ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง PCR ที่เป็นเอกฉันท์และ PCR แบบแพนคือ PCR ฉันทามติมักจะกำหนดเป้าหมายไปยังภูมิภาคที่ได้รับการอนุรักษ์ ในขณะที่ Pan PCR กำหนดเป้าหมายภูมิภาคที่แปรผันเพื่อระบุสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของกลุ่ม
ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส (PCR) เป็นเทคนิคการขยายยีนที่ประกอบด้วยสามขั้นตอนหลักคือ การทำให้เสียสภาพ การหลอม และการขยาย ใช้กันอย่างแพร่หลายในการวินิจฉัยและการระบุโมเลกุล เทคนิค PCR ที่เป็นเอกฉันท์และเทคนิค Pan PCR ขึ้นอยู่กับเป้าหมายไพรเมอร์ที่ PCR แต่ละประเภทใช้
Consensus PCR คืออะไร
Consensus PCR เป็นเทคนิค PCR ที่กำหนดเป้าหมายไปยังพื้นที่อนุรักษ์สำหรับสายพันธุ์หรือสกุลเฉพาะดังนั้นจึงเลือกภูมิภาคที่มีการอนุรักษ์สูงสำหรับการขยายสัญญาณ ด้วยวิธีนี้ สิ่งมีชีวิตสามารถระบุและแยกแยะได้โดยอาศัยฉันทามติ วิธีนี้จะระบุพื้นที่อนุรักษ์สำหรับสปีชีส์เฉพาะ ตัวอย่างเช่น บริเวณ 16s rRNA ของแบคทีเรียยังคงเป็นพื้นที่อนุรักษ์ท่ามกลางแบคทีเรีย ดังนั้นจึงต้องใช้ชุดไพรเมอร์เพียงชุดเดียวสำหรับการขยายเสียง ในกรณีส่วนใหญ่ สามารถใช้ไพรเมอร์สากลเฉพาะสำหรับพื้นที่อนุรักษ์
รูปที่ 01: เทคนิค PCR
โดยการปฏิบัติตามวิธี PCR ที่เป็นเอกฉันท์ จะสามารถสรุปลักษณะเฉพาะของสปีชีส์และความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการได้ ขึ้นอยู่กับประสิทธิภาพการขยายเสียงของสิ่งมีชีวิตตัวอย่างโดยเฉพาะ เราสามารถอนุมานฉันทามติของสิ่งมีชีวิตที่มีต่อกลุ่มได้ นอกจากนี้ การทำ PCR ฉันทามติมีความสำคัญในการศึกษาสายวิวัฒนาการอนุญาตให้ระบุสายพันธุ์และตีความความเบี่ยงเบนของสิ่งมีชีวิตเฉพาะที่แสดงในแง่ของบรรพบุรุษร่วมกัน
Pan PCR คืออะไร
A Pan PCR เป็นโหมดมัลติเพล็กซ์ของ PCR ในเทคนิคนี้ สายพันธุ์ต่างๆ จะถูกขยายโดยใช้ไพรเมอร์เป้าหมายต่างๆ อย่างไรก็ตาม เป้าหมายสามารถเป็นเป้าหมายทั่วไปสำหรับกลุ่มความเครียดได้ ดังนั้นใน Pan PCR จึงสามารถใช้ชุดไพรเมอร์ได้มากกว่าสองชุดในคราวเดียว มันสามารถเกิดขึ้นในวิธีปฏิกิริยาหลอดเดียวหรือเป็นวิธีปฏิกิริยาหลายหลอด Pan PCR ใช้เวลานานและซับซ้อนกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับ PCR ที่เป็นเอกฉันท์ ด้วยเหตุนี้ การตีความผลลัพธ์ PCR จึงอาจซับซ้อนกว่าใน Pan PCR
แอปพลิเคชั่นหลักของ Pan PCR อยู่ในการวินิจฉัยระดับโมเลกุล ช่วยให้แยกแยะความแตกต่างระหว่างสายพันธุ์ต่างๆ ได้ด้วยการขยายสัญญาณเป้าหมาย Pan PCR เป็นเทคนิคในอุดมคติในการระบุสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของสายพันธุ์เดียวที่ก่อให้เกิดโรค ในกรณีส่วนใหญ่ เทคนิค Pan PCR แบบอัตโนมัติสำหรับสภาวะสุขภาพต่างๆ มีความสำคัญมาก และเป็นเทคนิคที่น่าเชื่อถือและมีประสิทธิภาพสูง
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง Consensus PCR และ Pan PCR คืออะไร
- Consensus PCR และ Pan PCR เป็นเทคนิค PCR สองประเภท
- ทั้งสองขั้นตอนปฏิบัติตามขั้นตอนสามขั้นตอนทั่วไป – การทำให้เสียสภาพ การหลอม และการขยาย
- พวกเขาใช้ไพรเมอร์ที่เป็นเป้าหมายเฉพาะ
- ปฏิกิริยาทั้งสองเกิดขึ้นในวงจรความร้อน
- ปฏิกิริยาเหล่านี้เป็นไปโดยอัตโนมัติ
- ทั้งสองสามารถใช้ในการวินิจฉัยและการระบุระดับโมเลกุล อย่างไรก็ตามความแม่นยำแตกต่างกันไป
- ขั้นตอนเหล่านี้ต้องมีการตรวจสอบ
ความแตกต่างระหว่าง Consensus PCR และ Pan PCR ต่างกันอย่างไร
ทั้ง Consensus และ Pan PCR ทำตามขั้นตอนเดียวกัน อย่างไรก็ตาม ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง Consensus PCR และ Pan PCR นั้นขึ้นอยู่กับเป้าหมายของไพรเมอร์ที่แต่ละขั้นตอนใช้ แม้ว่า PCR ที่เป็นเอกฉันท์จะกำหนดเป้าหมายไปยังพื้นที่ที่อนุรักษ์ไว้เสมอ แต่ Pan PCR จะกำหนดเป้าหมายไปยังพื้นที่ที่แปรผันเพื่อระบุสายพันธุ์ต่างๆ ของกลุ่มเนื่องจากความแตกต่างนี้ โปรโตคอลการออกแบบไพรเมอร์ จำนวนชุดไพรเมอร์ที่ใช้ และแอปพลิเคชันเฉพาะจึงแตกต่างกัน
อินโฟกราฟิกด้านล่างสรุปความแตกต่างระหว่าง Consensus PCR และ Pan PCR
สรุป – Consensus PCR vs Pan PCR
PCR นำเสนอโดย Mulli มีบทบาทสำคัญในการปฏิวัติการประยุกต์ใช้ชีววิทยาระดับโมเลกุล ฉันทามติและ Pan PCR เป็น PCR สองประเภทตามพื้นที่เป้าหมายไพรเมอร์ แม้ว่า PCR ที่เป็นเอกฉันท์จะกำหนดเป้าหมายไปยังพื้นที่ที่ได้รับการอนุรักษ์ Pan PCR จะกำหนดเป้าหมายไปยังพื้นที่ที่แปรผันได้และมีบทบาทสำคัญในการระบุสายพันธุ์ เนื่องจากความแตกต่างพื้นฐานระหว่าง PCR ฉันทามติและ Pan PCR หน้าที่เฉพาะของ PCR แต่ละประเภทจึงแตกต่างกันไปตั้งแต่การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการไปจนถึงการกำหนดลักษณะโมเลกุลไปจนถึงการวินิจฉัยระดับโมเลกุล
