ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis คือ agarose gel electrophoresis ใช้เจล agarose ในแนวนอนเพื่อแยกชิ้นส่วน DNA ที่มีขนาดใหญ่กว่า ในขณะที่ polyacrylamide gel electrophoresis ใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์ที่เทในแนวตั้งเพื่อแยกชิ้นส่วนกรดนิวคลีอิกที่สั้นกว่า
อิเล็กโทรโฟเรซิสเป็นเทคนิคประเภทหนึ่งที่ใช้สนามไฟฟ้ากับเมทริกซ์เจลเพื่อแยกชีวโมเลกุล เช่น ดีเอ็นเอ อาร์เอ็นเอ และโปรตีน การแยกสารชีวโมเลกุล เช่น DNA, RNA และโปรตีนผ่านอิเล็กโตรโฟรีซิสขึ้นอยู่กับประจุและขนาดตัวอย่างจะถูกบรรจุลงในบ่อของเจล ต่อมาสนามไฟฟ้าถูกนำไปใช้กับเจล สนามทำให้โมเลกุลที่มีประจุลบเคลื่อนเข้าหาขั้วไฟฟ้าบวก เมทริกซ์เจลทำหน้าที่เป็นตะแกรงโมเลกุลซึ่งโมเลกุลที่เล็กที่สุดผ่านหรือเดินทางอย่างรวดเร็วในขณะที่โมเลกุลขนาดใหญ่เคลื่อนที่ช้า ทำให้สามารถแยกโมเลกุลตามประจุและขนาดได้ ดังนั้น agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis เป็นเทคนิคเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสสองประเภทที่ช่วยแยกโมเลกุลตามขนาดและประจุเป็นหลัก
Agarose Gel Electrophoresis คืออะไร
Agarose gel electrophoresis เป็นเทคนิคที่ใช้เจลอะกาโรสเพื่อแยกชีวโมเลกุล เช่น DNA และ RNA เป็นเทคนิคที่ใช้ในการแยกกรดนิวคลีอิกตามขนาดเป็นหลัก สารประกอบหลักที่เรียกว่า agarose ที่ใช้ในเทคนิคนี้คือพอลิแซ็กคาไรด์ มันมาจากสาหร่าย Agarose สามารถละลายในบัฟเฟอร์เดือดแล้วเทลงในถาดที่เก็บไว้ในแนวนอนในถาด ถาดจะแข็งตัวเมื่อเย็นตัวลงจนกลายเป็นแผ่น เจล Agarose จะถูกเทด้วยหวีเพื่อสร้างบ่อน้ำที่บรรจุกรดนิวคลีอิก เช่น DNA หรือ RNA เมื่อเจลแข็งตัวแล้ว
รูปที่ 01: Agarose Gel Electrophoresis
เจลจะถูกแช่ในบัฟเฟอร์ที่เหมาะสมในภายหลัง และกระแสไฟจะถูกนำไปใช้กับเจล DNA มีประจุลบที่สม่ำเสมอซึ่งไม่ขึ้นกับองค์ประกอบลำดับของโมเลกุล ดังนั้นโมเลกุลของ DNA จะย้ายจากแคโทด (-) ไปยังแอโนด (+) อัตราการอพยพขึ้นอยู่กับขนาดของโมเลกุลโดยตรง โมเลกุลขนาดใหญ่ที่สุดมีช่วงเวลาที่ยากที่สุดในการนำทางผ่านเจล ในทางกลับกัน โมเลกุลที่มีขนาดเล็กกว่าจะเคลื่อนตัวผ่านเจลอย่างรวดเร็วและค่อนข้างง่าย
Polyacrylamide Gel Electrophoresis คืออะไร
โพลีอะคริลาไมด์เจลอิเล็กโตรโฟรีซิส (PAGE) เป็นเทคนิคที่ใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์เพื่อแยกสารชีวโมเลกุลออก เป็นเทคนิคที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการแยกโมเลกุลขนาดใหญ่ทางชีวภาพ ซึ่งมักจะเป็นโปรตีนและกรดนิวคลีอิก ตามการเคลื่อนที่ของอิเล็กโตรโฟเรติก การให้น้ำของอะคริโลไนไทรล์ส่งผลให้เกิดการก่อตัวของโมเลกุลอะคริลาไมด์โดยไนไตรล์ไฮเดรต อะคริลาไมด์สามารถละลายได้ในน้ำ และเมื่อเติมตัวกระตุ้นอนุมูลอิสระ อะคริลาไมด์พอลิเมอไรซ์ทำให้เกิดเจลโพลีอะคริลาไมด์ โดยปกติ การเพิ่มความเข้มข้นของอะคริลาไมด์จะทำให้ขนาดรูพรุนในเจลลดลง เจลโพลีอะคริลาไมด์ถูกเทในแนวตั้งไม่เหมือนกับเจลอะกาโรส
