ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง LINE และ SINE คือ LINE (องค์ประกอบนิวเคลียร์แบบกระจายยาว) เป็นประเภท retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR ที่ยาวกว่า ในขณะที่ SINE (องค์ประกอบนิวเคลียร์แบบกระจายสั้น) เป็นประเภท retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR ที่สั้นกว่ามาก
การขนส่งแบบไม่มี LTR ไม่มีการทำซ้ำของขั้วต่อแบบยาว (LTR) อย่างไรก็ตาม พวกมันมียีนสำหรับ reverse transcriptase, RNA binding protein, nuclease และโดเมน ribonuclease H ทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR มีการทำซ้ำแบบสั้น การทำซ้ำเหล่านี้มีลำดับฐานที่อยู่ติดกัน นอกจากนั้น ทรานสโพซอนที่ไม่ใช่ LTR ยังมีการทำซ้ำโดยตรงที่พบในทรานสโพซอน LRTทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR แบ่งออกเป็นสองประเภทคือ LINE และ SINE
LINE คืออะไร
LINEs (องค์ประกอบนิวเคลียร์แบบกระจายยาว) เป็นแบบย้อนยุคที่ไม่ใช่ LTR ที่ยาวกว่า พวกมันแพร่หลายในจีโนมของยูคาริโอต พวกเขามักจะคิดเป็น 21.1% ของจีโนมมนุษย์ แต่ละ LINE มีความยาวประมาณ 7000 คู่เบส LINE สามารถถ่ายทอดเป็น mRNA และแปลเป็นโปรตีนที่สามารถทำหน้าที่เป็นเอนไซม์ reverse transcriptase ทรานสคริปเทสแบบย้อนกลับนี้สร้างสำเนา DNA ของ LINEs RNA สำเนาดีเอ็นเอเหล่านี้สามารถรวมเข้ากับจีโนมได้ที่ไซต์ใหม่
รูปที่ 01: LINEs และ SINE
จีโนมมนุษย์มี LINE มากมายเพียงเส้นเดียวที่เรียกว่า LINE-1 องค์ประกอบ LINE-1 มีความยาวประมาณ 6000 คู่เบส มีองค์ประกอบ LINE-1 ที่ถูกตัดทอนประมาณ 100,000 รายการในจีโนมมนุษย์การกลายพันธุ์แบบสุ่มสามารถเกิดขึ้นได้ใน LINE เนื่องจากการกลายพันธุ์แบบสุ่ม LINE สามารถเสื่อมสภาพได้ ไม่มีการถอดเสียงหรือแปลอีกต่อไป นอกจากนี้ LINE ยังแบ่งออกเป็น 5 กลุ่มหลัก เช่น L1, RTE, R2, I และ jockey ห้ากลุ่มนี้แบ่งออกเป็นอีก 28 กลุ่มเพิ่มเติม
LINEs มักจะแพร่กระจายผ่านกลไกที่เรียกว่ากลไกการถอดรหัสแบบย้อนกลับเป้าหมายไพรเมอร์ (TPRT) การแทรก LINEs ทำให้เกิดโรคของมนุษย์ เช่น ฮีโมฟีเลีย A, มะเร็ง, โรคเมนเดเลียน เป็นต้น ภาวะไฮโปเมทิลเลชันของ LINEs ยังทำให้เกิดมะเร็งบางชนิดอีกด้วย
SINE คืออะไร
SINEs (ธาตุนิวเคลียสแบบกระจายแบบสั้น) เป็นประเภทรีโทรทรานสโปซอนที่ไม่ใช่ LTR ที่สั้นกว่ามาก มีความยาวประมาณ 100 ถึง 700 คู่เบส SINE ยังเป็นองค์ประกอบของ DNA ที่ขยายตัวเองไปทั่วจีโนมของยูคาริโอตผ่านตัวกลาง RNA SINEs ประกอบขึ้นประมาณ 13% ของจีโนมของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม บริเวณภายในของ SINE มาจาก tRNA ยังคงอนุรักษ์ไว้อย่างสูงมักพบในสัตว์มีกระดูกสันหลังและสัตว์ไม่มีกระดูกสันหลังหลายสายพันธุ์ การแปรผันของจำนวนสำเนาและการกลายพันธุ์ใน SINE สามารถนำมารวมกันเพื่อสร้างการจำแนกประเภทตามสายวิวัฒนาการของสปีชีส์
SINE สามารถแบ่งออกเป็นสามประเภทหลัก: CORE-SINE, V-SINE และ AmnSINE องค์ประกอบ Alu เป็น SINE ที่พบมากที่สุดในบิชอพ นอกจากนี้ยังมีโรคของมนุษย์มากกว่า 50 โรคที่เกี่ยวข้องกับการแทรก SINE เมื่อสอดเข้าไปภายในหรือใกล้กับ exons อาจทำให้เกิดการต่อต่อที่ไม่เหมาะสมหรือเปลี่ยนกรอบการอ่าน สิ่งนี้นำไปสู่ฟีโนไทป์ของโรค เช่น มะเร็งเต้านม มะเร็งลำไส้ มะเร็งเม็ดเลือดขาว ฮีโมฟีเลีย ซีสติกไฟโบรซิส มะเร็งลำไส้ โรคบุ๋ม โรคเส้นประสาทอักเสบ เป็นต้น
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง LINE และ SINE คืออะไร
- LINEs และ SINEsเป็นทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR สองประเภท
- ทั้งสองไม่มีบริเวณขั้วยาว (LTR)
- ทั้งสองส่วนใหญ่พบในยูคาริโอตเท่านั้น
- ทั้งคู่ไม่ใช่อิสระ
LINE กับ SINE ต่างกันอย่างไร
LINE นั้นยาวกว่า retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR ในขณะที่ SINE นั้นสั้นกว่า retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR มาก นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง LINE และ SINE นอกจากนี้ รหัส LINES สำหรับเอนไซม์ reverse transcriptase ในขณะที่ SINE ไม่ได้เข้ารหัสสำหรับเอนไซม์ reverse transcriptase ดังนั้น นี่จึงเป็นข้อแตกต่างระหว่าง LINE และ SINE
ความแตกต่างเพิ่มเติมระหว่าง LINE และ SINE แสดงไว้ด้านล่างในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – LINEs vs SINEs
Retrotransposons ส่วนใหญ่จะพบในยูคาริโอตทั้งหมด แต่ไม่มีในโปรคาริโอต จีโนมมนุษย์ประมาณ 37% มี retrotransposons Retrotransposons ส่วนใหญ่มีสองประเภท: LTR และ Non-LTR retrotransposons รีโทรทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR ไม่มีรีพีทเทอร์มินอลยาว (LTR) ซึ่งมีอยู่ในรีโทรทรานส์โพซอนของ LTRทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR แบ่งออกเป็นสองประเภทเพิ่มเติม: LINEs และ SINE LINE เป็นรีโทรทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR ที่ยาวกว่า ในขณะที่ SINE นั้นสั้นกว่ารีโทรทรานสโปซอนที่ไม่ใช่ LTR มาก ดังนั้น นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่าง LINE และ SINE
