ความแตกต่างระหว่างซีรีนและไทโรซีนรีคอมบิเนส

2024 ผู้เขียน: Alex Aldridge | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2023-12-17 13:51

ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างซีรีนและไทโรซีน recombinase คือในซีรีนรีคอมบิเนสซีรีนคือกรดอะมิโนนิวคลีโอฟิลิกที่ใช้โดยเอนไซม์เพื่อโจมตี DNA ในระหว่างการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์ในขณะที่ไทโรซีน recombinase ไทโรซีนเป็นกรดอะมิโนนิวคลีโอฟิลิกที่ใช้ โดยเอ็นไซม์เพื่อโจมตี DNA ในระหว่างการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์

การรวมตัวใหม่เฉพาะไซต์ (การรวมตัวเฉพาะไซต์แบบอนุรักษ์นิยม) เป็นเทคนิคการรวมตัวใหม่ทางพันธุกรรมที่การแลกเปลี่ยนสายดีเอ็นเอเกิดขึ้นระหว่างกลุ่มที่มีระดับความคล้ายคลึงของลำดับที่แน่นอน recombinase เฉพาะไซต์จะควบคุมกระบวนการรวมตัวใหม่เฉพาะไซต์เอนไซม์เหล่านี้ถูกจัดกลุ่มเป็นสองตระกูลเป็นตระกูลซีรีนรีคอมบิเนสและตระกูลไทโรซีนรีคอมบิเนส ชื่อนี้มาจากเรซิดิวของกรดอะมิโนนิวคลีโอฟิลิกที่อนุรักษ์ไว้ซึ่งมีอยู่ในรีคอมบิเนสสองประเภทข้างต้น ซึ่งใช้ในการโจมตี DNA และจะถูกเชื่อมโยงอย่างโควาเลนต์กับมันระหว่างการแลกเปลี่ยนสแตรนด์ในการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์

ซีรีนรีคอมบิเนสคืออะไร

ในวิธีการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์ ลำดับ DNA สั้น ๆ สองลำดับ ('ไซต์เป้าหมาย') จะถูกตัดที่จุดเฉพาะในทั้งสองเส้น และปลายที่ถูกตัดจะรวมเข้ากับพันธมิตรรายใหม่ เทคโนโลยีการรวมตัวใหม่เฉพาะไซต์เป็นเครื่องมือจีโนมในพันธุวิศวกรรมที่ขึ้นอยู่กับเอ็นไซม์รีคอมบิเนสเพื่อแทนที่ส่วนเป้าหมายของดีเอ็นเอ พบระบบการรวมตัวใหม่เฉพาะไซต์จำนวนมากเพื่อทำการจัดเรียง DNA ใหม่เหล่านี้เพื่อวัตถุประสงค์ที่แตกต่างกัน แต่เอนไซม์รีคอมบิเนสทั้งหมดนี้เป็นของสองตระกูล ซีรีนรีคอมบิเนสเป็นหนึ่งในนั้น พวกเขาสามารถไกล่เกลี่ยการจัดเรียงใหม่ของ DNA ได้ถึงสามประเภท: การรวม, การตัดตอนและการผกผัน

รูปที่ 01: Serine Recombinase

recombinase เฉพาะไซต์เช่น serine recombinase ทำการจัดเรียง DNA ใหม่โดยการจดจำและผูกมัดกับลำดับ DNA สั้น ๆ (ไซต์เป้าหมาย) ซึ่งพวกมันแยกกระดูกสันหลังของ DNA ต่อมามีการแลกเปลี่ยน DNA helice สองเส้นและเกิดการรวมตัวกันของสาย DNA อีกครั้ง ในซีรีนรีคอมบิเนส ซีรีนคือกรดอะมิโนที่เอนไซม์ใช้เพื่อโจมตีดีเอ็นเอในระหว่างการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์ ในระหว่างการแตกแยกของดีเอ็นเอ พันธะโปรตีน-ดีเอ็นเอจะเกิดขึ้นผ่านปฏิกิริยาทรานส์เอสเทอริฟิเคชัน พันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ถูกแทนที่ด้วยพันธะฟอสโฟเซอรีนระหว่างหมู่ 5’ฟอสเฟตที่ตำแหน่งการแตกแยกและหมู่ไฮดรอกซิลของสารตกค้างซีรีนที่อนุรักษ์ไว้ พันธะใหม่เก็บพลังงานที่ใช้ในการแยก DNA ไว้ที่ไซต์เป้าหมายพลังงานนี้ถูกใช้ในภายหลังเพื่อรวม DNA กับกลุ่มดีออกซีไรโบสไฮดรอกซิลที่สอดคล้องกันบนไซต์อื่น ตัวอย่างของซีรีนรีคอมบิเนสคือซีรีนรีโซลวาส/อินเวอร์เตสและอินทิเกรตซีรีน

