ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างการแยกจีโนม DNA และการแยก DNA พลาสมิดคือการแยก DNA ของจีโนมมุ่งเป้าไปที่การสกัดจีโนม DNA ในขณะที่การแยก DNA พลาสมิดมีเป้าหมายในการสกัดพลาสมิด DNA ของแบคทีเรีย
DNA แยกเป็นกระบวนการทางเคมีที่ใช้ในการแยก DNA จากสายพันธุ์ต่าง ๆ หรือจากตัวอย่างที่แตกต่างกัน การแยกดีเอ็นเอมีความสำคัญในเทคนิคทางอณูชีววิทยาขั้นปลาย เช่น เจลอิเล็กโตรโฟรีซิส ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส และเทคนิคการหาลำดับดีเอ็นเอ ดังนั้นการแยก DNA จึงเป็นกระบวนการทางเคมีที่สำคัญในการศึกษาทางอณูชีววิทยา ตามวัตถุประสงค์ของการวิจัย บางครั้งจำเป็นต้องแยกจีโนม DNAนอกจากนี้ การศึกษาบางชิ้นยังเน้นที่การแยกพลาสมิด DNA ออกจากแบคทีเรีย การแยก DNA ของจีโนมเป็นกระบวนการแยก DNA ของจีโนมออกจากตัวอย่างโปรคาริโอตหรือยูคาริโอต ขั้นตอนการแยกตัวจะแตกต่างกันไปตามประเภทของเซลล์ที่ DNA กำลังแยกออก การแยกพลาสมิด DNA เป็นกระบวนการแยกพลาสมิด DNA ออกจากเซลล์แบคทีเรีย เมื่อเปรียบเทียบกับการแยก DNA ของจีโนม กระบวนการโดยรวมมีความซับซ้อนในการแยก DNA พลาสมิด
การแยก DNA ของจีโนมคืออะไร
การแยก DNA ของจีโนมเป็นกระบวนการสกัด DNA จีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิต กระบวนการนี้เกี่ยวข้องกับเหตุการณ์หลักสามเหตุการณ์ สิ่งเหล่านี้คือ การสลายเซลล์หรือการแยกสลายด้วยนิวเคลียร์ การเสื่อมสลายของโปรตีนหรือการสลายโปรตีน และการตกตะกอนของ DNA ของจีโนม ขั้นตอนการสลายอาจแตกต่างกันไปตามประเภทเซลล์ ในโปรคาริโอต เนื่องจากมีผนังเซลล์ peptidoglycan ขั้นตอนแรกควรเป็นการสลายตัวของผนังเซลล์ ในทางกลับกัน ในยูคาริโอต ขั้นตอนการสลายเกี่ยวข้องกับการสลายตัวของพลาสมาเมมเบรนและเยื่อหุ้มนิวเคลียสเพื่อดึง DNA ออกสู่ภายนอกในทางตรงกันข้าม ขั้นตอนพิเศษมีความจำเป็นในการสลายผนังเซลล์พืชและเชื้อรา
รูปที่ 01: การแยก DNA ของจีโนม
ดังนั้น เมื่อขั้นตอนการสลายเสร็จสิ้น ในที่สุด DNA ก็จะมาที่ส่วนเหนือตะกอน ในเวลาเดียวกัน การย่อยสลายโปรตีนยังเกิดขึ้นในสารละลายเนื่องจากการเติมโปรตีเอสเค ขั้นตอนต่อไปคือการแยก DNA ของจีโนมและโปรตีนที่เสื่อมสภาพออกจากกัน ดังนั้น โปรตีนที่เสื่อมโทรมจะแยกออกจากกันโดยการตกตะกอนโดยปล่อยให้จีโนม DNA ยังคงอยู่ในส่วนเหนือตะกอน หลังจากการตกตะกอนของโปรตีน จีโนม DNA สามารถตกตะกอนและแขวนลอยใหม่อีกครั้งในบัฟเฟอร์ที่เหมาะสมจนกว่าจะต้องทำการทดลอง
จีโนม DNA ซึ่งเป็น DNA เชิงเส้นที่มีข้อมูลทางพันธุกรรมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตกล่าวอีกนัยหนึ่ง จีโนมเป็นวัสดุทางพันธุกรรมของสิ่งมีชีวิตซึ่งรับผิดชอบกิจกรรมโครงสร้างและการทำงานทั้งหมดของเซลล์ ประกอบด้วยลำดับดีเอ็นเอทั้งแบบเข้ารหัสและไม่เข้ารหัส เมื่อแยกจีโนม DNA จะรวมถึงจีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิต
การแยก DNA ของพลาสมิดคืออะไร
การแยกดีเอ็นเอด้วยพลาสมิดเป็นกระบวนการพิเศษและซับซ้อนกว่าของการแยกดีเอ็นเอ พลาสมิดเป็น DNA นอกโครโมโซมที่มีอยู่ในเซลล์แบคทีเรียส่วนใหญ่ พวกมันคือ DNA ทรงกลมที่อยู่เฉยๆ ซึ่งช่วยให้แบคทีเรียสามารถอยู่รอดได้ในสภาวะแวดล้อมที่รุนแรง พลาสมิด DNA ประกอบด้วยยีนต้านทานพิเศษที่ให้ข้อดีเพิ่มเติมแก่แบคทีเรีย เช่น การดื้อยาปฏิชีวนะ คุณสมบัติของไวรัส และคุณสมบัติเป็นพิษ
