ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง NGS และ WGS คือการจัดลำดับยุคหน้า (NGS) เป็นเทคโนโลยีการจัดลำดับรุ่นที่สองคู่ขนานอย่างหนาแน่นที่มีปริมาณงานสูง ต้นทุนต่ำ และรวดเร็ว ในขณะที่การจัดลำดับทั้งจีโนม (WGS) คือ วิธีการที่ครอบคลุมในการวิเคราะห์จีโนม DNA ทั้งหมดของเซลล์ในคราวเดียวโดยใช้เทคนิคการหาลำดับ เช่น การจัดลำดับแซงเจอร์ แนวทางปืนลูกซอง หรือการจัดลำดับ NGS ปริมาณงานสูง
ในช่วงสองสามทศวรรษที่ผ่านมา ความเข้าใจเกี่ยวกับจีโนมของมนุษย์และสัตว์อื่นๆ เพิ่มขึ้นอย่างมากเนื่องจากการค้นพบเทคนิคการเรียงลำดับอย่างรวดเร็วและเครื่องมือชีวสารสนเทศ เทคนิคการหาลำดับแบบทั่วไป เช่น Sanger sequencing มีข้อจำกัด ซึ่งเรียกร้องให้มีการพัฒนาวิธีการจัดลำดับอย่างรวดเร็วแบบใหม่ เช่น การจัดลำดับยุคหน้า (NGS) และการจัดลำดับนาโนพอร์เทคนิคการจัดลำดับจีโนมทั้งหมด (WGS) เป็นแนวทางล่าสุดที่ใช้อยู่แล้วในโครงการวิจัยเกี่ยวกับจีโนมหลายโครงการ เช่น โครงการจีโนม 100,000 โครงการโดย Genomic England สหราชอาณาจักร ดังนั้น NGS และ WGS จึงเป็นวิธีการจัดลำดับสองวิธีที่กำลังรวมเข้ากับโปรเจ็กต์จีโนมจำนวนมากในปัจจุบัน
NGS คืออะไร
NGS (การจัดลำดับรุ่นต่อไป) เป็นเทคโนโลยีการจัดลำดับรุ่นที่สองคู่ขนานอย่างหนาแน่นซึ่งมีปริมาณงานสูง ต้นทุนต่ำ และรวดเร็ว ไม่มีคำจำกัดความที่ชัดเจนสำหรับการจัดลำดับยุคหน้า แต่เราสามารถแยกแยะได้อย่างชัดเจนจากเทคนิคการหาลำดับตามเส้นเลือดฝอยทั่วไป การหาลำดับยุคต่อไปช่วยให้สามารถจัดลำดับโมเลกุล DNA ที่มีขนาดโดยรวมที่ใหญ่กว่า 1 ล้านคู่เบสในการทดลองครั้งเดียว นำเสนอความเร็วที่ไม่เคยมีมาก่อนและตัวเลือกปริมาณงานสูง เช่น การอนุญาตการจัดลำดับ DNA ของบุคคลหลาย ๆ คนพร้อมกัน สิ่งนี้ทำได้โดยการลดปริมาณของปฏิกิริยาการหาลำดับแต่ละตัวให้เล็กลง นอกจากนี้ สิ่งนี้ยังจำกัดขนาดของเครื่องมือและลดต้นทุนของรีเอเจนต์ต่อปฏิกิริยาให้เหลือน้อยที่สุด
รูปที่ 01: แพลตฟอร์ม NGS
NGS เป็นวิธีการจัดลำดับแบบอ่านสั้นที่ปฏิวัติสาขาการวิจัยทางชีววิทยาไปแล้ว นอกจากนี้ NGS ยังถูกนำไปใช้ในด้านต่างๆ เช่น การหาลำดับจีโนมเดอโนโว การหาลำดับจีโนมทั้งหมด การวิเคราะห์การถอดรหัส การจัดลำดับอาร์เอ็นเอขนาดเล็กและไมโครอาร์เอ็นเอ การหาลำดับเป้าหมายใหม่ และการจัดลำดับทั้งหมด
WGS คืออะไร
