ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง SF1 และ SF2 คือความสามารถในการคลายกรดนิวคลีอิก ในขณะที่ SF1 คลาย DNA เท่านั้น SF2 จะคลายทั้ง DNA และ RNA
เฮลิเคสเป็นหนึ่งในเอ็นไซม์สำคัญที่มีส่วนร่วมในกระบวนการจำลองดีเอ็นเอตลอดจนในกระบวนการซ่อมแซมดีเอ็นเอ บทบาทหลักของเฮลิเคสคือการมีส่วนร่วมในกระบวนการคลี่คลายเพื่ออำนวยความสะดวกในการแยกโมเลกุลดีเอ็นเอที่มีเกลียวคู่ กิจกรรมของเอนไซม์มีความสำคัญในช่วงเริ่มต้นของการจำลองดีเอ็นเอ เฮลิเคสถูกแบ่งออกเป็น Super Family 1 และ Super Family 2 ตามความแตกต่างของโครงสร้างเป็นหลัก ภายใน Super Family แต่ละอันมีเฮลิเคสหลากหลายประเภทมากกว่า
SF1 คืออะไร
เฮลิเคสซูเปอร์แฟมิลี่ 1 เป็นเฮลิเคสประเภทหนึ่งที่ประกอบด้วยโครงสร้างเฮกซาเมอร์ควบคู่ไปกับโปรตีนแกนภายใน ซึ่งแสดงถึงกิจกรรมเฮลิเคส เฮลิเคส SF1 เป็นหนึ่งในคลาสเฮลิเคสที่ใหญ่ที่สุดและสามารถจัดประเภทเพิ่มเติมได้เป็นเฮลิเคส SF1A และเฮลิเคส SF1B โปรตีนเช่น PcrA, Rep และ UvrD อยู่ในคลาสของเฮลิเคส SF1A ในการเปรียบเทียบ โปรตีนเช่น RecA และ Dda อยู่ในคลาสของเฮลิเคส SF1B หน้าที่ของเฮลิเคส SF1 แตกต่างกันอย่างมาก หน้าที่ที่สำคัญบางประการของเฮลิเคส SF1 ได้แก่ การจำลองดีเอ็นเอ การรวมตัวใหม่ของดีเอ็นเอ การประมวลผลชิ้นส่วนของโอกาซากิ การสร้างเทโลเมียร์ และการซ่อมแซมการตัดตอนนิวคลีโอไทด์ของความเสียหายของดีเอ็นเอ ในแบคทีเรียบางชนิด เฮลิเคสชนิด SF1 ยังมีส่วนร่วมในการช่วยถ่ายโอนยีนในแนวนอนผ่านการคอนจูเกต นอกจากนี้ ในไวรัส SF1 helicases ยังช่วยในการทำซ้ำของไวรัส
รูปที่ 01: Helicase Action
มีลวดลายที่แตกต่างกันมากมายที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างของเฮลิเคส SF1 ประกอบด้วยลวดลายที่อนุรักษ์ไว้อย่างน้อย 7 แบบในบรรดาเฮลิเคส SF1 ประเภทต่างๆ (Q, I, Ia, II, III, IV, V และ VI) โครงสร้างของเฮลิเคส SF1 เป็นคริสตัลที่มีลวดลายเป็นคลัสเตอร์ มีกระเป๋าผูก ATP ที่มีลักษณะเฉพาะระหว่างลวดลายและไซต์ที่มีผลผูกพันดีเอ็นเอ โดเมนที่ไม่อนุรักษ์ถูกแจกจ่ายเพื่อรักษาความสมบูรณ์ของโครงสร้างของโมเลกุลเฮลิเคส โดเมนเหล่านี้อาจแตกต่างกันระหว่างเฮลิเคส SF1A และเฮลิเคส SF1B
SF2 คืออะไร
ซุปเปอร์แฟมิลี่ 2 เฮลิเคสเป็นหนึ่งในกลุ่มซุปเปอร์แฟมิลี่เฮลิเคสที่มีความหลากหลายมากที่สุด เฮลิเคส SF2 มีหลายประเภท เช่น เฮลิเคสที่เหมือน RecQ, เฮลิเคส RecG – เหมือนเฮลิเคส, เฮลิเคส Rad3/XPD และ NS3 เอนไซม์จำกัดบางชนิด เช่น เอนไซม์จำกัดประเภทที่ 1 ก็จัดอยู่ในหมวดหมู่นี้เช่นกันหน้าที่ทั่วไปของเฮลิเคส SF2 คือการคลายตัวของ DNA ที่มีเกลียวคู่ อย่างไรก็ตาม เฮลิเคส SF2 บางประเภทไม่มีความสามารถในการทำหน้าที่เป็นเอ็นไซม์เฮลิเคสอย่างสมบูรณ์ เฮลิเคส SF2 ใช้กันอย่างแพร่หลายในการประมวลผลอาร์เอ็นเอเช่นกัน ตระกูล DEAD-box ของเฮลิเคส SF2 มีส่วนร่วมในการประมวลผลอาร์เอ็นเอ รวมถึงการถอดความ การประกบ การประมวลผลการแปล และการประกอบที่ซับซ้อนของโปรตีน RNA
