เอนไซม์เทียบกับโปรตีน
โปรตีนและเอ็นไซม์เป็นโมเลกุลทางชีววิทยา ประกอบด้วยกรดอะมิโนจำนวนมากที่เชื่อมโยงกันเป็นสายโซ่เชิงเส้น กรดอะมิโนเป็นหน่วยโครงสร้างและหน้าที่พื้นฐานของโมเลกุลขนาดใหญ่เหล่านี้ โมเลกุลของกรดอะมิโนประกอบด้วยกลุ่มพื้นฐานสี่กลุ่ม คือ หมู่อะมิโน สายโซ่ข้าง (R- group) หมู่คาร์บอกซิล และไฮโดรเจนอะตอม ซึ่งถูกพันธะกับอะตอมของคาร์บอนตรงกลาง โดยพื้นฐานแล้วมีกรดอะมิโนที่เกิดขึ้นตามธรรมชาติ 20 ชนิด และต่างกันที่สายโซ่ข้าง (R-group) เท่านั้น ลำดับของกรดอะมิโนกำหนดโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีนและเอนไซม์
เอ็นไซม์
เอ็นไซม์เป็นโปรตีนทรงกลมสามมิติพิเศษที่สามารถทำหน้าที่เป็นโมเลกุลทางชีววิทยา เพื่อกระตุ้นและควบคุมปฏิกิริยาเคมีในสิ่งมีชีวิต ในเซลล์เดียว มีเอ็นไซม์ต่างๆ นับพันชนิด นั่นเป็นเพราะเกือบทุกปฏิกิริยาในเซลล์ต้องการเอนไซม์เฉพาะของตัวเอง โดยปกติ เอนไซม์จะทำให้ปฏิกิริยาของเซลล์เกิดขึ้นได้เร็วกว่าปฏิกิริยาที่ไม่เร่งปฏิกิริยาที่สอดคล้องกันถึงล้านเท่า ไซต์แอคทีฟที่ปรากฏบนผิวของเอนไซม์เป็นตัวกำหนดระดับความจำเพาะ ประเภทของความจำเพาะของเอนไซม์รวมถึงความจำเพาะแบบสัมบูรณ์ ความจำเพาะทางสเตอริโอเคมี ความจำเพาะของกลุ่ม และความจำเพาะในการเชื่อมโยง แอคทีฟไซต์คือรอยแตกหรือโพรงบนพื้นผิวของเอนไซม์ที่เกิดจากการก่อตัวของโครงสร้างตติยภูมิ ไซต์ที่มีฤทธิ์บางตัวจับสารประกอบเฉพาะเพียงชนิดเดียว ในขณะที่บางไซต์สามารถจับกลุ่มของสารประกอบที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดได้ เอนไซม์ไม่ได้รับผลกระทบจากปฏิกิริยาที่กระตุ้น ปัจจัยที่ส่งผลต่อการทำงานของเอนไซม์มี 4 ประการ คือ อุณหภูมิ pH ความเข้มข้นของสารตั้งต้น และความเข้มข้นของเอนไซม์
โปรตีน
โปรตีนเป็นโมเลกุลขนาดใหญ่ทางชีววิทยาที่มีความหลากหลายมากที่สุด ทั้งในด้านการทำงานและโครงสร้าง พวกมันคือพอลิเมอร์ของกรดอะมิโน ลำดับของกรดอะมิโนเป็นตัวกำหนดโครงสร้างพื้นฐานและหน้าที่ของพวกมัน หน้าที่พื้นฐานของโปรตีน ได้แก่ การเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์ การป้องกัน การขนส่ง การสนับสนุน การเคลื่อนไหว การควบคุม และการเก็บรักษา โครงสร้างของโปรตีนสามารถแสดงเป็นลำดับชั้นได้สี่ระดับ ประถมศึกษา มัธยมศึกษา อุดมศึกษา และควอเทอร์นารี ลำดับกรดอะมิโนเป็นโครงสร้างหลักของโปรตีน การสร้างโครงสร้างทุติยภูมิเกิดจากการทำงานร่วมกันของกลุ่มในแกนหลักของเปปไทด์กับการก่อตัวของพันธะไฮโดรเจน สิ่งนี้สร้างโครงสร้างที่แตกต่างกันสองประเภทคือ บีตา (β) – แผ่นจีบ และอัลฟ่า (α) – เกลียวหรือขดลวด ในที่สุดการพับและการเชื่อมโยงของโมเลกุลโปรตีนก็สร้างรูปร่างสามมิติที่เรียกว่าโครงสร้างตติยภูมิ โปรตีนที่มีโพลีเปปไทด์หลายตัวทำให้เกิดโครงสร้างควอเตอร์นารี
เอนไซม์กับโปรตีนต่างกันอย่างไร
• เอ็นไซม์ทั้งหมดเป็นโปรตีนทรงกลม แต่ไม่ใช่โปรตีนทั้งหมดที่เป็นทรงกลม โปรตีนบางชนิดมีลักษณะเป็นทรงกลมแต่บางชนิดไม่ใช่ (เส้นใยมีโครงสร้างบางยาว)
• เอนไซม์สามารถทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยา กระตุ้นและควบคุมปฏิกิริยาทางชีวภาพต่างจากโปรตีนอื่นๆ
• เอ็นไซม์เป็นโปรตีนที่ทำหน้าที่ ในขณะที่โปรตีนสามารถทำหน้าที่หรือโครงสร้างได้
• เอ็นไซม์ต่างจากโปรตีนอื่นๆ ตรงที่เอ็นไซม์เป็นโมเลกุลจำเพาะของซับสเตรทสูง
• โปรตีนสามารถย่อยหรือย่อยสลายได้ด้วยเอนไซม์ (โปรตีเอส)