกัน
เอกลักษณ์คืออะไร
เอกลักษณ์ในการจัดลำดับคือจำนวนอักขระที่ตรงกันระหว่างสองลำดับที่ต่างกัน ดังนั้น ช่องว่างจะไม่ถูกนับเมื่อทำการประเมินตัวตน การวัดจะถือว่าสัมพันธ์กับลำดับที่สั้นกว่าระหว่างสองลำดับ มันบอกเป็นนัยสำคัญว่ามันมีผลกระทบที่เอกลักษณ์ของลำดับไม่เป็นสกรรมกริยา ถ้า X=Y และ Y=Z แล้ว X ไม่จำเป็นต้องเท่ากับ Z ซึ่งถูกอนุมานในแง่ของการวัดระยะทางเอกลักษณ์
รูปที่ 02: เอกลักษณ์ในการจัดลำดับ
ตัวอย่างเช่น X มีลำดับของ AAGGCTT Y มีลำดับของ AAGGC และ Z มีลำดับของ AAGGCAT เอกลักษณ์ระหว่าง X และ Y คือ 100% {5 นิวคลีโอไทด์ที่เหมือนกัน / นาที[ความยาว(X), ความยาว(Y)]} อัตลักษณ์ระหว่าง Y และ Z ก็เท่ากับ 100% แต่อัตลักษณ์ระหว่าง X และ Z มีเพียง 85% {(6 นิวคลีโอไทด์ที่เหมือนกัน / 7)}.
ความคล้ายคลึงกันระหว่างความเหมือนและเอกลักษณ์ในการจัดแนวลำดับคืออะไร
- ทั้งความเหมือนและเอกลักษณ์เป็นคำสองคำที่เราใช้เรียงตามลำดับ
- ยังหมายถึงความคล้ายคลึงระหว่างสองซีเควนซ์
- นอกจากนี้ เราแสดงเป็นค่าเปอร์เซ็นต์
ความแตกต่างระหว่างความเหมือนและเอกลักษณ์ในการจัดแนวลำดับคืออะไร
ความคล้ายคลึงในการจัดแนวบอกความคล้ายคลึงระหว่างสองลำดับเมื่อเปรียบเทียบ ในขณะที่เอกลักษณ์ในการจัดตำแหน่งลำดับจะบอกถึงจำนวนอักขระที่ตรงกันระหว่างสองลำดับที่ต่างกันดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างความเหมือนและเอกลักษณ์ในการจัดลำดับ
สรุป – ความคล้ายคลึงกับตัวตนในการจัดแนวลำดับ
การจัดตำแหน่งตามลำดับช่วยในการระบุบริเวณที่มีความคล้ายคลึงกันใน DNA, RNA หรือโปรตีนที่เกิดจากความสัมพันธ์เชิงหน้าที่ โครงสร้าง หรือวิวัฒนาการระหว่างลำดับ ดังนั้น ความคล้ายคลึงและเอกลักษณ์จึงเป็นคำสำคัญสองคำในบริบทของการจัดตำแหน่งลำดับ ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างคำสองคำนี้คือ ความคล้ายคลึงกันคือความคล้ายคลึงระหว่างสองลำดับในการเปรียบเทียบ ในขณะที่เอกลักษณ์คือจำนวนอักขระที่ตรงกันระหว่างสองลำดับที่ต่างกัน ดังนั้น นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่างความเหมือนและเอกลักษณ์ในการจัดตำแหน่งลำดับ