Tyrosine Recombinase คืออะไร

Tyrosine recombinase เป็นเอนไซม์ประเภทอื่นที่ควบคุมการรวมตัวใหม่เฉพาะไซต์แบบอนุรักษ์นิยม ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ tyrosine recombinase ยังดำเนินการจัดเรียง DNA ใหม่ในลักษณะเดียวกันโดยการจดจำและผูกมัดกับลำดับ DNA สั้น ๆ (ตำแหน่งเป้าหมาย) ซึ่งพวกมันแยกกระดูกสันหลังของ DNA ต่อมามีการแลกเปลี่ยน DNA helices สองอันและการรวมตัวของ DNA strands

รูปที่ 02: Tyrosine Recombinase

แต่ใน tyrosine recombinase นั้น tyrosine เป็นกรดอะมิโนที่เอนไซม์ใช้เพื่อโจมตี DNA ในระหว่างการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์ลักษณะทั่วไปของคลาสนี้คือสารตกค้างของไทโรซีนที่เป็นนิวคลีโอฟิลิกที่อนุรักษ์ไว้ซึ่งโจมตีดีเอ็นเอ-ฟอสเฟต scissile เพื่อสร้างการเชื่อมโยง 3′-ฟอสโฟไทโรซีน Tyrosine recombinases (A1) และ tyrosine integrases (A2) เป็นกลุ่มเอนไซม์ที่โดดเด่นในตระกูลเอนไซม์ tyrosine recombinase

ความคล้ายคลึงกันระหว่างซีรีนและไทโรซีนรีคอมบิเนสคืออะไร

• พวกมันคือกลุ่มของเอนไซม์รีคอมบิเนส
• ทั้งสองควบคุมการรวมตัวใหม่เฉพาะไซต์
• พวกมันคือโปรตีน
• ปฏิกิริยาเคมีพื้นฐานเหมือนกันทั้งคู่
• ทั้งกระตุ้นปฏิกิริยาทรานส์เอสเทอริฟิเคชัน

ความแตกต่างระหว่างซีรีนและไทโรซีนรีคอมบิเนสคืออะไร

ในซีรีนรีคอมบิเนส ซีรีนคือกรดอะมิโนนิวคลีโอฟิลิกที่เอ็นไซม์ใช้เพื่อโจมตีดีเอ็นเอในระหว่างการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์ ในทางกลับกัน ใน tyrosine recombinase ไทโรซีนเป็นกรดอะมิโนนิวคลีโอฟิลิกที่เอนไซม์ใช้เพื่อโจมตี DNA ในระหว่างการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างซีรีนและไทโรซีนรีคอมบิเนส ลักษณะทั่วไปของซีรีนรีคอมบิเนสคือมันสร้างพันธะฟอสโฟเซอรีนกับดีเอ็นเอ ในขณะที่ไทโรซีนรีคอมบิเนสสร้างพันธะฟอสโฟไทโรซีนกับดีเอ็นเอในระหว่างกระบวนการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์

อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงความแตกต่างระหว่างซีรีนและไทโรซีนรีคอมบิเนสในรูปแบบตาราง

1. 

สรุป – ซีรีน vs ไทโรซีนรีคอมบิเนส

การรวมตัวกันใหม่อาจเกิดขึ้นระหว่างโมเลกุลที่คล้ายคลึงกันของ DNA เช่นเดียวกับการรวมตัวของ homologues หรือโมเลกุลที่แตกต่างกันเช่นเดียวกับการรวมตัวที่ไม่ใช่ homologues การรวมตัวใหม่เฉพาะไซต์เป็นประเภทของการรวมตัวใหม่ทางพันธุกรรมในที่ซึ่งการแลกเปลี่ยนสายดีเอ็นเอเกิดขึ้นระหว่างส่วนต่างๆ ที่มีระดับความคล้ายคลึงของลำดับอย่างน้อยระดับหนึ่งมันถูกเร่งโดย recombinases รีคอมบิเนสส่วนใหญ่แบ่งออกเป็นสองตระกูล: ซีรีนรีคอมบิเนสและไทโรซีนรีคอมบิเนส Serine recombinase ใช้ซีรีนเป็นกรดอะมิโนนิวคลีโอฟิลิกเพื่อโจมตี DNA ในระหว่างกระบวนการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์ Tyrosine recombinase ใช้ไทโรซีนเป็นกรดอะมิโนนิวคลีโอฟิลิกเพื่อโจมตี DNA ในระหว่างกระบวนการรวมตัวกันใหม่เฉพาะไซต์ ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างซีรีนและไทโรซีน recombinase