ไฮโปทาลามัส vs ฐานดอก
ฐานดอกและไฮโปทาลามัสเป็นของ diencephalon ในซีรีบรัมของสมอง Diencephalon ตั้งอยู่รอบช่องที่สามและอยู่ติดกับสมองส่วนกลาง เนื่องจากฐานดอกเป็นส่วนที่ใหญ่ที่สุดในภูมิภาคนี้ จึงพบเนื้อเยื่อประสาทของ diencephalon ส่วนใหญ่ในฐานดอก พบทั้งฐานดอกและไฮโปทาลามัสใกล้กับเส้นกึ่งกลางที่ฐานของสมอง
ฐานดอก
ฐานดอกเป็นโครงสร้างห้อยเป็นตุ้มสองอัน ซึ่งเป็นส่วนที่เหนือกว่าของผนังด้านข้างของช่องที่สามของสมอง ประกอบด้วยมวลรูปวงรีคู่ของสสารสีเทาที่ประกอบด้วยผืนของสสารสีขาวและมวลของสสารสีเทาที่จัดเป็นนิวเคลียสนิวเคลียสส่วนหน้าพบที่พื้นช่องด้านข้างและสัมพันธ์กับอารมณ์ ความจำ และระบบลิมบิก นิวเคลียสอยู่ตรงกลางเกี่ยวข้องกับข้อมูลทางประสาทสัมผัส นิวเคลียสหน้าท้องสามนิวเคลียสภายในฐานดอกคือ ventral anterior nucleus และ ventral lateral nucleus ที่เกี่ยวข้องกับระบบโซมาติกโมตาร์ และ ventral posterior nucleus ที่เกี่ยวข้องกับข้อมูลทางประสาทสัมผัส เช่น รส สัมผัส ความดัน ความร้อน ความเย็น และความเจ็บปวด นิวเคลียสของพัลวินาร์พบได้ที่ส่วนหลังของฐานดอก และรวมข้อมูลทางประสาทสัมผัสและแรงกระตุ้นของโปรเจ็กต์เข้ากับส่วนอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องของซีรีบรัม อวัยวะสืบพันธุ์ด้านข้างและลำตัวที่อยู่ตรงกลางเป็นศูนย์ถ่ายทอดภาพและการได้ยินที่สำคัญบนฐานดอก
ไฮโปทาลามัส
ไฮโปทาลามัสเป็นโครงสร้างขนาดเท่าเล็บมือ อยู่บนครึ่งซีกของสมอง และล้อมรอบส่วนล่างของช่องที่สาม ไฮโปทาลามัสยังมีนิวเคลียสที่สำคัญอยู่ด้วย นิวเคลียส supraoptic ใกล้กับ optic chiasma จะหลั่งฮอร์โมน antidiuretic (Vasopressin)พบนิวเคลียส Paraventricular ใกล้กับช่องที่สามและหลั่ง oxytocin ซึ่งทำให้กล้ามเนื้อเรียบของมดลูกหดตัว นิวเคลียสพรีออปติกควบคุมกิจกรรมอัตโนมัติบางอย่าง เช่น อุณหภูมิของร่างกาย บริเวณที่สำคัญอื่นๆ ที่มีนิวเคลียสหลายนิวเคลียสในไฮโปทาลามัส ได้แก่ บริเวณท่อ, บริเวณที่เห็นอกเห็นใจ, บริเวณกระซิก, บริเวณสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม และศูนย์อารมณ์
ฐานดอกและฐานดอกต่างกันอย่างไร
• ฐานดอกมีขนาดใหญ่กว่ามลรัฐ
• ไฮโปทาลามัสอยู่ต่ำกว่าฐานดอกในไดเอนเซฟาลอน
• ไฮโปทาลามัสเชื่อมต่อกับต่อมใต้สมองโดย infundibulum แต่ฐานดอกไม่เชื่อมต่อกับต่อมใต้สมอง
• ไฮโปทาลามัสหลั่งฮอร์โมนต่างจากฐานดอก เช่น วาโซเพรสซินและออกซีโตซิน
• ข้อมูลทางประสาทสัมผัสทั้งหมด (ยกเว้นแรงกระตุ้นในการดมกลิ่น) ส่งผ่านไปยังสมองผ่านฐานดอก ในขณะที่มลรัฐทำหน้าที่เป็นส่วนติดต่อระหว่างต่อมไร้ท่อและระบบประสาท