รูปที่ 02: การแยก DNA พลาสมิด
การแยกดีเอ็นเอด้วยพลาสมิดยังเกี่ยวข้องกับสามกระบวนการหลัก การสลายเซลล์ การสลายโปรตีน และการตกตะกอนของ DNA แม้ว่ากลไกการแยกทางชีวเคมีจะคล้ายคลึงกับกลไกการแยก DNA ของจีโนม แต่กระบวนการนี้ซับซ้อนกว่ากระบวนการ กระบวนการสลายเซลล์เป็นกระบวนการที่สำคัญที่สุดในขั้นตอนนี้ สิ่งสำคัญที่สุดคือไม่ควรผสมจีโนม DNA และพลาสมิด DNA เข้าด้วยกัน ดังนั้น กระบวนการสลายที่เบากว่ามากจึงรวมเข้ากับขั้นตอนการแยกพลาสมิดดีเอ็นเอ ดังนั้นในขั้นตอนการแยก DNA พลาสมิดส่วนใหญ่จึงใช้ผงซักฟอก โซเดียมโดเดซิลซัลเฟตสำหรับการสลายเซลล์
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง Genomic DNA และ Plasmid DNA Isolation คืออะไร
- การแยก DNA และ Plasmid DNA มุ่งเน้นไปที่การแยก DNA ของสิ่งมีชีวิต
- นอกจากนี้ ทั้งคู่ยังปฏิบัติตามกระบวนการโดยรวมที่เหมือนกัน ซึ่งรวมถึงการแยกเซลล์ การย่อยสลายโปรตีน และการตกตะกอนของ DNA
- ยิ่งไปกว่านั้น DNA ที่ได้จากกระบวนการทั้งสองมีความสำคัญสำหรับกระบวนการปลายน้ำ
- ยิ่งกว่านั้น กระบวนการแยกทั้งสองแบบยังมีขั้นตอนในการทำให้บริสุทธิ์และจัดเก็บ DNA ภายใต้สภาวะการจัดเก็บที่กำหนด
- นอกจากนี้โปรตีน K ยังใช้ในทั้งสองวิธีในการย่อยสลายโปรตีน
ความแตกต่างระหว่าง Genomic DNA และ Plasmid DNA Isolation คืออะไร
การแยก DNA ของจีโนมมุ่งเน้นไปที่การแยกจีโนม DNA ทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย ในขณะที่การแยก DNA พลาสมิดมุ่งเน้นไปที่การแยกเฉพาะพลาสมิด DNA ออกจากแบคทีเรียบางชนิดโดยเฉพาะ ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างการแยกจีโนม DNA และการแยก DNA พลาสมิด นอกจากนี้ ความแตกต่างอีกประการระหว่างการแยกจีโนม DNA และการแยก DNA พลาสมิดอยู่ในขั้นตอน การแยกจีโนมดีเอ็นเอเป็นขั้นตอนที่ซับซ้อนน้อยกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับการแยกดีเอ็นเอในพลาสมิด ดังนั้น เมื่อแยกพลาสมิดดีเอ็นเอ จำเป็นต้องใช้ความระมัดระวังเพื่อป้องกันการผสมของจีโนมและพลาสมิด DNA เข้าด้วยกัน
Infograohic ด้านล่างให้รายละเอียดเพิ่มเติมเกี่ยวกับความแตกต่างระหว่างการแยกจีโนม DNA และการแยก DNA พลาสมิด
Summary – การแยก DNA ของจีโนมกับการแยก DNA ของพลาสมิด
การแยก DNA เป็นกระบวนการที่สำคัญในเทคนิคอณูชีววิทยา DNA มีสองประเภทคือ DNA จีโนมและ DNA พลาสมิด (DNA นอกโครโมโซม) ตามข้อกำหนด ขั้นตอนบางอย่างดำเนินการเพื่อแยกจีโนม DNA ในขณะที่บางขั้นตอนเน้นที่การแยกเฉพาะพลาสมิด DNA ออกจากแบคทีเรีย ดังนั้นขั้นตอนที่เกี่ยวข้องในกระบวนการทั้งสองจึงแตกต่างกันเล็กน้อย อย่างไรก็ตาม กระบวนการโดยรวมจะเหมือนกันในการแยกทั้งสอง DNA ที่แยกจากกันของทั้งสองกระบวนการมีการใช้อย่างมหาศาลในกระบวนการปลายน้ำ เช่น การโคลนนิ่ง ปฏิกิริยาเจลอิเล็กโตรโฟรีซิส และปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสในตอนท้ายของโปรโตคอลการแยก DNA ของจีโนม จีโนม DNA ทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตสามารถถูกแยกออกเป็นผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย ในขณะที่ที่ส่วนท้ายของโปรโตคอลการแยก DNA พลาสมิด พลาสมิด DNA ของแบคทีเรียตามลำดับสามารถถูกแยกออกเป็นผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย ดังนั้น นี่คือความแตกต่างระหว่างการแยกจีโนม DNA และการแยก DNA พลาสมิด