ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างไพรเมอร์และโปรโมเตอร์คือไพรเมอร์คือลำดับดีเอ็นเอสั้นที่สังเคราะห์ในเชิงพาณิชย์ซึ่งใช้ใน PCR สำหรับการขยายลำดับดีเอ็นเอเป้าหมายในขณะที่โปรโมเตอร์เป็นลำดับดีเอ็นเอเฉพาะซึ่งให้ไซต์การจับเริ่มต้นที่ปลอดภัยสำหรับอาร์เอ็นเอ ปัจจัยโพลีเมอเรสและการถอดรหัสเพื่อเริ่มต้นการถอดความ
ไพรเมอร์และโปรโมเตอร์เป็นลำดับดีเอ็นเอสองประเภท ไพรเมอร์เป็นชิ้นส่วนเล็กๆ ของ DNA ที่จำเป็นสำหรับปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส (PCR) มันมีลำดับนิวคลีโอไทด์สั้น ๆ ประกอบกับปลายขนาบข้างของสายดีเอ็นเอ ไพรเมอร์มีสองประเภท และพวกมันทำงานเป็นจุดเริ่มต้นสำหรับการสังเคราะห์สาย DNA ใหม่ในทางตรงกันข้าม โปรโมเตอร์คือลำดับดีเอ็นเอจำเพาะที่อยู่ต้นน้ำไปยังตำแหน่งเริ่มต้นการถอดรหัสของยีน มันโต้ตอบโดยตรงกับส่วนประกอบกลไกการถอดรหัส เช่น RNA polymerase และปัจจัยการถอดรหัสเพื่อควบคุมการถอดรหัส DNA ดังนั้น RNA polymerase และปัจจัยการถอดรหัสอื่นๆ จึงผูกมัดกับลำดับโปรโมเตอร์และเริ่มการถอดรหัส
ไพรเมอร์คืออะไร
ไพรเมอร์คือลำดับดีเอ็นเอสั้นๆ ที่ออกแบบมาสำหรับการขยายลำดับดีเอ็นเอเป้าหมาย โครงสร้าง พวกมันมีลำดับนิวคลีโอไทด์สั้นๆ ประกอบกับปลายขนาบข้างของสายคู่ดีเอ็นเอ โดยปกติแล้วจะมีความยาวประมาณ 20 นิวคลีโอไทด์ ระหว่าง PCR Taq polymerase กระตุ้นการเพิ่มนิวคลีโอไทด์ในลำดับนิวคลีโอไทด์ที่มีอยู่ก่อน ดังนั้นไพรเมอร์จึงเป็นจุดเริ่มต้นสำหรับการสังเคราะห์เส้นใยใหม่ Taq polymerase ทำงานในทิศทาง 5' ถึง 3' เท่านั้น ดังนั้น การสังเคราะห์ DNA จึงเกิดขึ้นในทิศทางเดียวกัน 5’ ถึง 3’ เนื่องจาก DNA มีลักษณะเป็นเกลียวคู่ จึงจำเป็นต้องใช้ไพรเมอร์สองประเภทใน PCRพวกมันรู้จักกันในชื่อไพรเมอร์ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์และไพรเมอร์ย้อนกลับ ตามทิศทางของการยืดตัวของไพรเมอร์ในระหว่างการสังเคราะห์ดีเอ็นเอ
รูปที่ 01: ไพรเมอร์
การหลอมไพรเมอร์ไปข้างหน้าด้วยสายดีเอ็นเอแอนติเซนส์และเริ่มการสังเคราะห์ + สแตรนด์ของยีนในทิศทาง 5’ ถึง 3’ มันมีลำดับนิวคลีโอไทด์สั้น ๆ ซึ่งประกอบกับปลายขนาบข้าง 3 ของสายแอนติเซนส์ รีเวิร์สไพรเมอร์หลอมด้วยสายสัมผัสและเริ่มการสังเคราะห์สายเสริมของสายการเข้ารหัส ซึ่งเป็นสายของยีนในทิศทาง 5 ถึง 3 ดังนั้นไพรเมอร์แบบย้อนกลับจึงได้รับการออกแบบมาเสริมที่ส่วนปลาย 3' ของเกลียวการเข้ารหัส ทั้งไพรเมอร์ย้อนกลับและไปข้างหน้ามีความสำคัญสำหรับการผลิตสำเนาหลายล้านถึงพันล้านสำเนาของภูมิภาคเฉพาะของดีเอ็นเอที่เป็นเป้าหมายหรือสนใจ
โปรโมเตอร์คืออะไร
โปรโมเตอร์คือลำดับดีเอ็นเอที่อยู่ต้นน้ำหรือปลาย 5′ ของไซต์เริ่มต้นการถอดรหัสของยีน เป็นตำแหน่งที่มีผลผูกพันสำหรับ RNA polymerase และองค์ประกอบด้านกฎระเบียบบางอย่างเพื่อเริ่มต้นการถอดรหัสของยีน เป็นลำดับการควบคุมที่จำเป็นสำหรับการเปิดหรือปิดยีน มีลำดับนิวคลีโอไทด์จำเพาะในโปรโมเตอร์ สามารถมีคู่เบสได้ 100–1000 คู่ โปรโมเตอร์แสดงทิศทางของการถอดความ ยิ่งไปกว่านั้น มันบ่งบอกถึงสาระความรู้สึกที่ควรถอดความ