รูปที่ 02: Polyacrylamide Gel Electrophoresis
ในอิเล็กโตรโฟรีซิสเจลโพลีอะคริลาไมด์ โมเลกุลอาจทำงานในสถานะดั้งเดิม โดยรักษาโครงสร้างลำดับที่สูงกว่าของโมเลกุล วิธีนี้เรียกว่าเนทีฟเพจ อีกทางหนึ่ง สามารถเพิ่มสารเคมีแปลงสภาพเพื่อขจัดโครงสร้างที่มีลำดับสูงกว่าและเปลี่ยนโมเลกุลให้เป็นโมเลกุลที่ไม่มีโครงสร้างซึ่งการเคลื่อนที่ขึ้นอยู่กับความยาวเท่านั้น ประเภทนี้เรียกว่า SDS-PAGE
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis คืออะไร
- Agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis เป็นเทคนิคเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสสองประเภท
- อันที่จริงมันเป็นเทคนิคทางอณูชีววิทยา
- ทั้งสองเทคนิคใช้ในการตรวจหาโมเลกุลทางชีววิทยา เช่น DNA และโปรตีน
- เทคนิคเหล่านี้ทำโดยช่างผู้ชำนาญหรือนักวิจัย
- ในทั้งสองเทคนิค การแยกโมเลกุลขนาดใหญ่ขึ้นอยู่กับประจุและขนาด
- เทคนิคทั้งสองช่วยให้แยกกรดนิวคลีอิกเช่น DNA และ RNA
ความแตกต่างระหว่าง Agarose และ Polyacrylamide Gel Electrophoresis คืออะไร
Agarose gel electrophoresis เป็นเทคนิคที่ใช้เจล agarose ในแนวนอนเพื่อแยกสารชีวโมเลกุลออก ในขณะที่ polyacrylamide gel electrophoresis เป็นเทคนิคที่ใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์ในแนวตั้งเพื่อแยกสารชีวโมเลกุลออก นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis นอกจากนี้ อะกาโรสเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสยังใช้สำหรับแยก DNA และ RNA ในขณะที่อิเล็กโตรโฟรีซิสเจลโพลีอะคริลาไมด์ใช้สำหรับแยกกรดนิวคลีอิก เช่น DNA, RNA หรือโปรตีน
ตารางต่อไปนี้สรุปความแตกต่างระหว่างอะกาโรสและโพลีอะคริลาไมด์เจลอิเล็กโทรโฟรีซิส
สรุป – Agarose vs Polyacrylamide Gel Electrophoresis
Agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis เป็นเทคนิคเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสสองประเภทที่ใช้ในห้องปฏิบัติการอณูชีววิทยาAgarose gel electrophoresis ใช้เจล agarose เพื่อแยกชีวโมเลกุลออก Agarose โดยทั่วไปไม่เป็นพิษต่อมนุษย์ ในขณะที่ polyacrylamide เป็นพิษต่อมนุษย์ นอกจากนี้ อะกาโรสเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสยังแสดงความละเอียดต่ำในขณะที่อิเล็กโตรโฟรีซิสเจลโพลีอะคริลาไมด์แสดงความละเอียดที่มากกว่า โพลีอะคริลาไมด์เจลอิเล็กโตรโฟรีซิสใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์เพื่อแยกสารชีวโมเลกุลออก สรุปความแตกต่างระหว่าง agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis