ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง cis และ trans splicing คือ cis splicing เป็นกลไกภายในโมเลกุลที่เอา intramolecular ออกและรวม exons ที่อยู่ภายใน RNA transcript เดียวกัน ในขณะที่ trans-splicing เป็นกลไกระหว่างโมเลกุลที่เอา introns หรือ outrons และ รวม exons ที่ไม่ได้อยู่ในการถอดเสียง RNA เดียวกัน
RNA splicing เป็นรูปแบบหนึ่งของการประมวลผล RNA ก่อนการสังเคราะห์โปรตีน ในกระบวนการนี้ การถอดเสียง RNA ก่อนผู้ส่งสารที่สร้างขึ้นใหม่จะถูกแปลงเป็น RNA ของผู้ส่งสารที่เติบโตเต็มที่ RNA ของผู้ส่งสารที่เป็นผู้ใหญ่ช่วยในการผลิตโมเลกุลโปรตีน ในระหว่างการประกบ RNA อินตรอน (บริเวณที่ไม่มีการเข้ารหัส) จะถูกลบออก และเอ็กซอน (บริเวณการเข้ารหัส) จะถูกรวมเข้าด้วยกันเพื่อสร้าง mRNA ที่เจริญเต็มที่การประกบ Cis และทรานส์เป็นกลไกการประกบ RNA สองประเภท
Cis Splicing คืออะไร
Cis splicing เป็นกลไกภายในโมเลกุลที่เอา introns และรวม exons ที่อยู่ภายใน RNA transcript เดียวกัน การประกบ cis ปกติจะประมวลผลโมเลกุล RNA เดี่ยว การประกบ Cis เป็นกระบวนการประกบทั่วไปของ pre mRNA ที่ดำเนินการโดย spliceosomes ในอินตรอน ไซต์ผู้บริจาค (ปลายอินตรอน 5 ฟุต) ไซต์สาขา (ใกล้ปลายอินทรอน 3') และไซต์รับ (ส่วนปลายของอินตรอน 3') มีความจำเป็นอย่างมากสำหรับการต่อประกบ ไซต์ผู้บริจาคประกบมีลำดับคงที่ GU ที่ส่วนปลาย 5' ของอินตรอน ไซต์ตัวรับประกบที่ส่วนปลาย 3' ของอินตรอนมีลำดับ AG ที่ไม่เปลี่ยนแปลง ต้นน้ำจากลำดับ AG มีบริเวณที่เรียกว่าบริเวณไพริมิดีน (ทางเดินพอลิไพริมิดีน) ไกลออกไปทางต้นน้ำจากทางเดินอาหารพอลิไพริมิดีน มีจุดแตกแขนงที่มีอะดีโนซีนนิวคลีโอไทด์อยู่ด้วย นิวคลีโอไทด์นี้เกี่ยวข้องกับการก่อตัวของบาศ
รูปที่ 01: Cis และ Trans Splicing
spliceosomes ที่สำคัญคือ U1, U2, U4, U5 และ U6 ในหมู่พวกเขา U1 และ U2 มีความสำคัญมาก ในการประกบ cis U1 จะผูกกับไซต์ประกบ 5' และ U2 ผูกกับจุดสาขาใกล้กับไซต์ประกบ 3' U5/U4/U6 จับ exons ที่ตำแหน่ง 5' โดยที่ U6 จับกับ U2 ต่อมา U1 ถูกปล่อยออกมา U5 เปลี่ยนจาก exon เป็น intron และ U6 จับที่จุดต่อ 5' นอกจากนี้ U4 ยังเปิดตัวอีกด้วย U6/U2 เร่งปฏิกิริยาทรานส์เอสเทอริฟิเคชัน ทำให้ปลายอินตรอน 5’ ลิเกทกับนิวคลีโอไทด์ A บนอินตรอน สิ่งนี้ทำให้เกิดการก่อตัวของบาศ ในการก่อตัวของบาศ U5 ผูก exon ที่ไซต์ประกบ 3' และไซต์ 5' ถูกแยกออก ในขั้นตอนสุดท้ายของการประกบ U2/U5/U6 ยังคงถูกผูกไว้กับบาศ และส่วน 3’ จะถูกแยกออก นอกจากนั้น เอ็กซอนยังถูกผูกมัดโดยใช้ ATP ไฮโดรไลซิสในระยะนี้