รูปที่ 02: โปรโมเตอร์ของยีน
องค์ประกอบโปรโมเตอร์มีสามประเภท ได้แก่ โปรโมเตอร์หลัก โปรโมเตอร์ส่วนปลาย และโปรโมเตอร์ส่วนปลาย โปรโมเตอร์หลักคือส่วนที่น้อยที่สุดของโปรโมเตอร์ที่จำเป็นในการเริ่มต้นการถอดความตั้งอยู่ใกล้กับ codon เริ่มต้นมากที่สุด กล่องทาทาเป็นพื้นที่อนุรักษ์ที่พบในโปรโมเตอร์แกนยูคาริโอตจำนวนมาก พบคู่เบส 25 ถึง 35 คู่ต้นน้ำของไซต์เริ่มต้นการถอดความ พบโปรโมเตอร์ส่วนต้นมากกว่าโปรโมเตอร์หลัก โดยทั่วไปจะอยู่ที่ 250 คู่เบสต้นน้ำไปยัง codon เริ่มต้นและมีองค์ประกอบด้านกฎระเบียบหลัก พบโปรโมเตอร์ส่วนปลายพบต้นน้ำไปยังโปรโมเตอร์ใกล้เคียงและมีองค์ประกอบด้านกฎระเบียบเพิ่มเติม โปรโมเตอร์ของแบคทีเรียมีองค์ประกอบลำดับสั้น ๆ สององค์ประกอบในโปรโมเตอร์ TATAAT เป็นลำดับฉันทามติที่ -10 ของโปรโมเตอร์แบคทีเรียในขณะที่ TTGACA เป็นลำดับฉันทามติที่ -35 พวกมันถูกเรียกว่าธาตุ -10 และธาตุ -35
ความคล้ายคลึงกันระหว่างไพรเมอร์และโปรโมเตอร์คืออะไร
- ไพรเมอร์และโปรโมเตอร์เป็นลำดับดีเอ็นเอสองประเภท
- ประกอบด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์
- ทั้งไพรเมอร์และโปรโมเตอร์มีความสำคัญต่อการแสดงออกของยีน
ไพรเมอร์กับโปรโมเตอร์ต่างกันอย่างไร
ไพรเมอร์เป็นลำดับนิวคลีโอไทด์สั้นๆ ที่ออกแบบมาสำหรับการขยายดีเอ็นเอเป้าหมาย ในทางตรงกันข้าม โปรโมเตอร์คือลำดับดีเอ็นเอควบคุมเฉพาะที่พบต้นน้ำไปยังไซต์เริ่มต้นการถอดรหัสของยีน นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างไพรเมอร์และโปรโมเตอร์ ไพรเมอร์มีความยาวประมาณ 20 คู่เบส ในขณะที่โปรโมเตอร์สามารถมีเบสคู่ได้ 100 -1000 คู่ ตามหน้าที่ ไพรเมอร์ทำหน้าที่เป็นลำดับเริ่มต้นสำหรับการสังเคราะห์สายใหม่ ในขณะที่โปรโมเตอร์ควบคุมการถอดรหัสยีนโดยการจัดหาตำแหน่งจับสำหรับ RNA polymerase และปัจจัยการถอดรหัสอื่นๆ
ยิ่งไปกว่านั้น โปรโมเตอร์ถูกกำหนดให้เป็นทิศทางของการถอดความและระบุสายประสาทสัมผัสของยีน โครงสร้างไพรเมอร์เป็นลำดับดีเอ็นเอสายเดี่ยวสั้นในขณะที่โปรโมเตอร์เป็นลำดับดีเอ็นเอสองสายยาว
อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงการเปรียบเทียบเพิ่มเติมที่เกี่ยวข้องกับความแตกต่างระหว่างไพรเมอร์และโปรโมเตอร์
สรุป – ไพรเมอร์ vs โปรโมเตอร์
ไพรเมอร์เป็นลำดับนิวคลีโอไทด์สั้นๆ ประกอบกับปลายขนาบข้างของ DNA double-strand เป้าหมาย ไพรเมอร์สองประเภทใช้ใน PCR พวกมันทำหน้าที่เป็นลำดับเริ่มต้นสำหรับการสังเคราะห์เกลียวใหม่ ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบในเชิงพาณิชย์ และเป็นสีรองพื้นที่มีอุณหภูมิคงที่ ในทางกลับกัน โปรโมเตอร์คือลำดับการควบคุมของยีนที่อยู่ต้นน้ำไปยังไซต์เริ่มต้นการถอดรหัส โปรโมเตอร์ควบคุมการถอดรหัสยีน พวกเขาจัดเตรียมไซต์ที่มีผลผูกพันสำหรับ RNA polymerase และปัจจัยการถอดรหัสเพื่อเริ่มต้นการถอดรหัส ดังนั้น นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่างไพรเมอร์และโปรโมเตอร์