เปปไทด์กับโปรตีน
กรดอะมิโน เปปไทด์ และโปรตีนมักถูกเรียกว่าเป็นคำที่เกี่ยวข้อง แต่มีลักษณะที่แตกต่างกัน กรดอะมิโนเป็นส่วนประกอบสำคัญของเปปไทด์และโปรตีน กรดอะมิโนเป็นโมเลกุลขนาดเล็กที่มีหมู่อะมิโน (-NH2) และหมู่กรดคาร์บอกซิลิก (-COOH) ซึ่งจับกับอะตอมของคาร์บอนกลาง โดยมีไฮโดรเจนเพิ่มเติมและ ห่วงโซ่ด้านข้าง (กลุ่ม R) โซ่ข้างนี้แตกต่างกันไปตามกรดอะมิโนทั้งหมด ดังนั้นจึงกำหนดลักษณะเฉพาะและเคมีของกรดอะมิโนแต่ละชนิด ลำดับยีนเฉพาะใช้เพื่อกำหนดลำดับกรดอะมิโนทั้งในเปปไทด์และโปรตีน
เปปไทด์
เปปไทด์ประกอบด้วยกรดอะมิโนตั้งแต่สองตัวขึ้นไป เชื่อมโยงกันด้วยพันธะเปปไทด์และมีอยู่ในรูปของสายโซ่เชิงเส้น ความยาวของเปปไทด์ถูกกำหนดโดยปริมาณของกรดอะมิโนในนั้น โดยปกติความยาวของเปปไทด์จะน้อยกว่ากรดอะมิโนประมาณ 100 ตัว
คำนำหน้าใช้เพื่ออธิบายประเภทของเปปไทด์ในคำศัพท์ทั่วไป ตัวอย่างเช่น เมื่อเปปไทด์ประกอบด้วยกรดอะมิโน 2 ตัว จะเรียกว่าไดเปปไทด์ ในทำนองเดียวกัน กรดอะมิโน 3 ชนิดรวมกันเพื่อผลิตไตรเปปไทด์ กรดอะมิโน 4 ชนิดรวมกันเพื่อผลิตเตตระเปปไทด์ เป็นต้น นอกจากชนิดเหล่านี้แล้ว ยังมีโอลิโกเปปไทด์ (ประกอบด้วยกรดอะมิโน 2-20 ชนิด) และโพลีเปปไทด์ซึ่งมีเปปไทด์จำนวนมาก (น้อยกว่า เกิน 100) ลักษณะเฉพาะที่สำคัญที่สุดของเปปไทด์ถูกกำหนดโดยปริมาณและลำดับของกรดอะมิโน
หน้าที่หลักของเปปไทด์ส่วนใหญ่คือช่วยให้สื่อสารได้อย่างมีประสิทธิภาพโดยนำข้อความทางชีวเคมีจากที่หนึ่งไปยังอีกที่หนึ่งในร่างกาย
โปรตีน
โปรตีนเป็นกลุ่มโมเลกุลทางชีววิทยาที่มีความหลากหลายมากที่สุด โปรตีนประกอบด้วยสายโซ่ยาวหนึ่งสายหรือมากกว่าที่เรียกว่าพอลิเปปไทด์ แต่องค์ประกอบพื้นฐานของโปรตีนก็คือกรดอะมิโน ลำดับของกรดอะมิโนกำหนดลักษณะสำคัญของโปรตีน ในขณะที่ลำดับกรดอะมิโนนี้ถูกกำหนดโดยลำดับยีนเฉพาะ
โดยปกติโปรตีนจะมีโครงสร้างสามมิติที่เสถียร โครงสร้างเหล่านี้สามารถอภิปรายในแง่ของลำดับชั้นของสี่ระดับ; ประถมศึกษา มัธยมศึกษา อุดมศึกษา และควอเทอร์นารี โครงสร้างหลักคือลำดับกรดอะมิโนของโปรตีน โครงสร้างทุติยภูมิเกิดจากการสร้างพันธะไฮโดรเจนระหว่างกรดอะมิโน 2 ตัวที่อยู่ใกล้เคียง ทำให้เกิดโครงสร้างที่เรียกว่าแผ่นเคลือบ β และขดลวดเรียกว่า α-เฮลิซ จากนั้นบริเวณของโครงสร้างทุติยภูมิจะถูกพับเพิ่มเติมในช่องว่างเพื่อสร้างโครงสร้างสามมิติสุดท้ายของโปรตีน การจัดเรียงตัวของโพลีเปปไทด์หลายตัวในอวกาศส่งผลให้เกิดโครงสร้างควอเทอร์นารีของโปรตีน
หน้าที่หลักของโปรตีนคือการเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์ การป้องกัน การขนส่ง การสนับสนุน การเคลื่อนไหว การควบคุม และการเก็บรักษา
เปปไทด์และโปรตีนต่างกันอย่างไร
• เปปไทด์คือสายโซ่สั้นของกรดอะมิโน ในขณะที่โปรตีนคือสายโซ่ของกรดอะมิโนที่ยาวมาก
• กรดอะมิโนหลายชนิดเชื่อมโยงกันเพื่อสร้างเปปไทด์โดยพันธะเปปไทด์ ในขณะที่เปปไทด์หลายตัวเชื่อมโยงกันเพื่อสร้างโมเลกุลโปรตีน
• โดยปกติ โปรตีนจะมีโครงสร้างสามมิติที่เสถียร ในทางตรงกันข้าม เปปไทด์ไม่ได้จัดอยู่ในโครงสร้างสามมิติที่เสถียร
• ความยาวของเปปไทด์น้อยกว่ากรดอะมิโนประมาณ 100 ตัว ในขณะที่โปรตีนมีกรดอะมิโนมากกว่า 100 ตัว (มีข้อยกเว้น ดังนั้น ความแตกต่างจะขึ้นอยู่กับหน้าที่ของโมเลกุลมากกว่าขนาด)
• ต่างจากเปปไทด์ โปรตีนถือเป็นโมเลกุลขนาดใหญ่
• ในเปปไทด์ สายข้างของกรดอะมิโนเท่านั้นที่สร้างพันธะไฮโดรเจน ในขณะที่ในโปรตีน ไม่เพียงแต่สายด้านข้างเท่านั้น แต่ยังรวมถึงกลุ่มเปปไทด์ด้วย ก่อให้เกิดพันธะไฮโดรเจน พันธะไฮโดรเจนเหล่านี้สามารถอยู่กับน้ำหรือกับกลุ่มเปปไทด์อื่นๆ
• เปปไทด์ทั้งหมดมีอยู่ในรูปของสายโซ่เชิงเส้น ในขณะที่โปรตีนสามารถมีอยู่ได้ในระดับปฐมภูมิ ทุติยภูมิ ตติยภูมิ และควอเทอร์นารี