ความแตกต่างที่สำคัญ – DNA ต้นน้ำกับปลายน้ำ
การมีความรู้ทั่วไปเกี่ยวกับองค์ประกอบและโครงสร้างของ DNA เป็นสิ่งสำคัญเพื่อที่จะเข้าใจความแตกต่างระหว่าง DNA ต้นน้ำและปลายน้ำ DNA ประกอบด้วยสายโซ่โพลีนิวคลีโอไทด์ นิวคลีโอไทด์เป็นหน่วยการสร้างที่สร้างสายพอลินิวคลีโอไทด์และนิวคลีโอไทด์แต่ละตัวทำมาจากองค์ประกอบสามส่วน ได้แก่ น้ำตาลคาร์บอน 5 อะตอม เบสไนโตรเจน และกลุ่มฟอสเฟต หมู่ฟอสเฟตและหมู่ OH ถูกยึดติดกับคาร์บอนตำแหน่ง 5’ และคาร์บอนตำแหน่ง 3’ ของโมเลกุลน้ำตาลในนิวคลีโอไทด์ตามลำดับ นิวคลีโอไทด์ถูกเชื่อมเข้าด้วยกันโดยพันธะฟอสโฟไดสเตอร์ที่เกิดขึ้นระหว่างหมู่ฟอสเฟต 5’ ของนิวคลีโอไทด์หนึ่งตัวและกลุ่ม OH 3’ ของนิวคลีโอไทด์ที่อยู่ติดกันถ้าสายพอลินิวคลีโอไทด์มีหมู่ฟอสเฟตอิสระ 5’ จะถูกกำหนดให้เป็นปลาย 5’ หากมีกลุ่ม OH ฟรี 3' จะถูกกำหนดให้เป็น 3' end ดังนั้นสาย DNA มักจะมีปลาย 5’ และ 3’ ตามตำแหน่งสิ้นสุดของสายพอลินิวคลีโอไทด์ ดีเอ็นเอยังมีอยู่ในรูปแบบที่มีเกลียวคู่ เกลียวสองเส้นนั้นขนานกัน ดังนั้น DNA จึงมีเส้นสองเส้นซึ่งวิ่งไปในทิศทาง 5’ ถึง 3’ และ 3’ ถึง 5’ DNA ต้นน้ำและปลายน้ำอ้างอิงถึงการถอดรหัสและการสังเคราะห์ของสาย mRNA 5’ ถึง 3’ หากพิจารณา DNA ที่ปลายสาย 5 ของสายการเข้ารหัสจากไซต์เริ่มต้นการถอดรหัส จะเรียกว่า DNA ต้นน้ำ ถ้าพิจารณา DNA ที่ปลาย 3’ จากสายการเข้ารหัสจากตำแหน่งเริ่มต้นการถอดรหัสเรียกว่า DNA ปลายน้ำ นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง DNA ต้นน้ำและปลายน้ำ
DNA ต้นน้ำคืออะไร
ยีนคือพันธุกรรมของหน่วยโครงสร้างและหน้าที่ซึ่งอยู่บน DNA ของสิ่งมีชีวิตมันถูกเก็บไว้พร้อมกับคำแนะนำในการสร้างโปรตีน ยีนมีบริเวณเฉพาะของโมเลกุลดีเอ็นเอ เมื่อจำเป็น มันจะถ่ายทอดและแปลเป็นโปรตีนผ่านการสังเคราะห์เส้นใย mRNA โดยปกติสายการเข้ารหัสของยีนจะวิ่งจากทิศทาง 5 'ถึง 3' เมื่อถอดเสียงแล้วจะสร้างสาย mRNA ในทิศทางเดียวกัน 5' ถึง 3' ในระหว่างการถอดความ สายแอนติเซนส์ 3’ ถึง 5’ จะทำหน้าที่เป็นสายแม่แบบและเริ่มการสังเคราะห์ mRNA มีไซต์เริ่มต้นการถอดความในยีน ด้วยการอ้างอิงถึงตำแหน่งเริ่มต้นการถอดรหัส บริเวณ DNA ที่ปลาย 5' ของสายการเข้ารหัสเรียกว่า DNA ต้นน้ำ โดยปกติโปรโมเตอร์ของยีนจะอยู่ที่บริเวณต้นน้ำของดีเอ็นเอ ในยีนของยูคาริโอต มีกล่อง TATA โปรโมเตอร์องค์ประกอบและสารเพิ่มประสิทธิภาพในบริเวณต้นน้ำของยีน บริเวณต้นน้ำของยีนถูกอ้างถึงด้วยตัวเลขติดลบ DNA ต้นน้ำของยีนมีความสำคัญสูงสุดสำหรับการถอดรหัส
