ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างลำดับการอนุรักษ์และลำดับฉันทามติคือลำดับที่สงวนหมายถึงลำดับที่คล้ายคลึงกันของกรดนิวคลีอิกหรือกรดอะมิโนที่เกิดขึ้นในสปีชีส์ที่แตกต่างกันหรือเหมือนกันตลอดชั่วอายุคน ในขณะที่ลำดับฉันทามติเป็นลำดับนิวคลีโอไทด์ที่พบทั่วไปหรือพบลำดับกรดอะมิโน ในบริเวณที่มีการอนุรักษ์ DNA หรือ RNA หรือโปรตีนอย่างสูง
สิ่งมีชีวิตมีลักษณะคล้ายคลึงกันและมีลักษณะแตกต่างกัน เมื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างสิ่งมีชีวิตและการจำแนกประเภท จีโนมหรือองค์ประกอบทางพันธุกรรมของสิ่งมีชีวิตมีความสำคัญมาก มีลำดับนิวคลีโอไทด์หรือกรดอะมิโนบางอย่างที่พบได้ทั่วไปในสิ่งมีชีวิตต่างๆลำดับที่คงรักษาไว้คือลำดับกรดนิวคลีอิกหรือกรดอะมิโนซึ่งสอดคล้องกันระหว่างสปีชีส์ ดังนั้นจึงมีความสำคัญทางสายวิวัฒนาการเมื่อสร้างต้นไม้สายวิวัฒนาการ ในลำดับที่คงรักษาไว้ มีลำดับนิวคลีโอไทด์จำเพาะที่พบได้บ่อยกว่า พวกเขาเรียกว่าลำดับฉันทามติ
อนุรักษ์ลำดับคืออะไร
ลำดับที่สงวนไว้คือลำดับกรดนิวคลีอิกหรือลำดับกรดอะมิโนที่คล้ายคลึงกันระหว่างสปีชีส์ ดังนั้นจึงมีความสอดคล้องกันในทุกสายพันธุ์ตลอดวิวัฒนาการ โดยทั่วไป ลำดับเหล่านี้จะคงอยู่โดยการคัดเลือกโดยธรรมชาติ พวกเขายังคงไม่เปลี่ยนแปลงห่างไกลจากต้นไม้สายวิวัฒนาการ ดังนั้น ลำดับที่อนุรักษ์ไว้จึงมีความสำคัญในการสร้างต้นไม้สายวิวัฒนาการ เป็นที่เชื่อกันว่าลำดับที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้สูงมักมีค่าการทำงานที่สำคัญ มีประโยชน์ในการระบุโรคทางพันธุกรรมเช่นกัน อย่างไรก็ตาม ลำดับที่คงรักษาไว้อาจเป็นลำดับกรดนิวคลีอิกที่กำหนดรหัสหรือไม่เข้ารหัส นอกจากนี้ ลำดับที่สงวนไว้จะแสดงอัตราการกลายพันธุ์ที่ช้าลงดังนั้นพวกเขาจึงแสดงการเปลี่ยนแปลงเพียงเล็กน้อยในองค์ประกอบ บางครั้งก็ไม่แสดงการเปลี่ยนแปลงตลอดชั่วอายุคน
รูปที่ 01: Conserved Sequence
ส่วนประกอบ RNA ของไรโบโซมมีอยู่ในทุกโดเมนของชีวิต ลำดับของโฮมโอบ็อกซ์ในยูคาริโอต และ tmRNA ในแบคทีเรียเป็นตัวอย่างหลายประการของลำดับที่ได้รับการอนุรักษ์อย่างสูง การระบุลำดับที่สงวนไว้นั้นทำได้ง่ายเมื่อใช้ชีวสารสนเทศ โดยเฉพาะเครื่องมือการจัดตำแหน่งลำดับ นอกจากนี้ การจัดตำแหน่งหลายซีเควนซ์ช่วยให้มองเห็นลำดับที่อนุรักษ์ได้ง่ายขึ้น
ลำดับฉันทามติคืออะไร
