ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง intron ของกลุ่ม I และกลุ่ม II คือ intron ของกลุ่ม I ปฏิกิริยา splicing เริ่มต้นโดย cofactor guanosine ในขณะที่ intron กลุ่ม II ปฏิกิริยา splicing เริ่มต้นโดย adenosine ภายใน
Pre-mRNA เป็นการถอดเสียงหลักที่มีทั้งอินตรอนและเอ็กซอน Pre-mRNA ควรแปลงเป็น mRNA ก่อนการแปล RNA splicing หรือ pre-mRNA splicing เป็นการดัดแปลงหลังการถอดเสียง ในการประกบ RNA อินตรอนจะถูกลบออกจากโมเลกุลพรี mRNA และเอ็กซอนจะถูกรวมเข้าด้วยกัน อินตรอนกลุ่ม I และกลุ่ม II เป็นอินตรอนแบบประกบตัวเอง พวกเขาแยกตัวออกจากโมเลกุล pre-mRNA โดยไม่ต้องใช้เอนไซม์อื่นดังนั้นจึงเป็นเอ็นไซม์อาร์เอ็นเอหรือไรโบไซม์ที่กระตุ้นการประกบกันของพวกมันจากพรี-mRNA นอกจากนี้ยังมีความสามารถในการทำงานเป็นองค์ประกอบมือถือ ในระหว่างการต่อประกบ ชุดของปฏิกิริยาทรานส์เอสเทอริฟิเคชันจะเกิดขึ้นเพื่อแยกอินตรอนและลิเกตเอ็กซอนออก ไรโบไซม์เหล่านี้มีอยู่ในทั้งสามโดเมน รวมถึงแบคทีเรีย อาร์เคีย และยูคาริโอต
กลุ่ม I Introns คืออะไร
กลุ่ม I อินตรอนคือไรโบไซม์ประกบตัวเองชนิดหนึ่งที่พบในแบคทีเรีย แบคทีเรียและยูคาริโอต (จีโนมออร์แกเนลล์และนิวเคลียส) พบได้ในยีนที่จำเป็น พวกเขาสามารถกระตุ้นการประกบของตัวเองจากโมเลกุล pre-mRNA อินตรอนกลุ่มที่ 1 อาจมีนิวคลีโอไทด์ไม่กี่ร้อยถึงสามพันตัว ยิ่งกว่านั้น พวกมันมีความคล้ายคลึงกันเล็กน้อยในสิ่งมีชีวิต
รูปที่ 01: กลุ่ม I Introns
โครงสร้างทุติยภูมิได้รับการอนุรักษ์อย่างสูงในพื้นที่สั้นสี่แห่ง ปฏิกิริยาทรานส์เอสเทอริฟิเคชันของการประกบมีสองขั้นตอน อินตรอนกลุ่มที่ 1 เริ่มต้นกลไกการประกบโดยการโจมตีด้วยนิวคลีโอฟิลิกของไฮดรอกซิล 3 'ของโคแฟกเตอร์ Guanosine ที่ไซต์ประกบ 5P
อินตรอนกลุ่ม II คืออะไร
อินตรอนกลุ่ม II เป็นอินตรอนแบบประกบตัวเองชนิดหนึ่งที่พบในสิ่งมีชีวิตที่เป็นของทั้งสามโดเมน พวกมันคือไรโบไซม์ที่กระตุ้นปฏิกิริยาการต่อประกบของพวกมันจากพรี mRNA พบในยีน rRNA, tRNA และโปรตีนเข้ารหัส แต่ไม่พบในจีโนมนิวเคลียร์ ไม่เหมือนกลุ่ม I intron
รูปที่ 02: Introns Group II
อินตรอนกลุ่ม II กระตุ้นการประกบผ่านสองขั้นตอนการทรานส์เอสเทอริฟิเคชันที่คล้ายกับกลุ่ม I อินตรอนเอนไซม์เหล่านี้เริ่มต้นปฏิกิริยาการประกบโดยการโจมตีของนิวคลีโอฟิลิกของ 2′ OH ของอะดีโนซีนที่ตำแหน่งกิ่งบนรอยต่อ 5′ ระหว่างปฏิกิริยาประกบ อินตรอนกลุ่ม II จะสร้างโครงสร้างคล้ายบาศ นอกจากนี้ intron splicing จะเกิดขึ้นในกรณีที่ไม่มี GTP
