ความแตกต่างระหว่างไซลีนไซยานอลและโบรโมฟีนอลบลู

2024 ผู้เขียน: Alex Aldridge | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2023-12-17 13:51

ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างไซลีนไซยานอลและโบรโมฟีนอลบลูคือในเจลอะกาโรส 1% ไซยานอลจะย้ายช้าลง ในขณะที่โบรโมฟีนอลสีน้ำเงินจะย้ายเร็วขึ้น

Xylene cyanol และ bromophenol blue มีความสำคัญเนื่องจากเป็นสีที่ใช้ตรวจสอบกระบวนการของ agarose gel electrophoresis และ polyacrylamide gel electrophoresis

ไซลีนไซยาอลคืออะไร

Xylene cyanol เป็นเครื่องหมายสีอิเล็กโทรโฟเรติกหรือสีย้อมติด มีประโยชน์ในการตรวจสอบกระบวนการของอิเล็กโตรโฟรีซิสเจลอากาโรสและอิเล็กโตรโฟรีซิสเจลโพลีอะคริลาไมด์ เมื่อสารนี้ผสมกับตัวอย่าง ความเข้มข้นของสารนี้โดยทั่วไปจะอยู่ที่ประมาณ 0005% ถึง 0.03% คำพ้องความหมายบางคำที่เราใช้สำหรับไซลีนอล ได้แก่ Acid Blue 147, xylene cyanole, xylene cyanol FF, xylene cyanole FF เป็นต้น

สูตรเคมีของสารประกอบนี้คือ C₂₅H₂₇N₂NaO 6_S2 _{มวลโมลของไซลีนไซยานอลคือ 538.61 ก./โมล สารนี้สามารถเคลื่อนที่ได้ในอัตราประมาณ 4 – 5 กิโลเบสคู่ DNA Fragment ในเจล agarose 1% อย่างไรก็ตาม ขึ้นอยู่กับบัฟเฟอร์ที่เราใช้ โดยทั่วไป ไซลีน ไซยาอลบนเจลโพลีอะคริลาไมด์ 6% สามารถย้ายที่ความเร็วประมาณ 140 ชิ้นส่วนดีเอ็นเอของคู่เบส ในทางกลับกัน มันสามารถโยกย้ายใน 20% denaturing polyacrylamide gel electrophoresis ในอัตรา 25 เบสโอลิโกนิวคลีโอไทด์}

จำนวนผู้บริจาคพันธะไฮโดรเจนของไซลีน ไซยาอลคือ 2m และจำนวนตัวรับพันธะไฮโดรเจนคือ 8 จำนวนพันธะที่หมุนได้ของสารประกอบนี้สามารถกำหนดได้เป็น 7 ความซับซ้อนของไซลีนไซยาอลสามารถอธิบายได้เป็น 1120 องศา มีการนับ stereocenter ของพันธบัตรที่กำหนดไว้ที่ 1.

โบรโมฟีนอลบลูคืออะไร

โบรโมฟีนอลสีน้ำเงินเป็นตัวบ่งชี้ค่า pH ที่มีประโยชน์ซึ่งมีประโยชน์ในฐานะเครื่องหมายสีอิเล็กโทรโฟเรติกและสีย้อม มีชื่อทางเคมีว่า 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB สูตรทางเคมีของสารประกอบนี้คือ C₁₉H₁₀Br₄O_{5 ส. มวลโมลาร์ของสารประกอบนี้คือ 669.96 ก./โมล ไม่มีกลิ่นและสามารถให้ความหนาแน่นเป็น 2.2 ก./มล. มีจุดหลอมเหลว 273 องศาเซลเซียส และจุดเดือด 279 องศาเซลเซียส เราสามารถเตรียมได้โดยค่อยๆ เติมโบรมีนส่วนเกินลงในสารละลายร้อนของฟีนอลซัลฟอนฟทาลีนในกรดอะซิติกน้ำแข็ง}

โบรโมฟีนอลสีน้ำเงินมีประโยชน์ในฐานะตัวบ่งชี้ความเป็นกรด-เบสในช่วง pH 3.0 ถึง 4.6 สามารถเปลี่ยนจากสีเหลืองได้ที่ pH 3.0 เป็น pH 4.6 นอกจากนี้ยังเป็นปฏิกิริยาย้อนกลับได้ โครงสร้างโบรโมฟีนอลสีน้ำเงินคล้ายกับฟีนอฟทาลีน

นอกจากนี้ เรายังสามารถใช้เป็นเครื่องหมายสีเพื่อตรวจสอบกระบวนการของอิเล็กโตรโฟรีซิสเจลอากาโรสและอิเล็กโตรโฟรีซิสเจลโพลีอะคริลาไมด์ สารนี้มีประจุลบที่ pH ปานกลาง ซึ่งสามารถเคลื่อนตัวไปในทิศทางเดียวกับ DNA หรือโปรตีนในเจล อัตราการย้ายอาจแตกต่างกันไปตามความหนาแน่นของเจลและองค์ประกอบของบัฟเฟอร์ อย่างไรก็ตาม ในเจลอะกาโรส 1% ทั่วไปในบัฟเฟอร์ TAE 1 ครั้งหรือบัฟเฟอร์ TBE สารนี้จะย้ายในอัตราเดียวกับชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่มีคู่เบสประมาณ 300 คู่

ความแตกต่างระหว่างไซลีนไซยานอลและโบรโมฟีนอลบลูต่างกันอย่างไร

Xylene cyanol และ bromophenol blue เป็นเครื่องหมายสีที่สำคัญ ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง xylene cyanol และ bromophenol blue คือใน agarose gel 1% xylene cyanol จะโยกย้ายช้าลง ในขณะที่ bromophenol blue จะโยกย้ายเร็วขึ้น

ด้านล่างคือบทสรุปของความแตกต่างระหว่างไซลีนไซยานอลและโบรโมฟีนอลสีน้ำเงินในรูปแบบตารางสำหรับการเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน

สรุป – Xylene Cyanol vs Bromophenol Blue

Xylene cyanol และ bromophenol blue มีความสำคัญเนื่องจากสีที่ใช้ตรวจสอบกระบวนการของ agarose gel electrophoresis และ polyacrylamide gel electrophoresis ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง xylene cyanol และ bromophenol blue คือในเจล agarose 1% xylene cyanol จะโยกย้ายช้าลงในขณะที่ bromophenol blue โยกย้ายเร็วขึ้น