รูปที่ 02: เฮลิเคส
โครงสร้างของลานเกลียว SF2 ยังมีลวดลายที่อนุรักษ์ไว้ด้วย อย่างไรก็ตาม บางโดเมนแตกต่างจากของเฮลิเคส SF1 เล็กน้อย พวกมันยังมีโดเมนการผูก ATP นอกเหนือจากโดเมนการจับ DNA
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง SF1 กับ SF2 คืออะไร
- SF1 และ SF2 แสดงกิจกรรมลานจอดเฮลิคอปเตอร์
- นอกจากนี้ ทั้งคู่ยังมีส่วนร่วมในการจำลองดีเอ็นเอและการรวมตัวใหม่
- SF1 และ SF2 ประกอบด้วยลวดลายอนุรักษ์
- ทั้งคู่มีโดเมนผูก ATP และโดเมนผูก DNA
- รูปแบบเหล่านี้เป็นโปรตีนหลายโดเมน
- นอกจากนี้ หากเกิดการกลายพันธุ์ในประเภทใดประเภทหนึ่ง ก็จะส่งผลเสีย
- ทั้ง SF1 และ SF2 มีความสำคัญต่อความต่อเนื่องของวัฏจักรเซลล์
- SF1 และ SF2 พบได้ในโปรคาริโอตและยูคาริโอต
ความแตกต่างระหว่าง SF1 และ SF2 คืออะไร
SF1 และ SF2 เป็นสองสุดยอดครอบครัวเฮลิเคส พวกเขาแสดงความหลากหลาย ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง SF1 และ SF2 คือ SF1 เกี่ยวข้องกับการคลายตัวของ DNA เป็นหลัก ในขณะที่ SF2 ยังมีส่วนร่วมในการประมวลผล RNA ระหว่างการถอดรหัสและการแปล เมื่อเปรียบเทียบรูปแบบต่างๆ ของโปรตีน SF1 และ SF2 จะแตกต่างกันโดยหลักตาม motif III และ motif IV แม้ว่าจะมีความคล้ายคลึงกันของโครงสร้าง แต่เฮลิเคส SF1 จะสร้างโครงสร้างเฮกซาเมริกแบบวงแหวนในขณะที่ SF2 ไม่ก่อให้เกิดการจัดเรียงโครงสร้างเหล่านี้
ความแตกต่างอีกประการระหว่าง SF1 และ SF2 คือ เฮลิเคส SF1 ชอบอะดีนีนนิวคลีโอไทด์มากกว่า ในขณะที่เฮลิเคส SF2 ชอบนิวคลีโอไทด์ทั้งห้าเพื่อกำหนดเป้าหมายสำหรับการคลายออก เมื่อเปรียบเทียบทิศทางที่คลี่คลาย เฮลิเคส SF1 จะเคลื่อนไปในทิศทาง 5’ ถึง 3’ เท่านั้น ในขณะที่เฮลิเคส SF2 มีความสามารถในการเคลื่อนย้ายไปพร้อมกับกรดนิวคลีอิกทั้งสองทิศทาง
อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงความแตกต่างระหว่าง SF1 และ SF2 ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – SF1 vs SF2
เฮลิเคสเป็นกลุ่มเอนไซม์ที่สำคัญและหลากหลายซึ่งมีส่วนร่วมในการจำลองดีเอ็นเอ อย่างไรก็ตาม เนื่องจากมีความหลากหลายสูง เอ็นไซม์จึงถูกจัดประเภทเป็นซุปเปอร์แฟมิลี่ SF1 และ SF2 เป็นซุปเปอร์แฟมิลี่ที่ใหญ่ที่สุดสองตระกูลของเฮลิเคส แม้ว่า SF1 จะเกี่ยวข้องกับการประมวลผลที่เกี่ยวข้องกับ DNA เป็นหลัก แต่ SF2 นั้นเกี่ยวข้องกับทั้งการประมวลผล DNA และ RNA ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง SF1 และ SF2 นอกจากนี้ SF1 และ SF2 ยังแตกต่างกันในการจัดเรียงโครงสร้างเนื่องจาก SF2 ไม่ได้สร้างโครงสร้างหกเหลี่ยมการกลายพันธุ์ในเฮลิเคส SF1 และ SF2 จะนำไปสู่การพัฒนาของมะเร็งตามระเบียบวัฏจักรของเซลล์ที่ผิดปกติและกลไกสำคัญอื่นๆ เช่น การซ่อมแซมดีเอ็นเอ
