ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง LTR และ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR คือ LTR retrotransposons เป็นประเภทของ retrotransposons ที่มีการทำซ้ำของ terminal ยาวในโครงสร้างของพวกเขา ในขณะที่ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR เป็นประเภทของ retrotransposons ที่ไม่มีการทำซ้ำของ terminal ยาว ในโครงสร้าง
Retrotransposons (องค์ประกอบ transposable คลาส I หรือ transposons ผ่านตัวกลาง RNA) เป็นองค์ประกอบทางพันธุกรรมประเภทหนึ่งที่สามารถคัดลอกและวางตัวเองในตำแหน่งจีโนมต่างๆ พวกเขาดำเนินการนี้โดยการแปลง RNA กลับเป็น DNA ผ่านกระบวนการที่เรียกว่าการถอดรหัสแบบย้อนกลับโดยใช้ตัวกลางการขนย้าย RNAretrotransposons มีสองประเภทหลักเช่น LTR และ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR
LTR Retrotransposons คืออะไร
LTR รีโทรทรานสโปซอนคือประเภทของรีโทรทรานสโปซอนที่มีขั้วต่อยาวซ้ำในโครงสร้าง สามารถพบ DNA ซ้ำๆ กันที่ปลายแต่ละด้านของ LTR retrotransposon สิ่งเหล่านี้เรียกว่าการทำซ้ำขั้วยาว (LTR) LTR แต่ละ LTR มีความยาวสองสามร้อยคู่เบส LTR retrotransposons มักจะยาวกว่า 5 กิโลเบส นอกจากนี้ ระหว่างการเกิดซ้ำของขั้วยาว มียีนที่สามารถถอดความได้เทียบเท่ากับยีน retrovirus gag และ pol ยีนเหล่านี้ทับซ้อนกันเพื่อให้เข้ารหัสโปรตีเอสซึ่งปกติแล้วจะประมวลผลการถอดเสียงที่เป็นผลลัพธ์เป็นผลิตภัณฑ์ยีนที่ใช้งานได้
รูปที่ 01: LTR Retrotransposons
ยีน Gag ของ retrotransposons ทำให้ผลิตภัณฑ์ที่เชื่อมโยงกับการถอดรหัส retrotransposons อื่น ๆ เพื่อสร้างอนุภาคคล้ายไวรัส ยีน Pol สร้างผลิตภัณฑ์ที่มีเอ็นไซม์ เช่น รีเวิร์สทรานสคริปต์เทส อินทีกราส และโดเมน ribonuclease H เอนไซม์ reverse transcriptase ดำเนินการถอดรหัสย้อนกลับของ DNA retrotransposon เอนไซม์ Integrase รวม DNA retrotransposon เข้ากับ DNA ของยูคาริโอตจีโนม โดเมน Ribonuclease H มีประโยชน์ในการตัดพันธะฟอสโฟไดสเตอร์ระหว่างตัวกลาง RNA LTR retrotransposons ยังเข้ารหัสทรานสคริปท์ด้วยไซต์ที่มีผลผูกพัน tRNA เพื่อให้สามารถรับการถอดรหัสแบบย้อนกลับได้ค่อนข้างง่าย นอกจากนี้ เนื่องจาก retrotransposon มีข้อมูลจีโนมของยูคาริโอต จึงสามารถแทรกสำเนาของตัวเองลงในตำแหน่งจีโนมอื่นๆ ภายในเซลล์ยูคาริโอตได้
Retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR คืออะไร
ทรานสโพซอนที่ไม่ใช่ LTR เป็นรีโทรทรานส์โพซอนประเภทหนึ่งที่ไม่มีขั้วต่อยาวซ้ำในโครงสร้างเช่นเดียวกับ LTR รีโทรทรานส์โพซอน รีโทรทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR ยังมียีนสำหรับรีเวิร์สทรานสคริปเทส, โปรตีนการจับอาร์เอ็นเอ, นิวคลีเอส และบางครั้งโดเมนไรโบนิวคลีเอส H แต่พวกเขาขาดขั้วยาวซ้ำ แต่พวกมันมีการทำซ้ำสั้น ๆ ที่สามารถมีลำดับฐานที่อยู่ติดกันได้ โปรตีนที่จับกับ RNA จะจับกับ RNA transposition ระดับกลาง และนิวคลีเอสจะทำลายพันธะฟอสโฟไดสเตอร์ระหว่างนิวคลีโอไทด์ในกรดนิวคลีอิก
รูปที่ 02: LTR และ Non-LTR Retrotransposons
แม้ว่าพวกมันจะเป็นเรโทรทรานส์โพซอน แต่ก็ไม่สามารถทำการถอดรหัสแบบย้อนกลับโดยใช้ RNA ตัวกลางในลักษณะเดียวกับ LTR เรโทรทรานส์โปซอน นี่เป็นเพราะว่าเรโทรทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR ไม่มีลำดับที่ผูกกับ tRNA ดังนั้น รีโทรทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR ถูกถอดความไปเป็น mRNA และแปลเป็นโปรตีนทำหน้าที่เป็น reverse transcriptaseReverse transcriptase สร้างสำเนา DNA ของ RNA ของ retrotransposon ที่ไม่ใช่ LTR ซึ่งสามารถรวมเข้ากับจีโนมที่ไซต์ใหม่ได้ นอกจากนี้ ทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR ยังแบ่งออกเป็นสองประเภท: LINEs (องค์ประกอบนิวเคลียร์แบบกระจายยาว) และ SINE (องค์ประกอบนิวเคลียร์แบบกระจายสั้น)
ความคล้ายคลึงกันระหว่าง LTR และ Retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR คืออะไร
- LTR และ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR เป็นสองประเภทหลักของ retrotransposons
- ทั้งสองประเภทมียีนสำหรับเอนไซม์ เช่น รีเวิร์สทรานสคริปต์เทส โปรตีนที่จับกับอาร์เอ็นเอ นิวคลีเอส และโดเมน ribonuclease H
- สามารถพบได้ในจีโนมมนุษย์
- ทั้งสองประเภทมีความสำคัญวิวัฒนาการ
ความแตกต่างระหว่าง LTR และ Non-LTR Retrotransposons คืออะไร
LTR retrotransposons มีขั้วยาวซ้ำในโครงสร้าง ในขณะที่ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR จะขาดการทำซ้ำของขั้วยาวในโครงสร้างดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างรีโทรทรานส์โพซอน LTR และไม่ใช่ LTR นอกจากนี้ LTR รีโทรทรานส์โพซอนยังมีการทำซ้ำโดยตรงเป็นเวลานานซึ่งเป็นเพียงหนึ่งลำดับของเบสที่ทำซ้ำตัวเอง ในทางกลับกัน ทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR มีการทำซ้ำแบบสั้นที่สามารถมีลำดับเบสกลับด้านได้
อินโฟกราฟิกด้านล่างแสดงความแตกต่างระหว่างรีโทรทรานส์โพซอน LTR และไม่ใช่ LTR ในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน
สรุป – LTR vs Non-LTR Retrotransposons
LTR และ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR เป็น retrotransposons สองประเภทหลัก รีโทรทรานส์โพซอน LTR มีรีพีทเทอร์มินอลยาวในโครงสร้าง ขณะที่รีโทรทรานส์โพซอนที่ไม่ใช่ LTR จะไม่มีรีพีทเทอร์มินอลยาวในโครงสร้าง ดังนั้น นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง LTR และ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR
