ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างโปรตีโอมิกที่เป็นเป้าหมายและไม่ตรงเป้าหมายคือโปรตีโอมิกส์ที่เป็นเป้าหมายมีจุดมุ่งหมายเพื่อวัดความอุดมสมบูรณ์ของโปรตีนเฉพาะในขณะที่โปรตีโอมิกที่ไม่กำหนดเป้าหมายไม่ได้กำหนดเป้าหมายโปรตีนที่เฉพาะเจาะจง
โปรตีโอมิกส์คือการศึกษาโปรตีน โครงสร้าง และหน้าที่ในวงกว้าง โดยศึกษาส่วนประกอบโปรตีนทั้งหมดในเซลล์ เนื้อเยื่อ หรือสิ่งมีชีวิตภายใต้สภาวะเฉพาะ โปรตีโอมิกส์มีสองประเภทคือโปรตีโอมิกเป้าหมายและโปรตีโอมิกที่ไม่กำหนดเป้าหมาย
โปรตีโอมิกส์เป้าหมายคืออะไร
ตามชื่อของมัน โปรตีโอมิกส์เป้าหมายมุ่งเป้าไปที่โปรตีนจำเพาะหรือเปปไทด์ในส่วนผสมที่ซับซ้อนของโปรตีนเพื่อการวิเคราะห์จากนั้นจะวิเคราะห์การมีอยู่และปริมาณของโปรตีนจำเพาะที่เลือกไว้ล่วงหน้านั้น วิธีนี้ใช้ได้กับตัวอย่างเดียวเท่านั้นหรือหลายตัวอย่าง วิธีนี้เหมาะสำหรับกลุ่มโปรตีนที่เฉพาะเจาะจง ส่งผลให้ข้อมูลมีความแม่นยำ เชิงปริมาณ และละเอียดอ่อนมากขึ้น นอกจากนี้ แมสสเปกโตรเมทรีร่วมกับโปรตีโอมิกส์เป้าหมายยังสร้างการวัดที่เชื่อถือได้ที่แม่นยำยิ่งขึ้น วิธีนี้ใช้แมสสเปกโตรมิเตอร์แบบสามเท่า (QQQ) ในการวิเคราะห์
รูปที่ 01: โปรตีโอมิกส์
โปรตีโอมิกส์เป้าหมายเป็นวิธีการที่เหมาะสม หากคุณต้องการตรวจสอบว่าเป้าหมายการล้มลงนั้นถูกทำให้ล้มลงจริงหรือไม่ หรือเมื่อคุณต้องการหาปริมาณโปรตีน/เปปไทด์เฉพาะในซีรัมในเลือด น้ำในสมอง หรือในเซลล์ไลเสต เป็นต้น คุณยังสามารถ ใช้หากคุณต้องการตรวจสอบว่าโปรตีนชนิดใดชนิดหนึ่งมีการแสดงออกที่แตกต่างกันในกลุ่มตัวอย่างหรือในระหว่างการทดลองหลักสูตรเวลา
Proteomics ที่ไม่กำหนดเป้าหมายคืออะไร
โปรตีโอมิกส์ที่ไม่ได้กำหนดเป้าหมายตามชื่อที่กล่าวถึง ไม่ได้กำหนดเป้าหมายโปรตีนหรือเปปไทด์ที่เฉพาะเจาะจงสำหรับการวิเคราะห์ Discovery proteomics เป็นอีกชื่อหนึ่งของโปรตีนที่ไม่เป็นเป้าหมาย อันที่จริงมันเป็นการวิเคราะห์ที่ 'ทั่วโลก' มากกว่า โดยทั่วไป การดำเนินการโปรตีโอมิกส์ที่ไม่ตรงเป้าหมายคือการตอบคำถามว่า "โปรตีนหรือโปรตีนอะไรอยู่ในตัวอย่างนี้หรือหลายตัวอย่าง" วิธีนี้ไม่ละเอียดอ่อนเหมือนโปรตีโอมิกส์เป้าหมาย แต่สามารถระบุและวัดโปรตีนได้หลายชนิด รวมทั้งโปรตีนชนิดใหม่ โปรตีโอมิกส์ที่ไม่ตรงเป้าหมายสามารถให้ทั้งการวัดเชิงปริมาณและเชิงคุณภาพ
ความคล้ายคลึงกันระหว่างโปรตีโอมิกส์ที่เป็นเป้าหมายและไม่ตรงเป้าหมายคืออะไร
- โปรตีโอมิกทั้งแบบกำหนดเป้าหมายและไม่กำหนดเป้าหมายจะวัดโปรตีนในตัวอย่าง
- มีความสำคัญในการวิเคราะห์โปรตีน
- วิธีการเหล่านี้ใช้แมสสเปกโตรเมตรี
โปรตีโอมิกที่กำหนดเป้าหมายและไม่กำหนดเป้าหมายแตกต่างกันอย่างไร
ประการแรก โปรตีโอมิกส์เป้าหมายคือการกำหนดการมีอยู่และปริมาณของโปรตีนหรือเปปไทด์เฉพาะในส่วนผสมที่ซับซ้อนของโปรตีน ในทางตรงกันข้าม โปรตีโอมิกส์ที่ไม่ตรงเป้าหมายคือการศึกษาปริมาณและคุณภาพของโปรตีนที่มีอยู่ในตัวอย่างหรือตัวอย่างโดยไม่มุ่งเป้าไปที่โปรตีนชนิดใดชนิดหนึ่ง โปรตีโอมิกส์ที่กำหนดเป้าหมายจะดำเนินการด้วยโปรตีนที่เลือกไว้ล่วงหน้าหรือเป้าหมายในขณะที่โปรตีโอมิกส์ที่ไม่ตรงเป้าหมายจะดำเนินการเพื่อค้นหาประเภทของโปรตีนในตัวอย่างนี้ นอกจากนี้ โปรตีโอมิกส์เป้าหมายยังไวกว่าโปรตีโอมิกส์ที่ไม่ตรงเป้าหมาย
สรุป – โปรตีโอมิกส์ที่กำหนดเป้าหมายเทียบกับที่ไม่กำหนดเป้าหมาย
โดยสรุป โปรตีโอมิกส์แบบกำหนดเป้าหมายและไม่กำหนดเป้าหมายเป็นการศึกษาโปรตีนสองประเภท ตามชื่อที่แนะนำ โปรตีโอมิกเป้าหมายมุ่งเป้าไปที่โปรตีนเฉพาะในขณะที่โปรตีโอมิกส์ที่ไม่ตรงเป้าหมายไม่ได้กำหนดเป้าหมายโปรตีนจำเพาะนี่คือความแตกต่างระหว่างโปรตีโอมิกแบบกำหนดเป้าหมายและไม่กำหนดเป้าหมาย