ความแตกต่างระหว่าง Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis

ความแตกต่างระหว่าง Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis
ความแตกต่างระหว่าง Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis
Anonim

ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis คือ agarose gel electrophoresis ใช้เจล agarose ในแนวนอนเพื่อแยกชิ้นส่วน DNA ที่มีขนาดใหญ่กว่า ในขณะที่ polyacrylamide gel electrophoresis ใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์ที่เทในแนวตั้งเพื่อแยกชิ้นส่วนกรดนิวคลีอิกที่สั้นกว่า

อิเล็กโทรโฟเรซิสเป็นเทคนิคประเภทหนึ่งที่ใช้สนามไฟฟ้ากับเมทริกซ์เจลเพื่อแยกชีวโมเลกุล เช่น ดีเอ็นเอ อาร์เอ็นเอ และโปรตีน การแยกสารชีวโมเลกุล เช่น DNA, RNA และโปรตีนผ่านอิเล็กโตรโฟรีซิสขึ้นอยู่กับประจุและขนาดตัวอย่างจะถูกบรรจุลงในบ่อของเจล ต่อมาสนามไฟฟ้าถูกนำไปใช้กับเจล สนามทำให้โมเลกุลที่มีประจุลบเคลื่อนเข้าหาขั้วไฟฟ้าบวก เมทริกซ์เจลทำหน้าที่เป็นตะแกรงโมเลกุลซึ่งโมเลกุลที่เล็กที่สุดผ่านหรือเดินทางอย่างรวดเร็วในขณะที่โมเลกุลขนาดใหญ่เคลื่อนที่ช้า ทำให้สามารถแยกโมเลกุลตามประจุและขนาดได้ ดังนั้น agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis เป็นเทคนิคเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสสองประเภทที่ช่วยแยกโมเลกุลตามขนาดและประจุเป็นหลัก

Agarose Gel Electrophoresis คืออะไร

Agarose gel electrophoresis เป็นเทคนิคที่ใช้เจลอะกาโรสเพื่อแยกชีวโมเลกุล เช่น DNA และ RNA เป็นเทคนิคที่ใช้ในการแยกกรดนิวคลีอิกตามขนาดเป็นหลัก สารประกอบหลักที่เรียกว่า agarose ที่ใช้ในเทคนิคนี้คือพอลิแซ็กคาไรด์ มันมาจากสาหร่าย Agarose สามารถละลายในบัฟเฟอร์เดือดแล้วเทลงในถาดที่เก็บไว้ในแนวนอนในถาด ถาดจะแข็งตัวเมื่อเย็นตัวลงจนกลายเป็นแผ่น เจล Agarose จะถูกเทด้วยหวีเพื่อสร้างบ่อน้ำที่บรรจุกรดนิวคลีอิก เช่น DNA หรือ RNA เมื่อเจลแข็งตัวแล้ว

Agarose vs Polyacrylamide Gel Electrophoresis ในรูปแบบตาราง
Agarose vs Polyacrylamide Gel Electrophoresis ในรูปแบบตาราง

รูปที่ 01: Agarose Gel Electrophoresis

เจลจะถูกแช่ในบัฟเฟอร์ที่เหมาะสมในภายหลัง และกระแสไฟจะถูกนำไปใช้กับเจล DNA มีประจุลบที่สม่ำเสมอซึ่งไม่ขึ้นกับองค์ประกอบลำดับของโมเลกุล ดังนั้นโมเลกุลของ DNA จะย้ายจากแคโทด (-) ไปยังแอโนด (+) อัตราการอพยพขึ้นอยู่กับขนาดของโมเลกุลโดยตรง โมเลกุลขนาดใหญ่ที่สุดมีช่วงเวลาที่ยากที่สุดในการนำทางผ่านเจล ในทางกลับกัน โมเลกุลที่มีขนาดเล็กกว่าจะเคลื่อนตัวผ่านเจลอย่างรวดเร็วและค่อนข้างง่าย

