ความแตกต่างที่สำคัญ – โปรตีโอมิกส์กับทรานสคริปโตมิกส์
เทคโนโลยีโอมิกเป็นกระแสที่กำลังมาแรง โดยจะพิจารณาโมเลกุลชีวโมเลกุลต่างๆ ของสิ่งมีชีวิตในภาพรวมโดยพิจารณาจากคุณสมบัติและหน้าที่ของมัน เทคโนโลยี omic มีการใช้งานที่หลากหลาย โอมิกส์ต่างๆ ของตัวอย่างทางชีวภาพรวมถึงจีโนมิก โปรตีโอมิกส์ ทรานสคริปโตมิกส์ และเมตาโบโลมิกส์ โปรตีโอมิกส์เกี่ยวข้องกับการศึกษาโปรตีนทั้งหมดในสิ่งมีชีวิตอย่างสมบูรณ์ ถูกกำหนดให้เป็นชุดของโปรตีนที่แสดงออกมาทั้งหมดในสิ่งมีชีวิต คุณสมบัติทางโครงสร้างและหน้าที่ของมัน โปรตีนทั้งชุดจึงก่อตัวเป็นโปรตีโอมTranscriptomics คือการศึกษาที่สมบูรณ์ของโมเลกุล RNA ของผู้ส่งสาร (mRNA) ทั้งหมดที่มีอยู่ในสิ่งมีชีวิต ดังนั้นทรานสคริปโทมิกส์จึงเกี่ยวข้องกับยีนที่แสดงออกมาอย่างแข็งขันในสิ่งมีชีวิต ชุดรวมของ mRNA ในสิ่งมีชีวิตเรียกว่า ทรานสคริปโทม ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง Proteomics และ Transcriptomics ขึ้นอยู่กับประเภทของสารชีวโมเลกุล ในโปรตีโอมิกส์ จะศึกษาชุดของโปรตีนที่แสดงออกในสิ่งมีชีวิตทั้งหมด ในขณะที่ในทรานสคริปโตมิกส์ จะศึกษา mRNA ทั้งหมดของสิ่งมีชีวิต
โปรตีโอมิกส์คืออะไร
คำว่าโปรตีโอมิกส์ได้รับการประกาศเกียรติคุณในปี 1995 และถูกกำหนดในขั้นต้นให้เป็นส่วนประกอบโปรตีนทั้งหมดในเซลล์ เนื้อเยื่อ หรือสิ่งมีชีวิต ด้วยความก้าวหน้าในการศึกษาโปรตีโอมิก จึงมีการปรับเปลี่ยนให้เป็นคำศัพท์ในร่มที่รวมสาขาวิชาต่างๆ ไว้ด้วย ปัจจุบันภายใต้หัวข้อโปรตีโอมิกส์มีการศึกษาโครงสร้างการวางแนวหน้าที่การโต้ตอบการปรับเปลี่ยนการใช้งานและความสำคัญของโปรตีนดังนั้นจึงมีการวิจัยมากมายในด้านโปรตีโอมิกส์ในปัจจุบัน
การศึกษาโปรตีนครั้งแรกได้ทำขึ้นเพื่อระบุปริมาณโปรตีนใน Escherichia coli การทำแผนที่ของปริมาณโปรตีนทั้งหมดทำได้โดยใช้เจลสองมิติ (2D) เมื่อประสบความสำเร็จในเรื่องนี้ นักวิทยาศาสตร์ก็เริ่มศึกษาลักษณะเฉพาะของปริมาณโปรตีนทั้งหมดในสัตว์ เช่น หนูตะเภาและหนู ปัจจุบัน การทำแผนที่โปรตีนของมนุษย์ทำได้โดยใช้เจลอิเล็กโตรโฟรีซิส 2 มิติ
การประยุกต์ใช้โปรตีโอมิกส์
การศึกษาโปรตีโอมิกส์มีข้อดีหลายประการ เนื่องจากโปรตีนเป็นโมเลกุลที่ควบคุมกิจกรรมส่วนใหญ่เนื่องจากคุณสมบัติของตัวเร่งปฏิกิริยาของโปรตีน ดังนั้นการศึกษาโปรตีนทั้งหมดจึงสามารถให้ข้อมูลเกี่ยวกับสถานะสุขภาพของสิ่งมีชีวิตได้ แอปพลิเคชั่นบางตัวคือ;
- คำอธิบายประกอบของจีโนม: โดยการศึกษาปริมาณโปรตีนของสิ่งมีชีวิต จีโนมที่แน่นอนที่รับผิดชอบสำหรับสารประกอบโปรตีนที่ออกฤทธิ์สามารถกำหนดได้ ในสถานการณ์สมมตินี้เป็นผลมาจากจีโนมทั้งหมด การทรานส์คริปโตมิกส์และโปรตีโอมิกส์มีความสำคัญ
- การระบุโรค / การวินิจฉัย: มีการใช้โปรตีโอมิกส์ในการระบุสภาวะของโรค โดยเปรียบเทียบระหว่างผู้ที่มีสุขภาพดีกับผู้ที่ป่วย
- เพื่อแสดงการแสดงออกของโปรตีนที่ศึกษาระหว่างการทดลอง
- การดัดแปลงโปรตีนและการศึกษาปฏิสัมพันธ์: เพื่อที่จะใช้โปรตีนในหลอดทดลองหรือในสภาพร่างกาย เพื่อตัดสินสภาพการเก็บรักษาของโปรตีนที่สกัดออกมาเหล่านี้ และเพื่อศึกษาพฤติกรรมของโปรตีนในหลอดทดลอง, ในกาย และใน – วิธีซิลิโค
รูปที่ 01: โปรตีโอมิกส์
โปรตีโอมิกส์มีเทคนิคที่แตกต่างกัน
- การสกัดโปรตีนทั้งหมดและแยกโปรตีนโดยใช้เจลอิเล็กโตรโฟรีซิส 2 มิติ โปรตีนยังสามารถแยกออกได้โดยใช้โครมาโตกราฟีของเหลวประสิทธิภาพสูง (HPLC)
- การหาลำดับของโปรตีนที่สกัดโดยใช้วิธีการต่างๆ เช่น วิธีการหาลำดับของ Edmund หรือ Mass spectrometry
- เมื่อมีการระบุลำดับแล้ว คุณสมบัติโครงสร้างและการทำงานของเนื้อหาโปรตีนจะได้รับการวิเคราะห์โดยใช้ซอฟต์แวร์ที่ใช้คอมพิวเตอร์และเครื่องมือชีวสารสนเทศ
Transcriptomics คืออะไร
การถอดเสียงเป็นคำที่เพิ่งประกาศใช้เมื่อเร็วๆ นี้ Transcriptomics คือการศึกษาเนื้อหา mRNA ทั้งหมดของสิ่งมีชีวิต mRNA ทั้งหมดคือ DNA ที่แสดงออกมาในสิ่งมีชีวิตหรือเซลล์ คอลเลกชั่น mRNA ทั้งหมดจะเรียกว่าทรานสคริปต์
ขั้นตอนในการวิเคราะห์ทรานสคริปต์ ได้แก่
- การสกัด RNA การแยก mRNA โดยใช้โครมาโตกราฟีแบบเจลคอลัมน์ด้วยเม็ดบีดโพลี DT
- ลำดับของ mRNA เสร็จแล้ว
เทคโนโลยี Microarray เป็นวิธีหนึ่งที่ใช้กันทั่วไปในการระบุการถอดรหัสของสิ่งมีชีวิต เทคนิคไมโครอาร์เรย์เกี่ยวข้องกับแผ่นโพรบที่มีเกลียวเสริมของทรานสคริปโทม เมื่อมีการผสมพันธุ์ mRNA ที่มีอยู่ในสิ่งมีชีวิตหรือเซลล์สามารถระบุลักษณะได้
รูปที่ 02: เทคนิคการถอดเสียง