อินตรอนของกลุ่ม I และกลุ่ม II มีความคล้ายคลึงกันอย่างไร
- อินตรอนกลุ่ม I และกลุ่ม II เป็นเอ็นไซม์ RNA สองประเภท ไรโบไซม์ที่กระตุ้นการประกบกันของพวกมันเองโดยกลไกต่างๆ
- พวกมันคือไรโบไซม์ขนาดใหญ่
- ทั้งสองถูกพบในทั้งสามโดเมน
- มันเป็นองค์ประกอบมือถือ
- นอกจากนี้ ยังพบในยีน rRNA, tRNA และโปรตีนเข้ารหัส
- เอนไซม์ทั้งสองถูกใช้เป็นเครื่องมือในเทคโนโลยีชีวภาพและยาระดับโมเลกุลสำหรับยีนเป้าหมายที่ทำให้ล้มลง/น็อคดาวน์ การส่งยีนหรือระบบยีนบำบัด
อินตรอนกลุ่ม I และกลุ่ม II ต่างกันอย่างไร
กลุ่มที่ 1 อินตรอนคือไรโบไซม์ที่พบในแบคทีเรีย แบคทีเรียและออร์แกเนลล์ของยูคาริโอต และจีโนมนิวเคลียร์ อินตรอนกลุ่มที่ 2 คือไรโบไซม์ที่พบในแบคทีเรีย อาร์เคีย และออร์แกเนลล์ที่มียูคาริโอต นอกจากนี้ อินตรอนกลุ่มที่ 1 เริ่มปฏิกิริยาการประกบโดยการโจมตีด้วยนิวคลีโอฟิลิกของไฮดรอกซิล 3′ ของโคแฟกเตอร์กัวโนซีนที่จุดประกบ 5P ในขณะที่อินตรอนกลุ่มที่ 2 เริ่มปฏิกิริยาการประกบโดยการโจมตีนิวคลีโอฟิลิกของ 2′ OH ของอะดีโนซีนของไซต์สาขาบน ทางแยกประกบ 5′ นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างอินตรอนของกลุ่ม I และกลุ่ม II
นอกจากนี้ อินตรอนกลุ่มที่ 2 ยังสร้างโครงสร้างคล้ายบาศระหว่างการประกบ ขณะที่อินตรอนกลุ่มที่ 1 ไม่ก่อตัว ดังนั้น นี่คือความแตกต่างที่สำคัญอีกประการระหว่างอินตรอนของกลุ่ม I และกลุ่ม II นอกจากนี้ อินตรอนกลุ่ม I ยังพบในจีโนมนิวเคลียร์ยูคาริโอตในขณะที่อินตรอนกลุ่ม II ไม่พบในจีโนมนิวเคลียร์ยูคาริโอต
ด้านล่างอินโฟกราฟิกแสดงรายการความแตกต่างระหว่างอินตรอนกลุ่ม I และกลุ่ม II ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – กลุ่ม I vs กลุ่ม II Introns
อินตรอนกลุ่ม I และ II เป็นไรโบไซม์ขนาดใหญ่ที่กระตุ้นปฏิกิริยาทรานส์เอสเทอริฟิเคชันเพื่อแยกอินตรอนออกจากการถอดเสียงหลัก พบได้ในทั้งสามโดเมน ทั้งสองเป็นองค์ประกอบทางพันธุกรรมเคลื่อนที่ นอกจากนี้ยังใช้เป็นเครื่องมือในเทคโนโลยีชีวภาพและยาระดับโมเลกุล อย่างไรก็ตาม อินตรอนกลุ่ม I เริ่มต้นปฏิกิริยาการประกบโดยการโจมตีด้วยนิวคลีโอฟิลิกของ 3′ OH ของโคแฟกเตอร์กัวโนซีนที่จุดประกบ 5P แต่ อินตรอนกลุ่ม II เริ่มต้นปฏิกิริยาการประกบโดยการโจมตีของนิวคลีโอฟิลิกของ 2′ OH ของอะดีโนซีนที่ตำแหน่งกิ่งบนรอยต่อ 5′ นอกจากนี้ อินตรอนกลุ่มที่ 2 ยังสร้างโครงสร้างคล้ายบาศระหว่างการประกบ ขณะที่อินตรอนกลุ่มที่ 1 ไม่สร้างโครงสร้างคล้ายบาศดังนั้น นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่างอินตรอนของกลุ่ม I และกลุ่ม II