ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง MLVA และ MLST คือ MLVA ใช้พหุสัณฐานของลำดับ DNA ที่ทำซ้ำตามลำดับเพื่อระบุลักษณะของจุลินทรีย์ ในขณะที่ MLST ใช้ความหลากหลายในลำดับดีเอ็นเอของชิ้นส่วนภายในของยีนดูแลบ้านหลายตัวเพื่อระบุลักษณะของจุลินทรีย์
ปกติจะใช้การพิมพ์จุลินทรีย์เพื่อระบุแหล่งที่มาและเส้นทางของการติดเชื้อ มันยืนยันหรือออกกฎการระบาด การพิมพ์จุลินทรีย์ยังติดตามการแพร่ข้ามของเชื้อโรคที่เกี่ยวข้องกับการดูแลสุขภาพและรับรู้ถึงสายพันธุ์ที่เป็นพิษ นอกจากนี้ การพิมพ์จุลินทรีย์ยังประเมินประสิทธิผลของมาตรการควบคุมจุลินทรีย์ที่ทำให้เกิดโรคMLVA และ MLST เป็นสองเทคนิคทางอณูชีววิทยาที่ใช้ในการพิมพ์จุลินทรีย์
MLVA คืออะไร
การวิเคราะห์ VNTR หลายตำแหน่ง (MLVA) เป็นวิธีการทางอณูชีววิทยาที่ใช้ความหลากหลายในลำดับดีเอ็นเอที่ทำซ้ำตามลำดับเพื่อระบุลักษณะเฉพาะของจุลินทรีย์ เป็นวิธีที่ใช้ในการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมของจุลินทรีย์บางสายพันธุ์
ในระหว่างขั้นตอนแรกของ MLVA โลคัส VNTR ที่เป็นเป้าหมายแต่ละรายการจะถูกขยายโดย PCR โดยมีไพรเมอร์เฉพาะภูมิภาคขนาบข้าง จากนั้นชิ้นส่วนที่ได้รับจะถูกแยกขนาดโดยอิเล็กโตรโฟรีซิสบนซีเควนเซอร์ของเส้นเลือดฝอย จีโนไทป์ของแต่ละโลคัสและผลลัพธ์ที่รวบรวมจากตัวอย่างแต่ละตัวอย่างช่วยให้สามารถจำแนกลักษณะของจุลินทรีย์ที่รู้จักสปีชีส์ได้ นอกจากนี้ยังช่วยให้ระบุชนิดย่อยผ่านการพิมพ์อัลลีลและเปรียบเทียบกับฐานข้อมูล MLVA
รูปที่ 01: MLVA
วิธี MLVA นี้เลือกได้มากกว่าวิธี MLST นอกจากนี้ วิธี MLVA ไม่ต้องการขั้นตอนการหาลำดับดีเอ็นเอ ดังนั้นจึงทำให้สามารถแยกแยะสายพันธุ์ย่อยหรือสายพันธุ์ใกล้เคียงได้
MLST คืออะไร
การพิมพ์ลำดับ Multilocus (MLST) เป็นเทคนิคที่ใช้ความหลากหลายในลำดับดีเอ็นเอของชิ้นส่วนภายในของยีนการดูแลทำความสะอาดหลายตัวเพื่อระบุลักษณะเฉพาะของจุลินทรีย์ MLST เป็นเทคนิคในการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมสำหรับการพิมพ์หลายตำแหน่ง
รูปที่ 02: MLST
เป็นประเภทของการพิมพ์ลำดับที่ใช้เป็นเทคนิคอ้างอิงในการแยกแยะสายพันธุ์ของจุลินทรีย์สายพันธุ์ต่างๆ วิธีนี้ใช้การจัดลำดับยีนการดูแลทำความสะอาดโดยปกติยีนดูแลทำความสะอาดจะเข้ารหัสโปรตีนที่จำเป็นของสารจุลินทรีย์ เช่น แบคทีเรีย ลำดับของยีนการดูแลทำความสะอาดเหล่านี้มีลักษณะเฉพาะของการนำเสนอความหลากหลายที่คงที่เมื่อเวลาผ่านไป ดังนั้น ความแตกต่างในลำดับของยีนการดูแลทำความสะอาดก็เพียงพอแล้วที่จะแยกแยะสายพันธุ์ออกจากกัน นอกจากนี้ โครงการ MLST แรกที่ได้รับการพัฒนาคือ Neisseria meningitidis ซึ่งเป็นสาเหตุเชิงสาเหตุของเยื่อหุ้มสมองอักเสบจากเยื่อหุ้มสมองอักเสบและภาวะโลหิตเป็นพิษ นับตั้งแต่เปิดตัว MLST ได้ถูกนำมาใช้ไม่เพียงแต่สำหรับเชื้อโรคในมนุษย์แต่ยังรวมถึงเชื้อโรคในพืชด้วย
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง MLVA และ MLST คืออะไร
- MLVA และ MLST เป็นสองเทคนิคทางอณูชีววิทยาที่ใช้ในการพิมพ์จุลินทรีย์
- ทั้งสองเทคนิคสามารถใช้สำหรับการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของจุลินทรีย์
- เทคนิคทั้งสองมีพื้นฐานมาจากความหลากหลายทางพันธุกรรม
- ใช้สำหรับตรวจหาโรคในมนุษย์ที่ก่อให้เกิดโรคจุลินทรีย์
- เทคนิคทั้งสองควรทำโดยนักชีววิทยาระดับโมเลกุลที่เชี่ยวชาญ
ความแตกต่างระหว่าง MLVA และ MLST คืออะไร
MLVA เป็นเทคนิคที่ใช้พหุสัณฐานของลำดับดีเอ็นเอที่ทำซ้ำตามลำดับเพื่อกำหนดลักษณะเฉพาะของจุลินทรีย์ ในขณะเดียวกัน MLST เป็นเทคนิคที่ใช้ความหลากหลายในลำดับดีเอ็นเอของชิ้นส่วนภายในของยีนการดูแลทำความสะอาดหลายตัวเพื่อระบุลักษณะเฉพาะของจุลินทรีย์ ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง MLVA และ MLST นอกจากนี้ วิธี MLVA ยังเลือกได้มากกว่าวิธี MLST
อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงความแตกต่างระหว่าง MLVA และ MLST ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – MLVA vs MLST
MLVA และ MLST เป็นสองเทคนิคทางอณูชีววิทยาที่ใช้ในการพิมพ์จุลินทรีย์ MLVA ใช้พหุสัณฐานของลำดับดีเอ็นเอซ้ำซ้อนเพื่อระบุลักษณะชนิดของจุลินทรีย์ ในขณะที่ MLST ใช้พหุสัณฐานของลำดับดีเอ็นเอของชิ้นส่วนภายในของยีนดูแลบ้านหลายตัวเพื่อกำหนดลักษณะสปีชีส์ของจุลินทรีย์นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง MLVA และ MLST
