ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง QTL และ GWAS ขึ้นอยู่กับประเภทของลำดับที่ใช้ในการวิเคราะห์ QTL ใช้ตำแหน่งยีนเชื่อมโยงเพื่อวิเคราะห์ลักษณะฟีโนไทป์ที่เกี่ยวข้องกับการถ่ายทอดทางพันธุกรรมในขณะที่ GWAS ใช้ลำดับจีโนมทั้งหมดเพื่อวิเคราะห์ความหลากหลายนิวคลีโอไทด์เดี่ยวของสภาวะเฉพาะ
แผนที่ QTL และ GWAS มีบทบาทสำคัญในการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมสำหรับลักษณะที่แตกต่างกัน นอกจากนี้ยังมีความสำคัญในการวิเคราะห์สภาวะของโรคต่างๆ โดยไม่ทราบสาเหตุ นอกจากนี้ การจัดลำดับมีบทบาทสำคัญในทั้งสองเทคนิค เทคนิคเหล่านี้สามารถใช้ร่วมกับเทคนิคปริมาณงานสูงอื่นๆ เพื่อเพิ่มความแม่นยำและความแม่นยำ
QTL คืออะไร
QTL ย่อมาจาก Quantitative Trait Locus เป็นบริเวณของ DNA ที่เกี่ยวข้องกับลักษณะฟีโนไทป์ โดยทั่วไป QTL ก่อให้เกิดผลกระทบจากโพลีจีนิก การกระจายของ QTL แตกต่างกันไป และจำนวนของ QTL บ่งบอกถึงระดับความแปรผันของลักษณะฟีโนไทป์เฉพาะ นอกจากนี้ โดยทั่วไปแล้ว พวกมันจะเขียนโค้ดสำหรับลักษณะต่อเนื่องที่อยู่ภายใต้และไม่ใช่ลักษณะที่ไม่ต่อเนื่อง
เมื่อระบุเขต QTL จำเป็นต้องจัดลำดับพื้นที่ QTL เฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ เพื่อให้การสืบสวนและการวิจัยง่ายขึ้น การจัดลำดับและการจัดเก็บข้อมูลลำดับของภูมิภาค QTL ทั่วไปจึงเกิดขึ้นพร้อมกับการมีส่วนร่วมของชีวสารสนเทศ เราเรียกเทคนิคนี้ว่าการทำแผนที่ QTL ต่อจากนั้น ฐานข้อมูลจะสร้างขึ้นด้วยลำดับภูมิภาค QTL
รูปที่ 01: QTL Scan
ยิ่งไปกว่านั้น แอปพลิเคชันของลำดับ QTL อาศัยเครื่องมือ BLAST เป็นหลัก ซึ่งสามารถกำหนดความคล้ายคลึงของลำดับได้ เป็นสิ่งสำคัญในการอนุมานความสัมพันธ์ระหว่างสิ่งมีชีวิต นอกจากนี้ มันเป็นสิ่งสำคัญในการกำหนดความซับซ้อนของฟีโนไทป์ของโพลีจีนิกโดยเฉพาะ นอกจากนี้ยังกำหนดวิวัฒนาการของลักษณะเฉพาะ
ในปัจจุบัน การวิเคราะห์ QTL ถูกรวมเข้ากับเทคนิคปริมาณงานสูงอื่นๆ เช่น DNA microarrays นี่เป็นสิ่งสำคัญในการวิเคราะห์การแสดงออกของฟีโนไทป์ ปัจจุบัน นักวิทยาศาสตร์สนใจที่จะพัฒนาฐานข้อมูล QTL เป็นอย่างมาก เนื่องจากภูมิภาคของ QTL มีหน้าที่รับผิดชอบลักษณะสำคัญหลายประการของสปีชีส์ต่างๆ
GWAS คืออะไร