Trans Splicing คืออะไร
Trans splicing เป็นกลไกระหว่างโมเลกุลที่เอา introns หรือ outrons ออก และรวม exons ที่ไม่ได้อยู่ในการถอดรหัส RNA เดียวกัน ในการต่อแบบทรานส์สปริก ไม่มีจุดต่อ 5’ บนโมเลกุลพรี mRNA สำหรับโปรตีน U1 ที่จะจับ แต่ RNA splice leader (SL) ของ capped spliced จะถูก trans-spliced ตามลำดับใน outron
รูปที่ 02: Trans Splicing
Outron คือบริเวณของพรี mRNA ระหว่างฝา 5 'และไซต์ trans splice อย่างไรก็ตาม โปรตีน U2 จะจับกับจุดประกบ 3’ โดยปกติ หลังจากถอด outron ออก exon ของ splice lead (SL) จะถูกประกบกับ exon แรกบน pre mRNA นอกจากนี้ trans-splicing เป็นกลไกที่สังเกตพบในจุลินทรีย์บางชนิด เช่น protists ของคลาส Kinetoplastae เพื่อแสดงยีน
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง Cis และ Trans Splicing คืออะไร
- Cis และ trans splicing เป็นกลไกการต่อ RNA สองประเภท
- ในกลไกทั้งสอง อินตรอนจะถูกลบออก
- นอกจากนี้ ในกลไกทั้งสองนั้น exons ถูกรวมเข้าด้วยกันเพื่อสร้าง mRNA ที่โตเต็มที่
- พบกลไกทั้งสองในยูคาริโอต
- กลไกเหล่านี้ไม่มีอยู่ในโปรคาริโอต
ความแตกต่างระหว่าง Cis และ Trans Splicing คืออะไร
Cis splicing เป็นกลไกภายในโมเลกุลที่เอา introns และรวม exons ที่อยู่ภายใน RNA transcript เดียวกัน ในขณะที่ trans-splicing เป็นกลไกระหว่างโมเลกุลที่เอา introns หรือ outrons และรวม exons ที่ไม่ได้อยู่ใน RNA เดียวกัน การถอดเสียง นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง cis และ trans splicing นอกจากนี้ ในการประกบ cis อินตรอนจะถูกลบออกเพื่อสร้าง mRNA ที่เจริญเต็มที่ ในทางกลับกัน ในอินตรอนแบบทรานส์ splicing introns หรือ outrons จะถูกลบออกเพื่อสร้าง mRNA ที่เจริญเต็มที่
อินโฟกราฟิกต่อไปนี้แสดงรายการความแตกต่างระหว่าง cis และ trans splicing ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – Cis vs Trans Splicing
RNA splicing เป็นรูปแบบหนึ่งของการประมวลผล RNA ก่อนกระบวนการสังเคราะห์โปรตีน Cis และ trans splicing เป็นกลไกการประกบ RNA สองประเภทที่พบในยูคาริโอต Cis splicing เป็นกลไกภายในโมเลกุลที่เอา introns และรวม exons ที่อยู่ภายใน RNA transcript เดียวกัน ในขณะที่ trans-splicing เป็นกลไกระหว่างโมเลกุลที่เอา introns หรือ outrons และรวม exons ที่ไม่ได้อยู่ในการถอดรหัส RNA เดียวกัน ดังนั้น นี่จึงเป็นการสรุปการอภิปรายความแตกต่างระหว่าง cis และ trans splicing
