ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นและทั้งปืนลูกซองคือในการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้น จีโนมจะแตกเป็นชิ้นใหญ่ก่อนที่จะมีการจัดลำดับ ในขณะที่ในการจัดลำดับปืนลูกซองจีโนมทั้งหมด จีโนมทั้งหมดจะแตกเป็นชิ้นเล็กชิ้นน้อยสำหรับการจัดลำดับ.
การจัดลำดับเป็นเทคนิคที่สำคัญในกระบวนการระดับโมเลกุล โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการจำแนกชนิดพันธุ์ให้ถูกต้อง อันที่จริง เป็นเทคนิคในการระบุลำดับของนิวคลีโอไทด์ในยีนหรือจีโนมอย่างแม่นยำ มีเทคนิคมากมายในการจัดลำดับ สิ่งเหล่านี้รวมถึงวิธี Maxam Gilbert, วิธี Sanger และวิธี Sanger อัตโนมัติ
ลำดับชั้นปืนลูกซองคืออะไร
ลำดับชั้นปืนลูกซองเป็นวิธีหนึ่งในการเรียงลำดับ เรียกอีกอย่างว่า 'การจัดลำดับจากบนลงล่าง' นอกจากนี้ วิธีนี้ประกอบด้วยสองขั้นตอน: ขั้นตอนแรกคือการขยายจีโนม และขั้นตอนที่สองคือการกระจายตัวของจีโนม ในวิธีนี้ จีโนมจะถูกตัดเป็นชิ้นใหญ่ก่อน ตามมาด้วยการโคลนชิ้นส่วนขนาดใหญ่เหล่านี้ไปยังโฮสต์ต่างๆ โดยใช้เวกเตอร์หรือโครโมโซมเทียม จากนั้นเวกเตอร์รีคอมบิแนนท์เหล่านี้ถูกจัดเรียงเป็นไลบรารี ในระหว่างการจัดลำดับปืนลูกซอง โคลนเวกเตอร์ลูกผสมจะได้รับการจัดลำดับทีละรายการ ชิ้นส่วนในโคลนได้รับการย่อยแบบจำกัดเพื่อลดขนาดของจีโนม ดังนั้นจึงอยู่ระหว่างการจัดลำดับ
รูปที่ 01: ลำดับปืนลูกซองตามลำดับ
ระหว่างการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้น ต้องจัดเรียงชิ้นส่วนขนาดใหญ่ตามลำดับ ก่อนการจัดลำดับปืนลูกซอง มันเกิดขึ้นด้วยความช่วยเหลือของเครื่องหมายโมเลกุลที่รวมอยู่ในกระบวนการโคลน
การจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นสร้างแผนที่ยีนที่มีความละเอียดต่ำ แต่มันสร้างแผนผังลำดับที่สั่ง ดังนั้นจึงใช้เวลานานกว่าการจัดลำดับโดยตรง กระบวนการทั้งหมดล่าช้าเนื่องจากการสร้างไลบรารีเวกเตอร์ recombinant ยังเป็นเทคนิคที่ใช้แรงงานเข้มข้น อย่างไรก็ตาม ปัจจุบันเทคนิคเป็นแบบอัตโนมัติเพื่อให้งานง่ายขึ้น
การจัดลำดับปืนลูกซองทั้งจีโนมคืออะไร
การจัดลำดับปืนลูกซองทั้งจีโนมเป็นกระบวนการหาลำดับขั้นตอนเดียว ในกระบวนการนี้ การตัดจีโนมทั้งหมดจะเกิดขึ้นก่อน ต่อจากนี้ ชิ้นส่วนเล็กๆ เหล่านี้แต่ละชิ้นได้รับการจัดลำดับแบบสุ่ม เมื่อการจัดลำดับเสร็จสิ้น การวิเคราะห์ลำดับจะเกิดขึ้นในระหว่างการวิเคราะห์ลำดับ ลำดับที่ทับซ้อนกันจะถูกลบออก และการวิเคราะห์ไม่ใช่กระบวนการที่ได้รับคำสั่ง ดังนั้น การประกอบซีเควนซ์จึงเป็นกระบวนการที่มีประสิทธิภาพน้อยกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้น อย่างไรก็ตาม กระบวนการของการจัดลำดับปืนลูกซองของจีโนมทั้งหมดนั้นรวดเร็วกว่า และการวิเคราะห์จีโนมทั้งหมดสามารถเกิดขึ้นได้ในครั้งเดียว
ความคล้ายคลึงกันระหว่างการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นกับจีโนมทั้งหมดคืออะไร
- การจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นและทั้งจีโนมเป็นวิธีการจัดลำดับสองวิธี
- ทั้งสองได้รับการจัดลำดับ Sanger หรือวิธีการจัดลำดับ Sanger อัตโนมัติ
- พวกมันมีส่วนร่วมในการจัดลำดับชิ้นส่วน DNA และ RNA
- ยิ่งไปกว่านั้น ทั้งสองวิธีมีความสำคัญในการวินิจฉัยระดับโมเลกุลและวัตถุประสงค์ในการวิจัย
- ปัจจุบัน ทั้งสองเทคนิคเป็นแบบอัตโนมัติหรือแบบคอมพิวเตอร์
- เทคนิคทั้งสองอาศัยการกระจายตัวของจีโนม
ความแตกต่างระหว่างลำดับชั้นและลำดับปืนลูกซองทั้งจีโนมคืออะไร
การจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นสร้างชิ้นส่วนขนาดใหญ่กว่าเมื่อเปรียบเทียบกับการจัดลำดับปืนลูกซองทั้งจีโนม ซึ่งใช้งานได้กับชิ้นส่วนเล็กๆ ของลำดับ ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นและลำดับชั้นของจีโนมทั้งหมด นอกจากนี้ การจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นยังประกอบด้วยสองขั้นตอนหลัก ในขณะที่การจัดลำดับปืนลูกซองทั้งจีโนมอาศัยขั้นตอนสำคัญเพียงขั้นตอนเดียว
นอกจากนี้ ความแตกต่างอีกประการหนึ่งระหว่างการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นกับทั้งปืนลูกซองจีโนมคือความละเอียดที่สูงกว่าในการจัดลำดับปืนลูกซองทั้งจีโนมเมื่อเปรียบเทียบกับการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้น
อินโฟกราฟิกด้านล่างสรุปความแตกต่างระหว่างการจัดลำดับปืนลูกซองแบบมีลำดับชั้นและจีโนมทั้งหมด
สรุป – ลำดับชั้นเทียบกับลำดับปืนลูกซองทั้งจีโนม
การจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นและทั้งจีโนมเป็นสองเทคนิคในการจัดลำดับจีโนมขนาดใหญ่ ลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นเป็นกระบวนการสองขั้นตอนในการจัดลำดับโดยที่จีโนมแตกเป็นชิ้นใหญ่ ในทางตรงกันข้าม การจัดลำดับปืนลูกซองทั้งจีโนมเป็นการจัดลำดับขั้นตอนเดียวโดยที่จีโนมถูกแบ่งออกเป็นชิ้นเล็กชิ้นน้อยและจัดลำดับโดยตรง ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างการจัดลำดับปืนลูกซองแบบลำดับชั้นและลำดับชั้นของจีโนมทั้งหมด นอกจากนี้ ลักษณะทางเทคนิคอาจแตกต่างกันระหว่างสองเทคนิค