ความแตกต่างระหว่าง VNTR และ STR

2024 ผู้เขียน: Alex Aldridge | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2023-12-17 13:51

ความแตกต่างที่สำคัญ – VNTR กับ STR

การศึกษาดีเอ็นเอมีประโยชน์อย่างมากในการทำความเข้าใจและกำหนดความสัมพันธ์ทางสายวิวัฒนาการ การวินิจฉัยโรคทางพันธุกรรม และการทำแผนที่จีโนมของสิ่งมีชีวิต มีการใช้เทคนิคหลายอย่างที่เกี่ยวข้องกับการวิเคราะห์ดีเอ็นเอเพื่อระบุยีนเฉพาะหรือลำดับดีเอ็นเอในกลุ่มดีเอ็นเอที่ไม่รู้จัก พวกเขาเป็นที่รู้จักในฐานะเครื่องหมายทางพันธุกรรม เครื่องหมายทางพันธุกรรมใช้ในอณูชีววิทยาเพื่อระบุความแปรปรวนทางพันธุกรรมระหว่างบุคคลและสปีชีส์ ตัวแปรเลขตีคู่ซ้ำ (VNTR) และการเกิดซ้ำแบบสั้น (STR) เป็นเครื่องหมายทางพันธุกรรมสองประเภทที่แสดงความแตกต่างระหว่างบุคคล ทั้งสองประเภทเป็น DNA ที่ทำซ้ำแบบไม่เข้ารหัสซึ่งเป็นการทำซ้ำแบบตีคู่พวกมันถูกจัดเรียงแบบหัวต่อท้ายในโครโมโซม VNTR เป็นส่วนของจีโนมที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์สั้นซ้ำหลายครั้ง STR เป็นอีกส่วนหนึ่งของ DNA ภายในจีโนมซึ่งจัดเป็นหน่วยที่ทำซ้ำซึ่งประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์สองถึงสิบสามตัวในร้อยครั้ง ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง VNTR และ STR คือจำนวนของนิวคลีโอไทด์ในลำดับที่เกิดซ้ำ หน่วยการทำซ้ำของ VNTR ประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 10 ถึง 100 ในขณะที่หน่วยการทำซ้ำของ STR ประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 2 ถึง 13 VNTR และ STR ใช้กันอย่างแพร่หลายในการศึกษาทางนิติเวช

VNTR คืออะไร

การทำซ้ำตามลำดับคือลำดับดีเอ็นเอสั้นๆ ที่ทำซ้ำแบบตัวต่อตัวที่ตำแหน่งของโครโมโซมเฉพาะ ไม่มีลำดับหรือนิวคลีโอไทด์อื่นภายในการทำซ้ำแบบตีคู่ มีหลายประเภทของการซ้ำซ้อนในจีโนม VNTR เป็นประเภทของการทำซ้ำแบบตีคู่ซึ่งมีหน่วยการทำซ้ำซึ่งประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 10 ถึง 100 VNTR เป็นประเภทของดาวเทียมขนาดเล็ก การซ้ำซ้อนเหล่านี้สามารถพบได้ในโครโมโซมจำนวนมากพวกมันกระจายอยู่ในจีโนมมนุษย์และส่วนใหญ่อยู่ในบริเวณซับเทโลเมอร์ของโครโมโซม

VNTR แสดงความแตกต่างซ้ำซ้อนระหว่างบุคคล ความยาวของ VNTR ในตำแหน่งเฉพาะของโครโมโซมนั้นแตกต่างกันอย่างมากในแต่ละบุคคล เนื่องจากความแปรผันของจำนวนหน่วยที่เกิดซ้ำซึ่งจัดอยู่ในส่วน DNA นั้น ดังนั้น VNTR จึงสามารถใช้เป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในการระบุตัวบุคคล และการวิเคราะห์ VNTR ถูกนำมาใช้ในหลายสาขา เช่น พันธุศาสตร์ การวิจัยทางชีววิทยา นิติเวช และการพิมพ์ลายนิ้วมือด้วยดีเอ็นเอ VNTRs เป็นตัวบ่งชี้ทางพันธุกรรมตัวแรกที่ใช้ในการวัดปริมาณการปลูกถ่ายไขกระดูก VNTR ยังเป็นเครื่องหมาย polymorphic ตัวแรกที่ใช้ในการทำโปรไฟล์ DNA ในด้านนิติเวช

รูปที่ 01: รูปแบบของ VNTR ในหกบุคคล

การวิเคราะห์ VNTR ดำเนินการผ่านความแตกต่างของความยาวแฟรกเมนต์ที่จำกัด ตามด้วยการผสมพันธุ์ทางใต้ ดังนั้นจึงต้องการตัวอย่าง DNA ที่ค่อนข้างใหญ่ การตีความโปรไฟล์ VNTR ก็มีปัญหาเช่นกัน เนื่องจากข้อจำกัดเหล่านี้ การใช้ VNTR ในพันธุศาสตร์ทางนิติวิทยาศาสตร์จึงถูกจำกัด และถูกแทนที่ด้วยการวิเคราะห์ STR

STR คืออะไร

STR เป็นส่วน DNA ที่มีการทำซ้ำสูงซึ่งประกอบด้วยหน่วยทำซ้ำนิวคลีโอไทด์สองถึงสิบสามหน่วยที่จัดในลักษณะตีคู่ STR นั้นคล้ายกับ VNTR แต่มันแตกต่างจาก VNTR จากจำนวนของนิวคลีโอไทด์ในลำดับการทำซ้ำและจำนวนการทำซ้ำ STR เป็นไมโครแซทเทิลไลท์ประเภทหนึ่ง

การวิเคราะห์ STR เกี่ยวข้องกับการวัดจำนวนหน่วยที่ทำซ้ำที่แน่นอน STR มีความแตกต่างกันอย่างมากในแต่ละบุคคล คล้ายกับ VNT โปรไฟล์ STR แตกต่างกันไปในแต่ละบุคคล ดังนั้น การวิเคราะห์ STR จึงถูกใช้ในอณูชีววิทยาเพื่อเปรียบเทียบตำแหน่งจำเพาะบน DNA จากตัวอย่างสองตัวอย่างขึ้นไป ดังนั้น STR จึงถือเป็นตัวบ่งชี้ทางพันธุกรรมที่ทรงพลังในอณูชีววิทยาเป็นเครื่องมือที่ยอดเยี่ยมสำหรับการระบุตัวบุคคลเนื่องจากมีความหลากหลายในระดับสูงและมีความยาวค่อนข้างสั้น

ปัจจุบัน STR เป็นเครื่องมือพหุสัณฐานทางพันธุกรรมที่ใช้บ่อยที่สุดในการวิเคราะห์ทางพันธุศาสตร์ กรณีศึกษาทางนิติวิทยาศาสตร์ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับการวิเคราะห์ STR polymorphic STR loci กระจายไปทั่วจีโนม มี STR นับพันอยู่ในโครโมโซมซึ่งสามารถใช้ในการวิเคราะห์ทางนิติเวชได้ การวิเคราะห์ STR ไม่เกี่ยวข้องกับความหลากหลายทางความยาวที่จำกัด เช่น การวิเคราะห์ VNTR การวิเคราะห์ STR ไม่ได้ตัด DNA ด้วยเอนไซม์จำกัด ใช้โพรบเฉพาะเพื่อยึดบริเวณที่ต้องการบน DNA และใช้เทคนิค PCR กำหนดความยาวของ STR

รูปที่ 02: ความผันแปรของ STR ระหว่างกลุ่มตัวอย่าง

ความคล้ายคลึงกันระหว่าง VNTR และ STR คืออะไร

VNTR และ STR เป็น DNA ที่ไม่เข้ารหัส
ซ้ำกันทั้งคู่
ทั้งสองแสดงความแตกต่างระหว่างบุคคลเนื่องจากความแตกต่างในความยาวของส่วนดีเอ็นเอ
ทั้งสองถูกใช้เป็นเครื่องบ่งชี้พันธุกรรมที่มีประสิทธิภาพในการพิมพ์ลายนิ้วมือ DNA และในการศึกษาทางนิติเวช

VNTR กับ STR ต่างกันอย่างไร

VNTR กับ STR
VNTR เป็น DNA ที่ทำซ้ำแบบไม่เข้ารหัสซึ่งมีลำดับนิวคลีโอไทด์สั้นที่ทำซ้ำในลักษณะตีคู่	STR เป็นส่วน DNA ที่มีการทำซ้ำสูงซึ่งประกอบด้วยหน่วยทำซ้ำนิวคลีโอไทด์สองถึงสิบสามหน่วยที่จัดในลักษณะควบคู่
ขนาด
VNTR มีขนาดใหญ่กว่า STR	STR เล็กกว่า VNTR
จำนวนนิวคลีโอไทด์ในลำดับการทำซ้ำ
หน่วยที่เกิดซ้ำของ VNTR ประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 10 ถึง 100 ตัว	หน่วยที่เกิดซ้ำของ STR ประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 2 ถึง 13 ตัว

สรุป – VNTR กับ STR

VNTR และ STR เป็นเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่ทรงพลังสองตัวที่ใช้ในอณูชีววิทยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในด้านพันธุศาสตร์ทางนิติวิทยาศาสตร์ VNTR เป็นดาวเทียมขนาดเล็กประเภทหนึ่ง และ STR เป็นดาวเทียมขนาดเล็ก VNTR และ STR นั้นไม่มีการเข้ารหัส DNA ที่มีการทำซ้ำสูง เป็นการตีคู่ซ้ำ โครงสร้างทั่วไปของ VNTR และ STR เหมือนกัน อย่างไรก็ตาม จำนวนนิวคลีโอไทด์ในลำดับการทำซ้ำและความยาวต่างกัน VNTR มีลำดับการทำซ้ำประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 10 ถึง 100 STR มีลำดับการทำซ้ำซึ่งประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 2 ถึง 13 ตัว นี่คือความแตกต่างระหว่าง VNTR และ STR