คลอโรฟิลล์กับคลอโรพลาส
การสังเคราะห์ด้วยแสงเป็นปฏิกิริยาที่ขับเคลื่อนด้วยแสงซึ่งจะเปลี่ยนคาร์บอนไดออกไซด์และน้ำให้เป็นน้ำตาลที่มีพลังงานสูง การสังเคราะห์ด้วยแสงเริ่มต้นจากการดักจับพลังงานแสงโดยสีคลอโรฟิลล์ คลอโรพลาสต์คือบริเวณที่มีการสังเคราะห์แสง
คลอโรพลาสต์
คลอโรพลาสต์เป็นออร์แกเนลล์ชนิดพลาสติด พบได้ในเซลล์พืชและยูคาริโอตสังเคราะห์แสงอื่นๆ คลอโรพลาสต์ค่อนข้างคล้ายกับไมโตคอนเดรีย แต่ความแตกต่างก็คือคลอโรพลาสต์สามารถพบได้เฉพาะในพืชและในกลุ่มผู้ประท้วง คลอโรพลาสต์ประกอบด้วยคลอโรฟิลล์ซึ่งทำให้คลอโรพลาสมีลักษณะเป็นสีเขียวทฤษฎีเอนโดซิมไบโอติกแสดงให้เห็นว่าคลอโรพลาสต์วิวัฒนาการมาจากโปรคาริโอต (แบคทีเรีย) นอกจากคลอโรฟิลล์แล้ว คลอโรพลาสยังมีแคโรทีนอยด์อีกด้วย โดยปกติคลอโรพลาสต์จะมีเม็ดสี 2 ชนิด ประเภทหนึ่งคือคลอโรฟิลล์ซึ่งรวมถึงคลอโรฟิลล์เอและคลอโรฟิลล์บี แคโรทีนอยด์มี 2 ชนิด คือแคโรทีนและแซนโทฟิลล์ คลอโรพลาสต์ล้อมรอบด้วยเมมเบรนสองชั้น บริเวณที่ไม่มีสีเรียกว่าสโตรมาตั้งอยู่ภายในคลอโรพลาสต์ ถุงหุ้มเยื่อเมมเบรนที่เติมของเหลวที่เรียกว่าไทลาคอยด์จะไหลผ่านสโตรมา สิ่งเหล่านี้ประกอบด้วยกองรูปแผ่นดิสก์ที่เรียกว่ากราน่า กราน่าเหล่านี้เชื่อมต่อถึงกันด้วยแผ่นลาเมลลา Thylakoids (lamellae และ Grana) มีเม็ดสีสังเคราะห์แสง สโตรมาประกอบด้วยเอ็นไซม์ DNA ทรงกลม ไรโบโซมในยุค 70 และผลิตภัณฑ์สังเคราะห์แสง (น้ำตาล เมล็ดแป้ง และหยดไขมัน) การสังเคราะห์ด้วยแสงเกี่ยวข้องกับปฏิกิริยาสองปฏิกิริยา คือปฏิกิริยาแสงและปฏิกิริยามืด ปฏิกิริยาแสงเกิดขึ้นใน thylakoids (grana และ lamellae) ปฏิกิริยามืดเกิดขึ้นในสโตรมา
คลอโรฟิลล์
คลอโรฟิลล์เป็นเม็ดสีเขียว สามารถพบได้ในสิ่งมีชีวิตหลายชนิด รวมทั้งพืช สาหร่าย และไซยาโนแบคทีเรีย คลอโรฟิลล์เป็นหนึ่งในปัจจัยที่สำคัญที่สุดสำหรับการสังเคราะห์ด้วยแสง คลอโรฟิลล์ดูดซับแสงในบริเวณสีน้ำเงินและสีแดงของสเปกตรัมที่มองเห็นได้และสะท้อนกลับเป็นสีเขียว พืช สาหร่าย และโปรคาริโอตสังเคราะห์คลอโรฟิลล์ คลอโรฟิลล์มีหลายประเภท ได้แก่ คลอโรฟิลล์เอ คลอโรฟิลล์บี คลอโรฟิลล์ซี และคลอโรฟิลล์ดี คลอโรฟิลล์เอมีมากที่สุด คลอโรฟิลล์ เอ มีอยู่หลายรูปแบบซึ่งมีการดูดกลืนแสงสีแดงสูงสุดที่ความยาวคลื่นต่างกันเล็กน้อย P700 ในระบบภาพถ่าย I และ p680 ในระบบภาพถ่าย II เป็นสองตัวอย่าง คลอโรฟิลล์มีรูปแบบการดูดกลืนแสงที่มีลักษณะเฉพาะ (ดูดซับแสงสีน้ำเงินและสีแดงเป็นหลักและสะท้อนแสงสีเขียว) โมเลกุลของคลอโรฟิลล์มีหัวที่ชอบน้ำและหางไม่ชอบน้ำ หัวที่ชอบน้ำถูกฉายไปที่ด้านนอกของเยื่อหุ้มไทลาคอยด์ หางไม่ชอบน้ำถูกฉายไปที่เยื่อหุ้มไทลาคอยด์ส่วนที่จับแสงของโมเลกุลมักจะมีพันธะเดี่ยวและพันธะคู่สลับกัน (อิเล็กตรอนสามารถเคลื่อนที่ไปรอบๆ โมเลกุลได้อย่างอิสระ) พันธะเหล่านี้ประกอบด้วยอิเล็กตรอนที่สามารถเคลื่อนไปสู่ระดับพลังงานที่สูงขึ้นได้โดยการดูดซับแสง วงแหวนมีศักยภาพในการให้อิเล็กตรอนที่มีพลังงานแก่โมเลกุลอื่น
คลอโรพลาสต์กับคลอโรฟิลล์ต่างกันอย่างไร ?
• คลอโรพลาสต์เป็นออร์แกเนลล์ชนิดพลาสติดที่มีเยื่อหุ้มสองชั้น ซึ่งประกอบด้วยไทลาคอยด์ สโตรมา DNA ทรงกลม ไรโบโซม และหยดไขมัน ในขณะที่คลอโรฟิลล์เป็นเพียงโมเลกุล
• คลอโรฟิลล์เป็นเม็ดสีที่ดูดซับพลังงานแสง และพบคลอโรฟิลล์ในคลอโรพลาสต์
• คลอโรฟิลล์เป็นโมเลกุลซึ่งเริ่มการสังเคราะห์ด้วยแสงโดยการดูดซับพลังงานแสง และคลอโรพลาสคือบริเวณของการสังเคราะห์ด้วยแสง