ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างการขนย้ายแบบจำลองและการขนย้ายแบบตัดและวางคือในการขนย้ายแบบจำลอง Transposon จะถูกคัดลอกไปยังตำแหน่งใหม่ ในขณะที่ขนย้ายแบบตัดและวาง Transposon จะถูกย้ายไปยังตำแหน่งใหม่
องค์ประกอบที่เคลื่อนย้ายได้หรือยีนกระโดดคือลำดับดีเอ็นเอที่สามารถเปลี่ยนตำแหน่งภายในจีโนมได้ สิ่งนี้เรียกว่าการขนย้าย การขนย้ายบางครั้งสามารถสร้างหรือย้อนกลับการกลายพันธุ์ และเปลี่ยนแปลงเอกลักษณ์ทางพันธุกรรมของเซลล์และขนาดจีโนม Barbara McClintock ค้นพบการขนย้ายในปี 1983 การขนย้ายสามารถเกิดขึ้นได้โดยใช้สองเทคนิคคือการทำซ้ำและตัดและวาง
ขนถ่ายแบบจำลองคืออะไร
ขนย้ายแบบจำลองเป็นกลไกการขนย้ายประเภทหนึ่งที่ช่วยตัดตอน transposon จากตำแหน่งดั้งเดิมไปยังอีกที่หนึ่งโดยใช้เทคนิคการทำซ้ำหรือทำซ้ำ กลไกนี้ถูกค้นพบครั้งแรกโดย James A Shapiro ในปี 1979 ในกลไกนี้ องค์ประกอบที่เคลื่อนย้ายได้จะถูกทำซ้ำระหว่างปฏิกิริยาขนย้ายเพื่อให้เอนทิตีการเคลื่อนย้ายเป็นสำเนาขององค์ประกอบดั้งเดิม ยิ่งกว่านั้น ในกลไกนี้ ลำดับดีเอ็นเอของผู้ให้และตัวรับสร้างโครงร่าง "ทีตา" ระดับกลางที่มีลักษณะเฉพาะที่เรียกว่าชาปิโรตัวกลาง (cointegrate) การขนย้ายแบบจำลองเป็นลักษณะ retrotransposon กลไกนี้มักเกิดขึ้นในคลาส I transposons
รูปที่ 01: Replicative Transposition
ตัวอย่างที่ดีของการขนย้ายแบบจำลองสามารถสังเกตได้ใน E. coli TN3 transposon ทรานสโปซอน TN3 สามารถย้ายจากพลาสมิดดั้งเดิมไปยังพลาสมิดเป้าหมายอื่นได้โดยใช้เทคนิคการจำลองแบบหรือทำซ้ำ เหตุการณ์ทั้งหมดนี้เป็นสื่อกลางโดยเอ็นไซม์สำคัญสองชนิดที่เรียกว่าทรานสโพเสสและรีโซลวาส นอกจากนี้ยังสามารถสังเกตการขนย้ายแบบจำลองทั้งใน DNA transposons และ retroposons ไวรัสแบคทีเรียทรานส์โพสเบิลที่ศึกษาได้ดีที่สุดคือแบคทีเรียมิว.