Transcriptomics ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในด้านการแพทย์ การวินิจฉัยโรคและการทำโปรไฟล์โรคเป็นสาขาหลักที่ใช้ทรานสคริปโทมิกส์ โดยการวิเคราะห์ทรานสคริปต์ของสิ่งมีชีวิต สามารถระบุ mRNA ต่างประเทศได้ และหากมีการติดเชื้อใดๆ ก็สามารถระบุได้ RNA ที่ไม่มีการเข้ารหัสสามารถแยกออกได้โดยใช้เทคโนโลยีการถอดรหัส และยังสามารถตรวจสอบการแสดงออกของยีนภายใต้สภาวะแวดล้อมต่างๆ ได้
ความคล้ายคลึงกันระหว่างโปรตีโอมิกส์กับทรานสคริปโทมิกส์คืออะไร
- ทั้งสองเป็นส่วนหนึ่งของแนวคิดของเทคโนโลยี omic
- ทั้งสองใช้ในการวินิจฉัยโรคและการกำหนดลักษณะโรคของสิ่งมีชีวิต
- พื้นที่การศึกษาทั้งสองเกี่ยวข้องกับการสกัดสารชีวโมเลกุล การแยกสารชีวโมเลกุล และขั้นตอนการจัดลำดับ
โปรตีโอมิกส์และทรานสคริปโตมิกต่างกันอย่างไร
Protemics vs Transcripttomics |
|
| โปรตีโอมิกส์เกี่ยวข้องกับการศึกษาโปรตีนทั้งหมดในสิ่งมีชีวิตอย่างครบถ้วน | Transcriptomics คือการศึกษาที่สมบูรณ์ของโมเลกุล RNA ของผู้ส่งสาร (mRNA) ทั้งหมดที่มีอยู่ในสิ่งมีชีวิต |
| ศึกษาประเภทโมเลกุลชีวภาพ | |
| โปรตีนถูกศึกษาในโปรตีโอมิกส์ | mRNA กำลังศึกษาอยู่ใน transcriptomics |
| ปัจจัยที่ศึกษา | |
| โครงสร้าง หน้าที่ ปฏิสัมพันธ์ การดัดแปลงและการประยุกต์ใช้โปรตีนได้รับการศึกษาในโปรตีโอมิกส์ | โครงสร้างลำดับ ปฏิสัมพันธ์กับสิ่งแวดล้อมและการประยุกต์ใช้ mRNA ในการถอดรหัส |
สรุป – โปรตีโอมิกส์กับทรานสคริปโตมิกส์
Omics มีบทบาทสำคัญในด้านวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิต โปรตีโอมิกส์หมายถึงการศึกษาโปรตีโอมซึ่งก่อให้เกิดการสะสมของโปรตีนทั้งหมดในเซลล์หรือสิ่งมีชีวิต ทรานสคริปโทมิกส์หมายถึงการศึกษาทรานสคริปโทมซึ่งเป็นชุดที่สมบูรณ์ของ DNA ที่แสดงออกมาซึ่งอยู่ในรูปของ mRNA พื้นที่การศึกษาทั้งสองส่วน ได้แก่ โปรตีโอมิกส์และทรานสคริปโตมิกส์ ได้มาจากการนำจีโนมิกส์มาใช้ และปัจจุบันใช้กันอย่างแพร่หลายในการวินิจฉัยทางการแพทย์และในการจำแนกลักษณะเฉพาะและการตรวจคัดกรองสิ่งมีชีวิต นี่คือความแตกต่างระหว่างโปรตีโอมิกส์และทรานสคริปโตมิกส์
ดาวน์โหลดไฟล์ PDF ของ Proteomics vs Transcripttomics
คุณสามารถดาวน์โหลดไฟล์ PDF ของบทความนี้และใช้เพื่อวัตถุประสงค์ออฟไลน์ตามหมายเหตุอ้างอิง โปรดดาวน์โหลดไฟล์ PDF ที่นี่: ความแตกต่างระหว่าง Proteomics และ Transcripttomics