ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง CGH และ array CGH คือ CGH เป็นวิธีการสร้างเซลล์โมเลกุลแบบดั้งเดิมสำหรับการวิเคราะห์รูปแบบหมายเลขสำเนาใน DNA ของตัวอย่างทดสอบที่มีความละเอียดต่ำกว่า ในขณะที่ Array CGH เป็นวิธีการสร้างเซลล์โมเลกุลแบบอัตโนมัติสำหรับ การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาใน DNA ของตัวอย่างทดสอบที่มีความละเอียดสูงกว่า
CGH และอาร์เรย์ CGH เป็นสองเทคนิคในการตรวจจับความแตกต่างของจำนวนสำเนาในแต่ละบุคคล รูปแบบตัวเลขที่คัดลอกหมายถึงส่วนต่างๆ ของจีโนมที่มีการทำซ้ำ หมายเลขสำเนาแตกต่างกันไปในแต่ละบุคคล รูปแบบตัวเลขที่คัดลอกโดยทั่วไปแบ่งออกเป็นสองกลุ่ม: การทำซ้ำแบบสั้นและการทำซ้ำแบบยาวตัวอย่างที่รู้จักกันดีที่สุดประการหนึ่งสำหรับการแปรผันของจำนวนสำเนาสั้นๆ คือการทำซ้ำของ CAG trinucleotide ในยีน huntingtin ทำให้เกิดความผิดปกติทางระบบประสาทที่เรียกว่า ฮันติงติน ตัวอย่างที่ดีที่สุดสำหรับการเปลี่ยนแปลงหมายเลขสำเนาซ้ำเป็นเวลานานคือยีนอัลฟาอะไมเลส ซึ่งทำให้เกิดการดื้อต่ออินซูลิน สามารถตรวจจับรูปแบบตัวเลขที่คัดลอกได้ด้วยเทคนิคต่างๆ เช่น FISH, CGH และ array CGH
CGH คืออะไร
CGH เป็นวิธีการทางเซลล์วิทยาระดับโมเลกุลแบบดั้งเดิมสำหรับการวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาใน DNA ของตัวอย่างทดสอบเปรียบเทียบกับตัวอย่างอ้างอิง มีความละเอียดต่ำกว่าเมื่อเทียบกับเทคนิคอัตโนมัติ วัตถุประสงค์ของเทคนิคนี้คือการเปรียบเทียบตัวอย่าง DNA จีโนมสองตัวอย่างที่เกิดขึ้นจากแหล่งต่างๆ อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ
รูปที่ 01: CGH
ขั้นตอนเกี่ยวข้องกับการแยก DNA จากสองแหล่ง: การทดสอบและการอ้างอิง จากนั้น ขั้นตอนต่อไปคือการติดฉลากอิสระของตัวอย่างดีเอ็นเอทดสอบและอ้างอิงด้วยฟลูออโรฟอร์ที่มีสีต่างกัน ต่อมา ตัวอย่าง DNA ทั้งสองถูกทำให้เสียสภาพเพื่อให้ได้ตัวอย่าง DNA สายเดี่ยว ในที่สุด ได้ทำการผสมพันธุ์ของตัวอย่างดีเอ็นเอที่เป็นผลลัพธ์ทั้งสองตัวอย่างในอัตราส่วน 1:1 ต่อการแพร่กระจายเมตาเฟสปกติของโครโมโซม ความแตกต่างของโครโมโซมสามารถระบุได้ระหว่างสองแหล่งโดยใช้กล้องจุลทรรศน์เรืองแสงและซอฟต์แวร์คอมพิวเตอร์ นอกจากนี้ เทคนิค CGH ยังสามารถตรวจจับความผิดปกติของโครโมโซมที่ไม่สมดุลเท่านั้น
Array CGH คืออะไร
Array CGH เป็นวิธีการสร้างเซลล์โมเลกุลแบบอัตโนมัติเต็มรูปแบบสำหรับการวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาใน DNA ของตัวอย่างทดสอบเปรียบเทียบกับตัวอย่างอ้างอิง มีความละเอียดสูงกว่า และได้รับการพัฒนาเพื่อลดข้อจำกัดของ CGH แบบเดิม Array CGH รวมหลักการของ CGH เข้ากับการใช้ไมโครอาร์เรย์แทนที่จะใช้การแพร่กระจายของโครโมโซมเมตาเฟส วิธีนี้ใช้สไลด์ที่จัดเรียงด้วยส่วนเล็กๆ ของ DNA เป็นเป้าหมาย ไมโครอาร์เรย์เหล่านี้ถูกสร้างขึ้นโดยการฝากและตรึง DNA (โพรบ) จำนวนเล็กน้อยไว้บนฐานแก้วที่เป็นของแข็ง ขนาดของโพรบอาจแตกต่างกันตั้งแต่โอลิโกนิวคลีโอไทด์ไปจนถึงโครโมโซมประดิษฐ์จากแบคทีเรีย
