ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง dNTP และ ddNTP คือ dNTP หรือ deoxyribonucleotides เป็นส่วนประกอบสำคัญของ DNA และมีกลุ่ม 3ʹ-OH บนโครงสร้างน้ำตาลเพนโทส ในขณะที่ ddNTP หรือไดดีออกซีนิวคลีโอไซด์ ไตรฟอสเฟต เป็นนิวคลีโอไทด์ที่ไม่มีกลุ่ม 3ʹ-OH และพวกมัน ถูกนำมาใช้ในเทคนิคการจัดลำดับ DNA ของ Sanger dideoxy เพื่อสร้างลำดับ DNA ที่มีความยาวต่างกัน
dNTP และ ddNTP เป็นนิวคลีโอไทด์ dNTP หมายถึงนิวคลีโอไทด์ดีออกซีไรโบส พวกเขาเป็นองค์ประกอบสำคัญของดีเอ็นเอ dNTP ใช้ในการสังเคราะห์ DNA ในทางกลับกัน dNTP หมายถึงไดดีออกซีนิวคลีโอไซด์ไตรฟอสเฟต พวกมันถูกใช้ในการจัดลำดับ Sanger เพื่อยุติการสังเคราะห์ DNA ที่ความยาวต่างกันพวกเขาขาดกลุ่ม OH ที่ตำแหน่ง3ʹ มีไฮโดรเจนอยู่ที่ตำแหน่ง 3ʹ แทนที่จะเป็นหมู่ OH ดังนั้น ddNTP จึงไม่สามารถสร้างพันธะฟอสโฟไดสเตอร์กับนิวคลีโอไทด์ถัดไปได้ dNTP สามารถดำเนินการสังเคราะห์ DNA ในขณะที่ ddNTP สามารถยุติการเกิดพอลิเมอไรเซชันของ DNA ได้
dNTP คืออะไร
dNTP ย่อมาจาก deoxyribose nucleotide หรือ deoxyribonucleotide เป็นส่วนประกอบสำคัญของดีเอ็นเอ dNTP มีสี่ประเภท ได้แก่ dATP, dTTP, dCTP และ dGTP พวกมันถูกตั้งชื่อตามฐานไนโตรเจนของ purine หรือ pyrimidine: Adenine (A), Guanine (G), Thymine (T) และ Cytosine (C)
รูปที่ 01: dNTP
อะดีนีนและกัวนีนเป็นเบสพิวรีนในขณะที่ไทมีนและไซโตซีนเป็นเบสไพริมิดีน น้ำตาลเพนโทสของ dNTP คือดีออกซีไรโบสนอกจากนี้ยังมีหมู่ฟอสเฟต ดังนั้น dNTP จึงประกอบด้วยสามองค์ประกอบ: เบสไนโตรเจน น้ำตาลดีออกซีไรโบส และกลุ่มฟอสเฟต dNTP เหล่านี้รวมกันผ่านพันธะฟอสโฟไดสเตอร์ ใน dNTP มีหมู่ OH ติดอยู่ที่ตำแหน่ง 3ʹ ของน้ำตาลเพนโทส ซึ่งจำเป็นต่อการสร้างการเชื่อมโยงกับกลุ่มฟอสเฟตที่ติดอยู่กับคาร์บอน 5ʹ ของน้ำตาลของนิวคลีโอไทด์ถัดไป เนื่องจาก dNTP ทั้งหมดมีหมู่ 3ʹ -OH นี้ พวกมันจึงสามารถสังเคราะห์และขยายสาย DNA ได้ ดังนั้น dNTP จึงทำหน้าที่เป็นหน่วยการทำซ้ำพื้นฐานของ DNA และสารเคมีของยีน การสังเคราะห์ DNA เริ่มจาก 5ʹ ถึง 3ʹ เสมอ
DdNTP คืออะไร
Sanger sequencing เป็นวิธีการจัดลำดับ DNA รุ่นแรกที่พัฒนาโดย Frederick Sanger และวิทยาลัยของเขาในปี 1977 เป็นที่รู้จักกันว่า Chain Termination Sequencing หรือ Dideoxy sequencing เนื่องจากหลักการพื้นฐานของวิธีนี้คือการยุติลูกโซ่โดยใช้ไดดีออกซีนิวคลีโอไซด์ไตรฟอสเฟต (ddNTP) ddNTPs เป็นนิวคลีโอไทด์ที่ใช้ในการจัดลำดับแซงเจอร์การจัดลำดับ Sanger ขึ้นอยู่กับการรวมการคัดเลือกของ ddNTP และการสิ้นสุดของการสังเคราะห์ DNA ระหว่างการจำลองแบบ DNA ในหลอดทดลอง ลักษณะพิเศษของ ddNTPs คือไม่มีกลุ่ม 3ʹ-OH บนน้ำตาลเพนโทสเพื่อดำเนินการสร้างพันธะฟอสโฟไดสเตอร์ระหว่างกลุ่มฟอสเฟต 5ʹ ในนิวคลีโอไทด์ที่อยู่ติดกัน ดังนั้น เมื่อต่อ ddNTP เข้ากับเกลียวที่ยื่นออกมา การยืดตัวของโซ่จะสิ้นสุดลงและสิ้นสุดจากจุดนั้น ddNTPs ทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งการยืดสายของ DNA polymerase ระหว่างวิธีการจัดลำดับ Sanger
รูปที่ 02: ddNTP
มี ddNTP สี่ตัว: ddATP, ddCTP, ddGTP และ ddTTP ที่ใช้ในการจัดลำดับ Sanger นิวคลีโอไทด์เหล่านี้จะหยุดกระบวนการจำลองดีเอ็นเอเมื่อรวมเข้ากับสายดีเอ็นเอที่กำลังเติบโต ด้วยเหตุนี้ การจัดลำดับ Sanger จึงสร้าง DNA สั้น ๆ ที่มีความยาวต่างกันออกไปเส้นเลือดฝอยเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสใช้เพื่อจัดระเบียบสาย DNA สั้น ๆ เหล่านี้ตามขนาดบนเจล ddNTPs ถูกติดฉลากกัมมันตภาพรังสีหรือเรืองแสงด้วยสีต่างๆ เพื่อความสะดวกในการวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอ การวิเคราะห์เจลสามารถระบุลำดับนิวคลีโอไทด์ของสาย DNA ที่ไม่รู้จักได้
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง dNTP และ DdNTP คืออะไร
- ทั้ง dNTP และ ddNTP ถูกใช้ในการจัดลำดับ Sanger
- dNTP และ ddNTP มีสี่ประเภท
- ประกอบด้วยสามองค์ประกอบ: เบสไนโตรเจน น้ำตาลดีออกซีไรโบส และกลุ่มฟอสเฟต
ความแตกต่างระหว่าง dNTP และ DdNTP คืออะไร
dNTP เป็นหนึ่งในสี่ประเภทของดีออกซีไรโบนิวคลีโอไทด์ซึ่งเป็นส่วนประกอบสำคัญของดีเอ็นเอ ddNTP เป็นหนึ่งในสี่ประเภทของไดดีออกซีไรโบนิวคลีโอไซด์ไตรฟอสเฟตที่ใช้ในเทคนิคการหาลำดับของแซงเจอร์ dNTP มีกลุ่ม 3ʹ-OH บนน้ำตาลเพนโทสในขณะที่ ddNTP ไม่มีกลุ่ม 3ʹ-OH บนน้ำตาลเพนโทสดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง dNTP และ ddNTP นอกจากนี้ dNTP ยังดำเนินการ DNA polymerization ในขณะที่ ddNTPs ยุติ DNA polymerization ดังนั้น นี่เป็นข้อแตกต่างที่สำคัญอีกประการหนึ่งระหว่าง dNTP และ ddNTP
อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงความแตกต่างระหว่าง dNTP และ ddNTP ในรูปแบบตาราง
สรุป – dNTP vs DdNTP
dNTP ปกติเป็นส่วนสำคัญของ DNA ในขณะที่ ddNTP เป็นนิวคลีโอไทด์ที่ใช้ในเทคนิคการหาลำดับของ Sanger dNTP มี 3ʹ-OH ในขณะที่ ddNTP ไม่มี 3ʹ-OH ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง dNTP และ ddNTP นอกจากนี้ dNTP สามารถสังเคราะห์สาย DNA ในขณะที่ ddNTP สามารถยุติการเกิดพอลิเมอไรเซชันของ DNA ได้ ดังนั้น ddNTP จึงถูกใช้ในการจัดลำดับ Sanger เพื่อผลิตสาย DNA ต่างๆ ที่มีความยาวต่างกัน ในระหว่างการจัดลำดับ Sanger ทั้ง dNTP และ ddNTP จะรวมอยู่ด้วย