WGS (การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด) เป็นวิธีการที่ครอบคลุมในการวิเคราะห์ DNA จีโนมทั้งหมดของเซลล์ในคราวเดียวโดยใช้เทคนิคการหาลำดับ เช่น การจัดลำดับ Sanger แนวทางปืนลูกซอง หรือการเรียงลำดับ NGS ปริมาณงานสูง เป็นที่รู้จักกันว่าการจัดลำดับจีโนมเต็มรูปแบบหรือการจัดลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดทำให้เกิดการจัดลำดับดีเอ็นเอโครโมโซมของสิ่งมีชีวิตทั้งหมด รวมทั้งดีเอ็นเอในไมโตคอนเดรีย และสำหรับพืช ดีเอ็นเอในคลอโรพลาสต์ในคราวเดียวWGS ช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถอ่านลำดับตัวอักษรทั้งหมดที่ประกอบขึ้นเป็นชุดของ DNA ได้อย่างแม่นยำ WGS ที่ใช้แพลตฟอร์ม NGS คาดว่าจะปฏิวัติการตั้งค่าทางคลินิก
รูปที่ 02: WGS เทียบกับลำดับปืนลูกซองลำดับ
การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดถูกนำมาใช้ในการดูแลทางคลินิกในปี 2014 นอกจากนี้ การประยุกต์ใช้ WGS ยังเกี่ยวข้องกับการจัดลำดับยีนที่ระดับ SNP เพื่อระบุรูปแบบการทำงานในการศึกษาความสัมพันธ์ การแทรกแซงการรักษาในการแพทย์เฉพาะบุคคล ชีววิทยาวิวัฒนาการ การวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบ, การศึกษาการกลายพันธุ์และการจัดเรียงใหม่, การศึกษาความสัมพันธ์ของตัวแปรที่หายาก และการคาดการณ์ความไวต่อโรคและการตอบสนองต่อยา
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง NGS และ WGS คืออะไร
- NGS และ WGS เป็นสองเทคนิคการเรียงลำดับ
- ทั้งสองเทคนิคทั้งลำดับ DNA หรือ RNA
- เทคนิคเหล่านี้เป็นของใหม่และเชื่อถือได้
- ใช้ในการวินิจฉัยโรคและการค้นพบยา
ความแตกต่างระหว่าง NGS และ WGS คืออะไร
NGS เป็นเทคโนโลยีการหาลำดับที่สองคู่ขนานกันอย่างหนาแน่นที่มีปริมาณงานสูง ต้นทุนต่ำ และรวดเร็ว ในขณะที่ WGS เป็นวิธีการวิเคราะห์จีโนม DNA ทั้งหมดของเซลล์อย่างครอบคลุมในคราวเดียวโดยใช้เทคนิคการหาลำดับ เช่น เช่น การจัดลำดับ Sanger แนวทางปืนลูกซอง หรือการจัดลำดับ NGS ปริมาณงานสูง นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง NGS และ WGS นอกจากนี้ NGS ยังประกอบด้วยวิธีการจัดลำดับรุ่นที่สองเท่านั้น ในขณะที่ WGS ประกอบด้วยวิธีการจัดลำดับรุ่นที่หนึ่ง สอง และสาม
ตารางต่อไปนี้แสดงความแตกต่างระหว่าง NGS และ WGS ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – NGS vs WGS
ในทศวรรษที่ผ่านมา มีการใช้เทคนิคการเรียงลำดับที่แตกต่างกันเป็นประจำในการวิจัยระดับโมเลกุลร่วมสมัย และถึงแม้จะเป็นเครื่องมือที่ทรงพลังมากสำหรับการใช้งานทางคลินิกหลายอย่าง NGS และ WGS เป็นวิธีการจัดลำดับสองวิธีที่กำลังรวมเข้ากับโครงการจีโนมหลายโครงการ NGS เป็นเทคโนโลยีการจัดลำดับรุ่นที่สองที่มีปริมาณงานสูง ต้นทุนต่ำ และรวดเร็ว ในทางกลับกัน WGS เป็นวิธีการวิเคราะห์จีโนม DNA ทั้งหมดหรือ DNA จีโนมเต็มรูปแบบของเซลล์ในคราวเดียวโดยใช้เทคนิคการหาลำดับ เช่น Sanger sequencing วิธีปืนลูกซอง หรือการเรียงลำดับ NGS ปริมาณงานสูง นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่าง NGS และ WGS