รูปที่ 02: Array CGH
โดยไม่คำนึงถึงโพรบ วิธีการพื้นฐานของอาร์เรย์ CGH จะคล้ายกับ CGH เมื่อเตรียมโพรบที่มีไมโครอาร์เรย์แล้ว ตัวอย่างดีเอ็นเอสองตัวอย่าง (การทดสอบและการอ้างอิง) ที่ติดฉลากด้วยฟลูออโรฟอร์ที่มีสีต่างกันจะถูกผสมเข้าด้วยกันและเพิ่มลงในไมโครอาร์เรย์ เนื่องจาก DNA ในตัวอย่างเป็นสายเดี่ยวเนื่องจากการเสียสภาพ DNA นี้จึงผสมพันธุ์กับโพรบสายเดี่ยวแบบอาร์เรย์ การใช้ระบบภาพดิจิทัลทำให้สามารถระบุความแตกต่างของโครโมโซมระหว่างแหล่งที่มาทั้งสองได้
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง CGH และ Array CGH คืออะไร
- CGH และอาร์เรย์ CGH เป็นสองเทคนิคในการตรวจจับรูปแบบตัวเลขที่คัดลอกมา
- เป็นวิธีการสร้างเซลล์โมเลกุล
- ทั้งสองวิธีวินิจฉัยความผิดปกติของโครโมโซมที่ไม่สมดุล
- ฟลูออโรฟอร์เกี่ยวข้องกับทั้งสองวิธี
- ทั้งสองวิธีสามารถใช้ตรวจหาความผิดปกติทางพันธุกรรมได้เนื่องจากความแตกต่างของจำนวนสำเนา
- มีการใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบ
ความแตกต่างระหว่าง CGH และ Array CGH คืออะไร
CGH เป็นวิธีการทางเซลล์วิทยาระดับโมเลกุลแบบดั้งเดิมสำหรับการวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาใน DNA ของตัวอย่างทดสอบที่มีความละเอียดต่ำกว่า ในขณะที่อาร์เรย์ CGH เป็นวิธีการสร้างเซลล์โมเลกุลแบบอัตโนมัติสำหรับการวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาใน DNA ของตัวอย่างทดสอบ ที่มีความละเอียดสูงกว่า นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง CGH และอาร์เรย์ CGHนอกจากนี้ ใน CGH ตัวอย่าง DNA ที่ทดสอบและอ้างอิงจะผสมพันธุ์กับการแพร่กระจายของเมตาเฟสปกติของโครโมโซม แต่ในอาร์เรย์ CGH ตัวอย่าง DNA ที่ทดสอบและอ้างอิงจะผสมพันธุ์กับโพรบ DNA ที่ถูกตรึงที่มีไมโครอาร์เรย์
อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงความแตกต่างระหว่าง CGH และอาร์เรย์ CGH ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – CGH กับ Array CGH
CGH และ array CGH เป็นเทคนิคการสร้างเซลล์โมเลกุลสองแบบเพื่อตรวจหาความผิดปกติของโครโมโซมที่ไม่สมดุล มีการใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบ CGH เป็นวิธีการทางเซลล์วิทยาระดับโมเลกุลแบบดั้งเดิมสำหรับการวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาใน DNA ของตัวอย่างทดสอบที่มีความละเอียดต่ำกว่า ในทางตรงกันข้าม Array CGH เป็นวิธีการสร้างเซลล์โมเลกุลแบบอัตโนมัติสำหรับการวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาใน DNA ของตัวอย่างทดสอบที่มีความละเอียดสูงกว่า ดังนั้น สิ่งนี้จะสรุปความแตกต่างระหว่าง CGH และอาร์เรย์ CGH