GWAS ย่อมาจาก Genome Wide Association Study นอกจากนี้ยังหมายถึงการศึกษาความสัมพันธ์ของจีโนมทั้งหมด การศึกษาเหล่านี้เน้นการศึกษาเชิงสังเกตเป็นหลัก มันวิเคราะห์ความแปรปรวนทางพันธุกรรมของบุคคลต่าง ๆ ที่มักจะเกี่ยวข้องกับลักษณะเฉพาะ นอกจากนี้ จีโนมทั้งหมดมีความสำคัญต่อการวิเคราะห์ GWAS
รูปที่ 02: GWAS
GWAS เป็นเครื่องมือสำคัญในการวิเคราะห์ความหลากหลายนิวคลีโอไทด์เดี่ยวที่เกี่ยวข้องกับสภาวะโรคต่างๆ นี่เป็นการศึกษาเปรียบเทียบความแตกต่างของนิวคลีโอไทด์พหุสัณฐานที่ต่างกันในกลุ่มประชากรในวงกว้าง นอกจากนี้ ตัวอย่างการศึกษาของ GWAS ยังสูงมาก ดังนั้นจึงใช้รูปแบบของการศึกษาแบบภาคตัดขวางด้วย
นอกจากนี้ การศึกษา GWAS ครั้งแรกเกิดขึ้นเกี่ยวกับกล้ามเนื้อหัวใจตายและวิเคราะห์ยีนที่เกี่ยวข้องกับกล้ามเนื้อหัวใจตาย ปัจจุบัน GWAS มีบทบาทสำคัญในการกำหนดภูมิหลังทางพันธุกรรมของโรคที่ซับซ้อนโดยไม่ทราบสาเหตุ
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง QTL และ GWAS คืออะไร
- พวกเขาอาศัยข้อมูลลำดับดีเอ็นเอสำหรับการวิเคราะห์
- ทั้งสองมีความเกี่ยวข้องกับภูมิหลังทางพันธุกรรมของตัวละครต่างๆ
- ยิ่งไปกว่านั้น พวกเขาต้องการเครื่องมือชีวสารสนเทศเพื่ออนุมานและตีความผลลัพธ์
- เสร็จในประชากรจำนวนมาก
ความแตกต่างระหว่าง QTL และ GWAS คืออะไร
QTL วิเคราะห์ลักษณะฟีโนไทป์ที่เกี่ยวข้องกับการถ่ายทอดทางพันธุกรรมโดยใช้ตำแหน่งของยีนที่เชื่อมโยง ในขณะที่ GWAS วิเคราะห์ความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ของสภาวะเฉพาะโดยใช้ลำดับจีโนมทั้งหมด ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง QTL และ GWAS การทำแผนที่ QTL เป็นเทคนิคที่ค่อนข้างซับซ้อนน้อยกว่า GWAS เนื่องจากต้องใช้การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด
อินโฟกราฟิกด้านล่างสรุปความแตกต่างระหว่าง QTL และ GWAS ในรูปแบบตาราง
สรุป – QTL กับ GWAS
การทำแผนที่ QTL และ GWAS มีบทบาทสำคัญในการกำหนดภูมิหลังทางพันธุกรรมของลักษณะฟีโนไทป์ต่างๆ พวกเขายังช่วยในการวิเคราะห์ภูมิหลังทางพันธุกรรมของโรคต่างๆ การทำแผนที่ QTL จะจับคู่ยีนเชื่อมโยงที่รับผิดชอบต่อลักษณะต่อเนื่อง และยังเกี่ยวข้องกับการทำแผนที่ยีนการถ่ายทอดทางพันธุกรรม ในทางกลับกัน GWAS เกิดขึ้นพร้อมกับการวิเคราะห์จีโนมทั้งหมดสำหรับความหลากหลายทางนิวคลีโอไทด์เดี่ยว นอกจากนี้ สิ่งนี้เกิดขึ้นในประชากรจำนวนมากขึ้น ดังนั้น นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่าง QTL และ GWAS