การขนย้ายแบบตัดและวางคืออะไร
การตัดและวางขนย้ายเป็นกลไกการขนย้ายประเภทหนึ่งที่ช่วยตัดตอน transposon จากตำแหน่งดั้งเดิมไปยังอีกที่หนึ่งผ่านเทคนิคการตัดและวาง กลไกนี้เรียกอีกอย่างว่ารูปแบบการขนย้ายแบบอนุรักษ์นิยม ในการขนย้ายแบบไม่ทำซ้ำนี้ การตัดตอนและการรวมทรานส์โพซอนจากตำแหน่งจีโนมหนึ่งไปยังอีกตำแหน่งหนึ่งเกิดขึ้นโดยไม่ทิ้งสำเนาไว้เบื้องหลัง
รูปที่ 02: ตัดและวางขนย้าย
ในกลไกนี้ เอ็นไซม์ทรานส์โพเสสจะจับกับเทอร์มินอลซ้ำก่อน ซึ่งมักจะปรากฏอยู่ที่ปลายทั้งสองของทรานสโปซอน และจากนั้นจะสร้างโครงสร้างที่เรียกว่าไซแนปติกคอมเพล็กซ์ (ทรานสโพโซโซม) คอมเพล็กซ์ synaptic แยก transposon ออกจากตำแหน่งจีโนมดั้งเดิมและรวมเข้ากับตำแหน่งเป้าหมายใหม่ หลังจากนั้น transposases จะออกจากปลายทั้งสองของ transposon เมื่อเอนไซม์ทรานส์โพเสสออกจากทรานส์โพซอน ช่องว่างจะถูกเติมโดยเอนไซม์พอลิเมอเรสของโฮสต์ ซึ่งจะช่วยให้สามารถเชื่อมต่อ transposon กับตำแหน่งจีโนมใหม่ได้อย่างสมบูรณ์ กลไกนี้มักเกิดขึ้นในทรานสโปซอนคลาส II นอกจากนี้ ทรานสโปซอนของแบคทีเรีย TN5 เป็นตัวอย่างที่รู้จักกันดีซึ่งแสดงกลไกการขนย้ายแบบอนุรักษ์นิยมหรือแบบตัดและวาง
อะไรคือความคล้ายคลึงกันระหว่างการเคลื่อนย้ายแบบจำลองและการตัดและวาง
- ขนย้ายแบบจำลองและการตัดและวางเป็นกลไกการขนย้ายสองประเภท
- ในกลไกทั้งสององค์ประกอบที่ย้ายจากตำแหน่งจีโนมหนึ่งไปยังอีกตำแหน่งหนึ่งของจีโนม
- กลไกทั้งสองสามารถสร้างหรือย้อนกลับการกลายพันธุ์และเปลี่ยนแปลงเอกลักษณ์ทางพันธุกรรมของเซลล์
- transposons แบคทีเรียแสดงกลไกทั้งสอง
- มันเป็นเหตุการณ์ที่สำคัญยิ่งสำหรับวิวัฒนาการ
อะไรคือความแตกต่างระหว่างการเคลื่อนย้ายแบบจำลองและการตัดและวาง
การขนย้ายแบบจำลองเป็นกลไกการขนย้ายประเภทหนึ่งที่การขนย้ายข้ามตำแหน่งถูกคัดลอกไปยังตำแหน่งใหม่ ในขณะที่การขนย้ายแบบตัดและวางเป็นกลไกการขนย้ายประเภทหนึ่งที่ขนย้ายข้ามตำแหน่งถูกย้ายไปยังตำแหน่งใหม่ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างการขนย้ายแบบจำลองและการขนย้ายแบบตัดและวาง นอกจากนี้ การขนย้ายแบบจำลองมักจะเกิดขึ้นในทรานสโปซอนคลาส I ในขณะที่การขนย้ายแบบตัดและวางมักจะเกิดขึ้นในทรานสโปซอนคลาส II
อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงความแตกต่างระหว่างการเคลื่อนย้ายแบบจำลองและการเคลื่อนย้ายแบบตัดและวางในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
Summary – การขนย้ายแบบจำลองเทียบกับการตัดและวาง
ขนย้ายแบบจำลองและการตัดและวางขนย้ายเป็นกลไกการขนย้ายสองประเภท การขนย้ายแบบจำลองเป็นกลไกการขนย้ายประเภทหนึ่งที่การขนย้ายแบบ transposon ถูกคัดลอกไปยังตำแหน่งใหม่ ในขณะที่การขนย้ายแบบตัดและวางเป็นกลไกการขนย้ายประเภทหนึ่งที่ transposon ถูกย้ายไปยังตำแหน่งใหม่ ดังนั้น นี่จึงสรุปความแตกต่างระหว่างการขนย้ายแบบจำลองและการขนย้ายแบบตัดและวาง