DNA ปลายน้ำคืออะไร
ไซต์เริ่มต้นการถอดเสียงเรียกว่า +1 จุดของยีน บริเวณ DNA จากจุด +1 ไปยังปลายสายการเข้ารหัส 3’ เรียกว่า DNA ปลายน้ำ กล่าวอีกนัยหนึ่ง ดาวน์สตรีมของยีนมาจากไซต์เริ่มต้นการถอดรหัสไปยังส่วนท้าย 5' ของสายเทมเพลต ดังนั้น DNA ปลายทางของบริเวณยีนจึงรวมถึงหน่วยการถอดรหัสและลำดับอื่นๆ เช่น ลำดับส่วนปลาย โปรโมเตอร์สามารถมีอิทธิพลต่อลำดับปลายน้ำของยีน ส่วนปลายน้ำของยีนถูกอ้างถึงด้วยตัวเลขที่เป็นบวก DNA ปลายน้ำของยีนคือพื้นที่จริงที่ให้ผลิตภัณฑ์โปรตีน
รูปที่ 01: DNA ต้นน้ำและปลายน้ำ
DNA ต้นน้ำและปลายน้ำต่างกันอย่างไร
DNA ต้นน้ำกับปลายน้ำ |
|
| DNA บริเวณปลายลำดับที่ 5 ของลำดับการเข้ารหัสจากไซต์เริ่มต้นการถอดรหัสเรียกว่า DNA ต้นน้ำ | DNA ที่บริเวณปลายสาย 3' ของสายการเข้ารหัสจากไซต์เริ่มต้นการถอดรหัสเรียกว่า DNA ปลายทาง |
| องค์ประกอบ | |
| โปรโมเตอร์และเอนแฮนเซอร์อยู่ใน DNA ต้นน้ำ | หน่วยถอดความและลำดับการสิ้นสุดจะอยู่ใน DNA ปลายทาง |
| หมายเลข | |
| นิวคลีโอไทด์ในภูมิภาคต้นน้ำถูกอ้างถึงด้วยตัวเลขติดลบ | เรียกนิวคลีโอไทด์ด้วยจำนวนบวก |
| Function | |
| ภูมิภาคนี้มีองค์ประกอบที่จำเป็นในการควบคุมและเริ่มต้นการถอดความ | ภูมิภาคนี้มีคำแนะนำในการผลิตโปรตีนและยุติการถอดรหัส |
สรุป – DNA ต้นน้ำกับปลายน้ำ
มันง่ายที่จะระบุต้นน้ำและปลายน้ำของสาย RNA ในส่วนที่เกี่ยวกับไซต์อ้างอิง ภูมิภาคที่อยู่ตรงปลายสาย RNA 5 ฟุตเรียกว่า RNA ต้นน้ำ ในขณะที่บริเวณที่อยู่ตรงปลาย 3 นิ้วเรียกว่า RNA ปลายน้ำ อย่างไรก็ตาม ใน DNA มีสายสองเส้นที่วิ่งในทั้งสองทิศทาง 5’ ถึง 3’ และ 3’ ถึง 5’ ดังนั้นความแตกต่างระหว่าง DNA ต้นน้ำและปลายน้ำจึงมีความซับซ้อน ดังนั้นจึงมีความแตกต่างโดยอ้างอิงจากการถอดความของยีน จากตำแหน่งเริ่มต้นการถอดรหัสไปยังปลายสายประสาทสัมผัสที่ 5 บริเวณ DNA เรียกว่า DNA ต้นน้ำ ในขณะที่จากตำแหน่งเริ่มต้นการถอดรหัสไปยังปลายสายประสาทสัมผัส 3’ เรียกว่า DNA ปลายน้ำนี่คือความแตกต่างระหว่าง DNA ต้นน้ำและปลายน้ำ
