ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง synteny และ collinearity คือ synteny เป็นการ co-localization ทางกายภาพของ loci พันธุกรรมบนโครโมโซมเดียวกันในสปีชีส์ ในขณะที่ collinearity คือ co-localization ทางกายภาพของ loci พันธุกรรมบนโครโมโซมเดียวกันในการอนุรักษ์สายพันธุ์ต่างๆ ลำดับเดียวกัน
Synteny และ collinearity เป็นคำสองคำที่ใช้แทนกันได้ในจีโนม คำศัพท์ทั้งสองอธิบายรูปแบบการแปลยีนบนโครโมโซมในสปีชีส์ต่างๆ การจัดเรียงยีนที่เกี่ยวข้องเหล่านี้ในกลุ่มแท็กซ่าเป็นข้อมูลที่มีค่าเมื่ออนุมานถึงบรรพบุรุษของยีนที่ใช้ร่วมกัน Synteny หมายถึงการโลคัลไลเซชันทางกายภาพของตำแหน่งทางพันธุกรรมบนโครโมโซมเดียวกันในสปีชีส์Collinearity หมายถึงการโลคัลไลเซชันทางกายภาพของตำแหน่งทางพันธุกรรมบนโครโมโซมเดียวกันในสปีชีส์ต่างๆ ที่อนุรักษ์ลำดับเดียวกัน ดังนั้นจึงเป็นรูปแบบของการประสานกัน
ซินเทนี่คืออะไร
ในสายพันธุ์ต่างๆ จะมีชุดของยีนที่อยู่บนโครโมโซมเดียวกัน และการหาตำแหน่งร่วมกันทางกายภาพของยีนบนโครโมโซมเดียวกันในสปีชีส์ต่างๆ เรียกว่าซินเทนนี นอกจากนี้ ยีนเหล่านี้ยังพบใกล้กันมากในโครโมโซมเดียว ลำดับของยีนอาจไม่เหมือนกันเสมอไป แต่การแปลความหมายของยีนที่อยู่ใกล้กันบนโครโมโซมเดียวกันนั้นเกิดขึ้นในลักษณะสังเคราะห์ ดังนั้น synteny จึงอธิบายรูปแบบการกระจายของยีนบนโครโมโซมเป็นหลัก รูปแบบการโลคัลไลเซชันของยีนเหล่านี้บ่งชี้ถึงความสัมพันธ์ระหว่างสปีชีส์ต่างๆ และวิวัฒนาการของพวกมัน อย่างไรก็ตาม ซินเทนีสามารถหยุดชะงักได้เนื่องจากการจัดเรียงใหม่ของโครโมโซม เช่น การโยกย้าย การผกผัน และการหลอมรวมของโครโมโซม เป็นต้น การทำซ้ำ การสูญเสีย และการรวมตัวที่คล้ายคลึงกันที่ไม่เท่ากัน
รูปที่ 01: Synteny
เชื่อกันว่ายีนที่เชื่อมโยงกันทั้งหมดเป็นซินเทนิก อย่างไรก็ตาม ไม่จำเป็นต้องมีการเชื่อมโยงยีนสังเคราะห์ทั้งหมด พวกมันมีลำดับโครโมโซมร่วมกัน มนุษย์มียีนสังเคราะห์หลายอย่างกับสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดอื่น นอกจากนี้ ธัญพืชหลายชนิดยังมียีนสังเคราะห์
Collinearity คืออะไร
Collinearity เป็นรูปแบบเฉพาะของ synteny ซึ่งชุดของยีนตั้งอยู่บนโครโมโซมเดียวกันของสปีชีส์ต่างกันในลำดับเดียวกันกับในสายพันธุ์บรรพบุรุษ ดังนั้น หากมีการเบี่ยงเบนจากการทำงานร่วมกัน มันจะเป็นลักษณะสายวิวัฒนาการที่น่าเชื่อถือมากขึ้น เนื่องจากความสอดคล้องกันจะอธิบายถึงบรรพบุรุษร่วมกันของยีน
รูปที่ 02: Collinearity
การวิเคราะห์การทำงานร่วมกันหลายทางให้ข้อมูลที่เชื่อถือได้มากขึ้นเกี่ยวกับสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องและสายเลือดของพวกมัน
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง Synteny และ Collinearity คืออะไร
- ทั้ง synteny และ collinearity ชุดของ loci ในสองสายพันธุ์ที่แตกต่างกันนั้นตั้งอยู่บนโครโมโซมเดียวกัน
- คำศัพท์เหล่านี้อธิบายการโลคัลไลเซชันทางกายภาพของตำแหน่งทางพันธุกรรมบนโครโมโซมเดียวกัน
- Collinearity เป็นรูปแบบเฉพาะของ synteny
- บางครั้งทั้งสองคำนี้ใช้สลับกันในจีโนมิกส์
- ถ้าสองภูมิภาคมีความสอดคล้องกัน แสดงว่าเชื่อมโยงกันอย่างชัดเจน
- มีประโยชน์ในการอนุมานสายวิวัฒนาการ
ความแตกต่างระหว่าง Synteny และ Collinearity คืออะไร
Synteny และ collinearity เป็นคำสองคำที่ใช้แทนกันได้ในจีโนม Synteny หมายถึงการโลคัลไลเซชันทางกายภาพของชุดยีนในโครโมโซมเดียวกันในสปีชีส์ต่างๆ Collinearity เป็นรูปแบบหนึ่งของ synteny ซึ่งชุดของยีนมีการแปลร่วมกันในลำดับเดียวกันในสปีชีส์ต่างๆ ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง synteny และ collinearity
สรุป – Synteny vs Collinearity
คำว่า synteny และ collinearity หมายถึงชุดของยีนที่อยู่บนโครโมโซมเดียวกันในสปีชีส์ต่างๆ อันที่จริง ยีนเหล่านี้มีการแปลร่วมกันในโครโมโซมเดียวกันในสปีชีส์ต่างๆ Synteny อธิบายการโลคัลไลเซชันร่วมกันทางกายภาพของเซตยีนบนโครโมโซมเดียวกันในสปีชีส์ต่างๆ ในขณะที่ collinearity เป็นรูปแบบเฉพาะของ synteny ซึ่งชุดของยีนถูกโลคัลไลซ์ร่วมในลำดับเดียวกันดังนั้น สิ่งนี้จะสรุปความแตกต่างระหว่าง synteny และ collinearity
