ความแตกต่างของคีย์ – ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ถูกรูท vs ที่ไม่ได้ทำการรูท
Phylogeny เป็นสาขาสำคัญที่สำรวจชีวิตบนโลกตลอดเวลา เผยให้เห็นความเชื่อมโยงระหว่างสิ่งมีชีวิตกับบรรพบุรุษและลูกหลานของพวกมัน ความสัมพันธ์ระหว่างสิ่งมีชีวิตจะแสดงเป็นแผนภาพโดยการแสดงแทนต้นไม้ต่างๆ เช่น dendogram, cladogram, phenogram, phylogram เป็นต้น ต้นไม้สายวิวัฒนาการเป็นแผนภาพที่มีลักษณะเหมือนต้นไม้ที่แตกแขนง ซึ่งอธิบายความสัมพันธ์สายวิวัฒนาการระหว่างสิ่งมีชีวิตกับจำนวนระยะวิวัฒนาการ ต้นไม้สายวิวัฒนาการมีสองประเภทหลักที่เรียกว่ารูตและไม่ได้รูทความแตกต่างที่สำคัญระหว่างต้นไม้สายวิวัฒนาการที่รูทและไม่ได้รูทคือ ต้นไม้ที่รูทแล้วจะแสดงบรรพบุรุษที่เป็นรากฐานที่สุดของต้นไม้ ในขณะที่ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ยังไม่ได้ทำการรูทจะไม่แสดงรากของบรรพบุรุษ
ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่หยั่งรากคืออะไร
ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่รูตแล้วทำหน้าที่เป็นไดอะแกรมที่มีประโยชน์ซึ่งแสดงประวัติวิวัฒนาการ มีโหนดฐานซึ่งเรียกว่ารูทซึ่งเป็นตัวแทนของบรรพบุรุษร่วมกันของทุกกลุ่มของต้นไม้ รากของต้นไม้ถือเป็นจุดที่เก่าแก่ที่สุดในต้นไม้ ซึ่งแสดงถึงบรรพบุรุษร่วมคนสุดท้ายของทุกกลุ่มที่รวมอยู่ในต้นไม้ ดังนั้น ต้นไม้ที่หยั่งรากแล้วจะแสดงทิศทางของเวลาวิวัฒนาการ จากต้นไม้ที่มีรากเพียงชนิดเดียว บรรพบุรุษร่วมหรือบรรพบุรุษของสปีชีส์สามารถพบได้โดยการติดตามกลับไปที่โหนดฐาน เนื่องจากต้นไม้ที่หยั่งรากแล้วแสดงให้เห็นทิศทางของเวลาวิวัฒนาการ จึงเป็นเรื่องง่ายที่จะหากลุ่มที่เก่ากว่าหรือใหม่กว่าที่มีอยู่ ต้นไม้ที่หยั่งรากสามารถใช้ศึกษาสิ่งมีชีวิตทั้งกลุ่มได้การรูตที่ถูกต้องของต้นไม้สายวิวัฒนาการเป็นปัจจัยที่สำคัญและสำคัญ เนื่องจากการรูตที่ไม่ถูกต้องอาจส่งผลให้เกิดการตีความที่ผิดเกี่ยวกับการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมระหว่างสิ่งมีชีวิตและทิศทางของวิวัฒนาการ
รูปที่ 01: ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่หยั่งรากแล้ว
ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ยังไม่ได้ทำการรูทคืออะไร
ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ยังไม่ได้ทำการรูทคือแผนผังสายวิวัฒนาการที่ไม่มีบรรพบุรุษร่วมกันหรือโหนดฐาน ต้นไม้ชนิดนี้ไม่ได้บ่งบอกถึงการวิวัฒนาการของกลุ่มที่สนใจ มันแสดงให้เห็นเฉพาะความสัมพันธ์ระหว่างสิ่งมีชีวิตโดยไม่คำนึงถึงทิศทางของเส้นเวลาวิวัฒนาการ ดังนั้นจึงเป็นเรื่องยากที่จะศึกษาความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการของกลุ่มเกี่ยวกับเวลาโดยใช้ต้นไม้ที่ไม่ได้ทำการรูท
มีสองวิธีหลักในการรูตต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ยังไม่ได้ทำการรูท พวกเขาคือ
การหากลุ่มนอก – สิ่งนี้ต้องการความรู้ล่วงหน้าเกี่ยวกับความสัมพันธ์ระหว่างแท็กซ่า จากนั้นอนุกรมวิธานที่อยู่นอกกลุ่มสามารถใช้เป็นกลุ่มนอกเพื่อวาดต้นไม้สายวิวัฒนาการที่หยั่งรากแล้ว
การหาจุดกึ่งกลางหรือระยะทาง – จุดกึ่งกลางของแท็กซ่าสองตัวที่อยู่ไกลที่สุดในต้นไม้สามารถสันนิษฐานได้ว่าเป็นรากของต้นไม้สายวิวัฒนาการ
รูปที่ 02: ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ยังไม่ได้ทำการรูท
อะไรคือความแตกต่างระหว่างต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ถูกรูทและไม่ได้รูท
ต้นไม้ Phylogenetic ที่รูทแล้วกับที่ยังไม่ได้รูท |
|
| ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่หยั่งรากเป็นแผนภาพที่แสดงบรรพบุรุษร่วมกันสุดท้ายของกลุ่ม | ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ยังไม่ได้ทำการรูทแสดงความสัมพันธ์ระหว่างสิ่งมีชีวิตโดยไม่แสดงบรรพบุรุษร่วมกัน |
| โหนด | |
| มันมีโหนด (รูท). | มันไม่มีโหนด |
| ทิศทางวิวัฒนาการ | |
| มีทิศทางบอกเวลาวิวัฒนาการ | มันไม่ได้ระบุความสัมพันธ์วิวัฒนาการ |
| ทัศนคติต่อผู้อื่น | |
| ต้นไม้อนุญาตให้กำหนดความสัมพันธ์ระหว่างบรรพบุรุษ – ลูกหลานระหว่างกลุ่ม | ต้นไม้ไม่ให้พูดถึงบรรพบุรุษ-สายสัมพันธ์ |
สรุป – ต้นไม้ Phylogenetic ที่รูทแล้วกับที่ไม่ได้ทำการรูท
ต้นไม้สายวิวัฒนาการเป็นตัวแทนของเส้นทางวิวัฒนาการและความเชื่อมโยงระหว่างสิ่งมีชีวิตโดยใช้แผนภาพคล้ายต้นไม้ที่มีกิ่งก้าน ปอยผมสายวิวัฒนาการสามารถหยั่งรากหรือถอนรากถอนโคนได้ ต้นไม้ที่รูทแล้วจะมีโหนดที่ฐาน ซึ่งแสดงถึงบรรพบุรุษร่วมกันซึ่งเชื่อมโยงกลุ่มผลประโยชน์ทั้งหมด ต้นไม้ที่ไม่ได้ทำการรูทจะแสดงความสัมพันธ์ระหว่างสิ่งมีชีวิต อย่างไรก็ตาม มันไม่ได้แสดงถึงบรรพบุรุษร่วมกันที่ทุกกลุ่มมีร่วมกัน นี่คือความแตกต่างระหว่างต้นไม้สายวิวัฒนาการที่รูตแล้วและไม่ได้รูท