ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างลำดับ Shine Dalgarno และ Kozak คือลำดับ Shine Dalgarno เป็นไซต์ที่มีผลผูกพันไรโบโซมใน RNA สารส่งสารจากแบคทีเรียและอาร์เอ็นเอ ในขณะที่ลำดับ Kozak เป็นไซต์เริ่มต้นการแปลโปรตีนใน RNA ของผู้ส่งสารยูคาริโอตส่วนใหญ่
Shine Dalgarno และ Kozak sequence เป็นลำดับฉันทามติสองลำดับที่มีความสำคัญมากสำหรับการเริ่มต้นการแปล ในอณูชีววิทยา การแปลเป็นกระบวนการที่ไรโบโซมในไซโตพลาสซึมสังเคราะห์โปรตีนหลังจากกระบวนการถอดรหัส ในการแปล mRNA (เมสเซนเจอร์ RNA) ถูกถอดรหัสในไรโบโซมเพื่อผลิตสายกรดอะมิโนจำเพาะภายนอกนิวเคลียสโดยปกติ ไรโบโซมกระตุ้นกระบวนการถอดรหัสโดยอำนวยความสะดวกในการจับของลำดับแอนติโคดอน tRNA เสริมกับโคดอน mRNA การแปลดำเนินการในสามขั้นตอน: การเริ่มต้น การยืด และการสิ้นสุด
Shine Dalgarno Sequence คืออะไร
Shine Dalgarno sequence เป็นไซต์ที่มีผลผูกพันไรโบโซมในอาร์เอ็นเอของแบคทีเรียและอาร์เอ็นเอ โดยทั่วไปจะตั้งอยู่ประมาณ 8 ฐานต้นน้ำของ codon เริ่มต้น AUG ลำดับ RNA นี้ช่วยในการคัดเลือกไรโบโซมไปยัง RNA ของผู้ส่งสารโดยการจัดตำแหน่งไรโบโซมกับโคดอนเริ่มต้น mRNA ดังนั้นจึงเริ่มการสังเคราะห์โปรตีน หลังจากการจัดหา tRNA สามารถเพิ่มกรดอะมิโนตามลำดับที่กำหนดโดยโคดอน mRNA ลำดับพิเศษนี้พบได้บ่อยในแบคทีเรีย แต่หายากกว่าในอาร์เคีย นอกจากนี้ยังมีอยู่ในคลอโรพลาสต์และทรานสคริปต์ของไมโตคอนเดรีย ลำดับ Shine Dalgarno ได้รับการเสนอครั้งแรกโดยนักวิทยาศาสตร์ชาวออสเตรเลีย John Shine และ Lynn Dalgarno ลำดับฉันทามติพื้นฐานหกลำดับคือ AGGAGG ตัวอย่างเช่น ใน Escherichia coli ลำดับคือ AGGAGGU
รูปที่ 01: Shine Dalgarno Sequence
การเลือกไซต์เริ่มต้น (AUG) ขึ้นอยู่กับการทำงานร่วมกันระหว่างหน่วยย่อย 30S ของไรโบโซมและเทมเพลต mRNA บริเวณที่อุดมด้วยไพริมิดีนบนส่วนประกอบ 16srRNA ของหน่วยย่อย 30S ผูกกับบริเวณที่อุดมด้วยพิวรีนที่เรียกว่าลำดับ Shine Dalgarno ต้นน้ำของ codon การเริ่มต้น AUG ใน mRNA นอกจากนี้ ในระหว่างการก่อตัวของสารเชิงซ้อนการเริ่มต้น ลำดับนิวคลีโอไทด์เสริมเหล่านี้จับคู่กันเพื่อสร้างโครงสร้างอาร์เอ็นเอที่มีสายคู่ สิ่งนี้อำนวยความสะดวกในการจับ mRNA กับไรโบโซมในลักษณะที่ codon เริ่มต้นถูกวางที่ไซต์ P ของไรโบโซม
Kozak Sequence คืออะไร
ลำดับ Kozak เป็นไซต์เริ่มต้นการแปลโปรตีนใน mRNA ของยูคาริโอตส่วนใหญ่ลำดับนี้เรียกอีกอย่างว่าลำดับฉันทามติของ Kozak ลำดับ Kozak เป็นลำดับที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการเริ่มต้นการแปลในยูคาริโอต ลำดับนี้เป็นลักษณะสำคัญของการควบคุมโปรตีน นอกจากนี้ยังเป็นสิ่งสำคัญมากสำหรับสุขภาพเซลล์โดยรวม ช่วยแก้ไขการแปลโปรตีนจากข้อความทางพันธุกรรมโดยการไกล่เกลี่ยการประกอบไรโบโซมและการเริ่มต้นการแปล
รูปที่ 02: Kozak Sequence
ลำดับนี้ตั้งชื่อตามนักวิทยาศาสตร์ที่ค้นพบ Marilyn Kozak เธอค้นพบมันผ่านการวิเคราะห์โดยละเอียดของลำดับจีโนมของดีเอ็นเอ ลำดับ Kozak คือ 5' (gcc) gccRccAUGG-3' ตัวอักษรตัวพิมพ์ใหญ่หมายถึงฐานที่สงวนไว้ ในขณะที่ตัวอักษรตัวพิมพ์เล็กหมายถึงฐานตัวแปรทั่วไป R หมายถึง purine (adenine หรือ guanine) ที่อยู่ในตำแหน่งนี้เสมอ
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง Shine Dalgarno และ Kozak Sequence คืออะไร
- Shine Dalgarno และ Kozak sequence เป็นลำดับฉันทามติสองลำดับที่มีความสำคัญมากในการเริ่มต้นการแปล
- ทั้งสองเป็นลำดับอาร์เอ็นเอ
- หน่วยย่อยที่เล็กกว่าของไรโบโซมจับกับทั้งสองซีเควนซ์
- ทั้งสองซีเควนซ์เป็นสื่อกลางในการประกอบไรโบโซมที่เหมาะสมและการเริ่มต้นการแปล
- เป็นส่วนสำคัญของการควบคุมโปรตีนและสุขภาพเซลล์โดยรวม
ความแตกต่างระหว่าง Shine Dalgarno และ Kozak Sequence คืออะไร
Shine Dalgarno sequence เป็นไซต์ที่มีผลผูกพันไรโบโซมที่พบใน RNA ของแบคทีเรียและอาร์เอ็นเอในขณะที่ลำดับ Kozak เป็นไซต์เริ่มต้นการแปลโปรตีนที่พบใน RNA ของผู้ส่งสารยูคาริโอตส่วนใหญ่ นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างลำดับ Shine Dalgarno และ Kozak นอกจากนี้ ลำดับ Shine Dalgarno คือ 5’AGGAGGU3’ ในขณะที่ลำดับ Kozak คือ 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’
อินโฟกราฟิกต่อไปนี้แสดงความแตกต่างระหว่างลำดับ Shine Dalgarno และ Kozak ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
Shine Dalgarno และ Kozak sequences เป็นลำดับ RNA ที่สอดคล้องกันสองลำดับที่มีความสำคัญมากสำหรับการประกอบไรโบโซมและการเริ่มต้นการแปล ลำดับของ Shine Dalgarno เป็นไซต์ที่มีผลผูกพันไรโบโซมใน RNA สารส่งสารจากแบคทีเรียและอาร์เอ็นเอ ในขณะที่ลำดับ Kozak เป็นไซต์เริ่มต้นการแปลโปรตีนใน RNA ของผู้ส่งสารยูคาริโอตส่วนใหญ่ ดังนั้น นี่จึงสรุปความแตกต่างระหว่างลำดับ Shine Dalgarno และ Kozak