ลำดับฉันทามติเป็นลำดับที่พบได้ทั่วไปในบริเวณที่สงวนไว้ของ DNA หรือ RNA เป็นลำดับนิวคลีโอไทด์ที่จำเพาะมากตัวอย่างเช่น มีลำดับฉันทามติที่ -10 เป็น TATAAT (กล่อง Pribnow) ในอี. โคไล โปรโมเตอร์ ซึ่งเป็นลำดับที่มีการอนุรักษ์อย่างสูง ในทำนองเดียวกัน มีลำดับฉันทามติอื่น: TTGACA ในโปรโมเตอร์ E. coli ที่ -35 เช่นกัน ลำดับฉันทามติเรียกอีกอย่างว่า “กล่อง”
รูปที่ 02: ลำดับฉันทามติ
นอกจาก DNA และ RNA แล้ว โปรตีนยังมีลำดับฉันทามติของกรดอะมิโนอีกด้วย ตำแหน่งการจับโปรตีนมักถูกแสดงโดยลำดับฉันทามติ เอ็นไซม์จำกัดยังมีลำดับฉันทามติ นอกจากนี้ ไซต์ประกบยังเป็นลำดับฉันทามติ คล้ายกับลำดับที่สงวนไว้ ลำดับฉันทามติสามารถคำนวณและแสดงภาพโดยเครื่องมือชีวสารสนเทศ
ความคล้ายคลึงกันระหว่างลำดับการอนุรักษ์และลำดับฉันทามติคืออะไร
- ลำดับที่อนุรักษ์และเป็นเอกฉันท์คือลำดับกรดนิวคลีอิกหรือกรดอะมิโนซึ่งพบได้ทั่วไปในสปีชีส์ต่างๆ
- สามารถแสดงภาพลำดับที่สงวนไว้และลำดับฉันทามติได้ด้วยเครื่องมือชีวสารสนเทศ
- พวกมันถูกใช้อย่างแพร่หลายในอณูชีววิทยา
ความแตกต่างระหว่างลำดับการอนุรักษ์และลำดับฉันทามติคืออะไร
ลำดับที่สงวนไว้คือลำดับกรดนิวคลีอิกหรือกรดอะมิโนซึ่งสอดคล้องกันระหว่างสปีชีส์ต่างๆ ในขณะที่ลำดับฉันทามตินั้นจำเพาะมากและพบได้ทั่วไปเป็นเบสหรือกรดอะมิโนในพื้นที่อนุรักษ์ที่กำหนด ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างลำดับการอนุรักษ์และลำดับฉันทามติ นอกจากนี้ ความแตกต่างอีกประการระหว่างลำดับที่สงวนไว้และลำดับฉันทามติก็คือลำดับที่สงวนไว้มีความสำคัญทางสายวิวัฒนาการในขณะที่ลำดับฉันทามติมักจะเป็นไซต์ที่จับกับโปรตีน ไซต์ต่อ ไซต์ตัดเอ็นไซม์จำกัด ฯลฯ
สรุป – ลำดับการอนุรักษ์เทียบกับลำดับฉันทามติ
ลำดับที่สงวนไว้คือลำดับของกรดนิวคลีอิกหรือโปรตีนที่คล้ายคลึงกันในหมู่สิ่งมีชีวิต โปรโมเตอร์ ตำแหน่งการจับไรโบโซม จุดกำเนิดของการจำลองแบบและลำดับกรดอะมิโนของโปรตีนฮิสโตนเป็นตัวอย่างหลายประการของลำดับที่คงรักษาไว้ ในทางตรงกันข้าม ลำดับฉันทามติคือเบสหรือกรดอะมิโนจำเพาะซึ่งพบได้ทั่วไปในลำดับที่สงวนไว้ซึ่งให้ไว้ -10 กล่อง, -35 กล่องของโปรโมเตอร์ E. coli, ตำแหน่งที่จับกับโปรตีน, ตำแหน่งต่อประกบและเอ็นไซม์จำกัดที่รับรู้ตำแหน่ง เป็นตัวอย่างหลายประการของลำดับฉันทามติ ดังนั้น นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่างลำดับของการอนุรักษ์และลำดับฉันทามติ