ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างการเทียบท่าระดับโมเลกุลและการให้คะแนนคือการเทียบท่าเป็นเทคนิคที่ใช้ในการกำหนดความสัมพันธ์ที่ผูกมัดระหว่างสองโมเลกุล ในขณะที่การให้คะแนนเป็นกระบวนการของการประเมินท่าทางเฉพาะโดยการนับจำนวนการโต้ตอบระหว่างโมเลกุลที่น่าพอใจ
คำว่าการเชื่อมต่อโมเลกุลและการให้คะแนนจะใช้ในด้านการสร้างแบบจำลองโมเลกุล แบบจำลองโมเลกุลเป็นเทคนิคที่ใช้ในการกำหนดความเป็นไปได้ของการจัดเรียงโมเลกุลต่างๆ ในสารที่กำหนด เทคนิคนี้มีความสำคัญในการสร้างสารประกอบที่เสถียรใหม่
การเทียบท่าโมเลกุลคืออะไร
Molecular docking เป็นการจำลองเชิงคำนวณของลิแกนด์ที่ผูกกับตัวรับวิธีนี้ทำนายทิศทางที่ต้องการของโมเลกุลหนึ่งไปยังอีกโมเลกุลหนึ่งเมื่อจับกันเพื่อสร้างสารเชิงซ้อนที่เสถียร ผลลัพธ์ที่ได้จากเทคนิคนี้สามารถใช้เพื่อทำนายความแรงของการรวมตัวหรือสัมพรรคภาพการจับระหว่างสองโมเลกุล ที่นี่ ฟังก์ชันการให้คะแนนระดับโมเลกุลก็มีความสำคัญเช่นกัน
รูปที่ 01: แผนภาพอย่างง่ายแสดงกระบวนการปฏิสัมพันธ์ระดับโมเลกุลในระบบชีวภาพ
โดยทั่วไป เทคนิคนี้จะพิจารณาโมเลกุลที่เกี่ยวข้องทางชีวภาพ เช่น โปรตีน เปปไทด์ กรดนิวคลีอิก คาร์โบไฮเดรต และไขมัน โมเลกุลเหล่านี้มีความสำคัญมากและมีบทบาทสำคัญในกลไกการส่งสัญญาณในร่างกายของเรา ดังนั้นการวางแนวของสองโมเลกุลที่จะจับสำหรับกระบวนการส่งสัญญาณนี้ส่งผลต่อประเภทของสัญญาณที่ผลิตที่นี่นั่นหมายความว่า; การเทียบท่าระดับโมเลกุลมีความสำคัญในการพิจารณาทั้งความแรงและประเภทของสัญญาณที่เกิดขึ้นระหว่างการส่งสัญญาณในระบบชีวภาพ
ยิ่งไปกว่านั้น เทคนิคการเทียบระดับโมเลกุลมีความสำคัญในการออกแบบยาที่มีโครงสร้างเป็นพื้นฐาน นั่นเป็นเพราะการคาดการณ์ของโครงสร้างการจับของโมเลกุลขนาดเล็ก เช่น ลิแกนด์ไปยังตำแหน่งการจับที่เหมาะสม
การให้คะแนนระดับโมเลกุลคืออะไร
การให้คะแนนโมเลกุลเป็นฟังก์ชันทางคณิตศาสตร์ประเภทหนึ่งที่มีประโยชน์ในการประเมินความคืบหน้าของการเทียบท่าระดับโมเลกุล ในสาขาเคมีเชิงคำนวณ ฟังก์ชันการให้คะแนนจะใช้สำหรับการทำนายความสัมพันธ์ระหว่างสองโมเลกุลหลังจากกระบวนการเทียบท่า ตัวอย่างเช่น หากเรามีโมเลกุลเล็กๆ ของยาที่มีอนุภาคและมีเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น โปรตีน เราสามารถประเมินสัมพรรคภาพของยาที่มีต่อตำแหน่งการจับ นอกจากนี้ การให้คะแนนระดับโมเลกุลยังสามารถใช้เพื่อทำนายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลระหว่างโปรตีนสองชนิดหรือระหว่างโปรตีนกับโมเลกุลดีเอ็นเอ
รูปที่ 02: ฟังก์ชันการให้คะแนนในบทสรุป
การประยุกต์ใช้การให้คะแนนระดับโมเลกุลเป็นหลักอยู่ในขั้นตอนการออกแบบยา เช่น การคัดกรองเสมือนจริง การออกแบบโนโว การเพิ่มประสิทธิภาพลูกค้าเป้าหมาย เป็นต้น
ความแตกต่างระหว่างการเทียบท่าระดับโมเลกุลและการให้คะแนนคืออะไร
การเทียบท่าโมเลกุลและการให้คะแนนมีความสำคัญในการสร้างแบบจำลองโมเลกุล ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างการเทียบท่าระดับโมเลกุลและการให้คะแนนคือ การเทียบท่าเป็นเทคนิคที่ใช้ในการกำหนดความสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลทั้งสอง ในขณะที่การให้คะแนนเป็นกระบวนการของการประเมินท่าทางเฉพาะโดยการนับจำนวนการโต้ตอบระหว่างโมเลกุลที่น่าพอใจ
อินโฟกราฟิกต่อไปนี้สรุปความแตกต่างระหว่างการเทียบท่าระดับโมเลกุลและการให้คะแนน
สรุป – การเทียบระดับโมเลกุลกับการให้คะแนน
การเทียบท่าโมเลกุลและการให้คะแนนมีความสำคัญในการสร้างแบบจำลองโมเลกุล ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างการเทียบท่าระดับโมเลกุลและการให้คะแนนคือ การเทียบท่าเป็นเทคนิคที่ใช้ในการกำหนดความสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลทั้งสอง ในขณะที่การให้คะแนนเป็นกระบวนการของการประเมินท่าทางเฉพาะโดยการนับจำนวนการโต้ตอบระหว่างโมเลกุลที่น่าพอใจ