Polyacrylamide Gel Electrophoresis คืออะไร

โพลีอะคริลาไมด์เจลอิเล็กโตรโฟรีซิส (PAGE) เป็นเทคนิคที่ใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์เพื่อแยกสารชีวโมเลกุลออก เป็นเทคนิคที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการแยกโมเลกุลขนาดใหญ่ทางชีวภาพ ซึ่งมักจะเป็นโปรตีนและกรดนิวคลีอิก ตามการเคลื่อนที่ของอิเล็กโตรโฟเรติก การให้น้ำของอะคริโลไนไทรล์ส่งผลให้เกิดการก่อตัวของโมเลกุลอะคริลาไมด์โดยไนไตรล์ไฮเดรต อะคริลาไมด์สามารถละลายได้ในน้ำ และเมื่อเติมตัวกระตุ้นอนุมูลอิสระ อะคริลาไมด์พอลิเมอไรซ์ทำให้เกิดเจลโพลีอะคริลาไมด์ โดยปกติ การเพิ่มความเข้มข้นของอะคริลาไมด์จะทำให้ขนาดรูพรุนในเจลลดลง เจลโพลีอะคริลาไมด์ถูกเทในแนวตั้งไม่เหมือนกับเจลอะกาโรส

Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis - การเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis - การเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน

รูปที่ 02: Polyacrylamide Gel Electrophoresis

ในอิเล็กโตรโฟรีซิสเจลโพลีอะคริลาไมด์ โมเลกุลอาจทำงานในสถานะดั้งเดิม โดยรักษาโครงสร้างลำดับที่สูงกว่าของโมเลกุล วิธีนี้เรียกว่าเนทีฟเพจ อีกทางหนึ่ง สามารถเพิ่มสารเคมีแปลงสภาพเพื่อขจัดโครงสร้างที่มีลำดับสูงกว่าและเปลี่ยนโมเลกุลให้เป็นโมเลกุลที่ไม่มีโครงสร้างซึ่งการเคลื่อนที่ขึ้นอยู่กับความยาวเท่านั้น ประเภทนี้เรียกว่า SDS-PAGE

ความคล้ายคลึงกันระหว่าง Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis คืออะไร

  • Agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis เป็นเทคนิคเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสสองประเภท
  • อันที่จริงมันเป็นเทคนิคทางอณูชีววิทยา
  • ทั้งสองเทคนิคใช้ในการตรวจหาโมเลกุลทางชีววิทยา เช่น DNA และโปรตีน
  • เทคนิคเหล่านี้ทำโดยช่างผู้ชำนาญหรือนักวิจัย
  • ในทั้งสองเทคนิค การแยกโมเลกุลขนาดใหญ่ขึ้นอยู่กับประจุและขนาด
  • เทคนิคทั้งสองช่วยให้แยกกรดนิวคลีอิกเช่น DNA และ RNA

ความแตกต่างระหว่าง Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis คืออะไร

Agarose gel electrophoresis เป็นเทคนิคที่ใช้เจล agarose ในแนวนอนเพื่อแยกสารชีวโมเลกุลออก ในขณะที่ polyacrylamide gel electrophoresis เป็นเทคนิคที่ใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์ในแนวตั้งเพื่อแยกสารชีวโมเลกุลออก นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis นอกจากนี้ อะกาโรสเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสยังใช้สำหรับแยก DNA และ RNA ในขณะที่อิเล็กโตรโฟรีซิสเจลโพลีอะคริลาไมด์ใช้สำหรับแยกกรดนิวคลีอิก เช่น DNA, RNA หรือโปรตีน

ตารางต่อไปนี้สรุปความแตกต่างระหว่างอะกาโรสและโพลีอะคริลาไมด์เจลอิเล็กโทรโฟรีซิส

สรุป – Agarose vs Polyacrylamide Gel Electrophoresis

Agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis เป็นเทคนิคเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสสองประเภทที่ใช้ในห้องปฏิบัติการอณูชีววิทยาAgarose gel electrophoresis ใช้เจล agarose เพื่อแยกชีวโมเลกุลออก Agarose โดยทั่วไปไม่เป็นพิษต่อมนุษย์ ในขณะที่ polyacrylamide เป็นพิษต่อมนุษย์ นอกจากนี้ อะกาโรสเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสยังแสดงความละเอียดต่ำในขณะที่อิเล็กโตรโฟรีซิสเจลโพลีอะคริลาไมด์แสดงความละเอียดที่มากกว่า โพลีอะคริลาไมด์เจลอิเล็กโตรโฟรีซิสใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์เพื่อแยกสารชีวโมเลกุลออก สรุปความแตกต่างระหว่าง agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis

แนะนำ: