ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศคือความคล้ายคลึงกันหมายถึงคำแถลงเกี่ยวกับบรรพบุรุษวิวัฒนาการร่วมกันของสองลำดับในขณะที่ความคล้ายคลึงกันหมายถึงระดับความคล้ายคลึงกันระหว่างสองลำดับ
Bioinformatics เป็นสาขาวิชาที่รวมชีววิทยา วิศวกรรมสารสนเทศ วิทยาการคอมพิวเตอร์ คณิตศาสตร์ และสถิติเข้าไว้ด้วยกันเพื่อวิเคราะห์และตีความข้อมูลทางชีววิทยา ความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันเป็นคำสองคำที่เราใช้ในด้านชีวสารสนเทศ เราสามารถคำนวณความคล้ายคลึงกันได้อย่างง่ายดายเป็นเปอร์เซ็นต์ของสารตกค้างที่คล้ายกันตลอดความยาวของการจัดตำแหน่งที่กำหนด อย่างไรก็ตาม เราไม่สามารถคำนวณความคล้ายคลึงกันได้เนื่องจากอาจเป็นจริงหรือเท็จ และมักจะขึ้นอยู่กับสมมติฐานที่ใช้
ความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศคืออะไร
ความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศหมายถึงความคล้ายคลึงทางชีวภาพระหว่างลำดับ DNA, RNA และโปรตีนซึ่งกำหนดไว้ในแง่ของคุณสมบัติของบรรพบุรุษร่วมกันในต้นไม้วิวัฒนาการของชีวิต กล่าวอีกนัยหนึ่ง มันเป็นบรรพบุรุษวิวัฒนาการร่วมกันของสองลำดับ สาเหตุของการเกิดดังกล่าวอาจเป็นเพราะเหตุการณ์ speciation (orthologs) เหตุการณ์การถ่ายโอนยีนแนวนอน (xenologs) หรือเหตุการณ์การทำซ้ำ (paralogs)
รูปที่ 01: การจัดแนวหลายลำดับ
สามารถอนุมานความคล้ายคลึงกันระหว่าง DNA, RNA หรือโปรตีนด้วยความคล้ายคลึงกันของกรดอะมิโนหรือลำดับนิวคลีโอไทด์ ความคล้ายคลึงกันที่มีนัยสำคัญทำหน้าที่เป็นคุณสมบัติที่มีหลักฐานชัดเจนในการอนุมานว่าสองลำดับนั้นสัมพันธ์กับลำดับบรรพบุรุษร่วมกับการเปลี่ยนแปลงทางวิวัฒนาการ การจัดแนวของลำดับหลายลำดับระบุขอบเขตของแต่ละลำดับที่มีลักษณะคล้ายคลึงกัน
ความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศคืออะไร
ในชีวสารสนเทศ ความคล้ายคลึงจะประเมินความคล้ายคลึงกันระหว่างสองโปรตีนหรือลำดับนิวคลีโอไทด์ มีสองขั้นตอนหลักในกระบวนการนี้ ขั้นตอนแรกคือการจัดตำแหน่งแบบคู่ ซึ่งช่วยในการค้นหาการจัดตำแหน่งที่เหมาะสมที่สุดระหว่างสองลำดับ (รวมถึงช่องว่าง) โดยใช้อัลกอริธึม เช่น BLAST, FastA และ LALIGN หลังจากการจัดตำแหน่งแบบคู่แล้ว จำเป็นต้องได้รับพารามิเตอร์เชิงปริมาณสองตัวจากการเปรียบเทียบแบบคู่แต่ละค่า พวกเขาเป็นตัวตนและความคล้ายคลึงกัน ใน BLAST ความคล้ายคลึงในการค้นหาเรียกว่าผลบวก
รูปที่ 02: การจัดแนวคู่
การกลายพันธุ์แบบอนุรักษ์นิยมเกิดขึ้นเมื่อกรดอะมิโนกลายพันธุ์เป็นสารตกค้างที่คล้ายกันในขณะที่รักษาคุณสมบัติทางเคมีกายภาพ ตัวอย่างเช่น ถ้าอาร์จินีนกลายพันธุ์เป็นไลซีนด้วยประจุบวก +1 ก็ยอมรับได้เนื่องจากกรดอะมิโนสองตัวมีคุณสมบัติคล้ายกันและไม่เปลี่ยนโปรตีนที่แปลแล้ว ดังนั้น การวัดความคล้ายคลึงจึงขึ้นอยู่กับเกณฑ์ของกรดอะมิโนสองตัวที่ตกค้างซึ่งกันและกัน
ความคล้ายคลึงกันระหว่างความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศคืออะไร
- ความคล้ายคลึงกันและความคล้ายคลึงกันเป็นศัพท์เทคนิคสองคำที่เราพบในชีวสารสนเทศ
- นอกจากนี้ ทั้งสองคำยังอ้างถึงการวิเคราะห์ระดับโมเลกุลของลำดับ
ความแตกต่างระหว่างความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศคืออะไร
Homology หมายถึงคำแถลงเกี่ยวกับบรรพบุรุษวิวัฒนาการร่วมกันของสองลำดับในขณะที่ความคล้ายคลึงกันหมายถึงระดับของความคล้ายคลึงกันระหว่างสองลำดับ นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศ นอกจากนี้ ไม่สามารถคำนวณความคล้ายคลึงกันได้เนื่องจากอาจเป็นจริงหรือเท็จ และมักขึ้นอยู่กับสมมติฐาน ในขณะที่ความคล้ายคลึงกันสามารถคำนวณได้ง่ายเป็นเปอร์เซ็นต์ของสารตกค้างที่คล้ายคลึงกันตลอดความยาวของการจัดตำแหน่งที่กำหนด ดังนั้น นี่จึงเป็นข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศ
อินโฟกราฟิกต่อไปนี้แสดงความแตกต่างระหว่างความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศ
สรุป – ความคล้ายคลึงกันและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศ
โดยสังเขป ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศอยู่ในคำจำกัดความของพวกเขา ความคล้ายคลึงกันคือคำแถลงของบรรพบุรุษวิวัฒนาการร่วมกันของสองลำดับในขณะที่ความคล้ายคลึงกันคือความคล้ายคลึงกันระหว่างสองลำดับ ความคล้ายคลึงกันเกิดขึ้นเนื่องจาก orthologs, paralogs และ xenologs เมื่อสรุปความคล้ายคลึงกัน คุณสามารถใช้อัลกอริธึมเช่น FastA, BLAST และ LALIGN ได้ ความคล้ายคลึงกันไม่สามารถแสดงเป็นการคำนวณได้ แต่ความคล้ายคลึงกันสามารถแสดงเป็นเปอร์เซ็นต์ของสารตกค้างที่คล้ายคลึงกันตลอดความยาวของการจัดตำแหน่งที่กำหนดดังนั้น นี่คือบทสรุปของความแตกต่างระหว่างความคล้ายคลึงและความคล้ายคลึงกันในชีวสารสนเทศ